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内蒙古包头地区猪戊型肝炎病毒的流行特征及其ORF2分子特征分析
1
作者
王树鹏
方苓
+3 位作者
任可
刘锦龙
张宇
白慧敏
《中国预防兽医学报》
CSCD
北大核心
2024年第12期1293-1297,共5页
为调查内蒙古包头地区猪戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,并分析其基因特征,本研究从内蒙古包头周边地区共收集猪血清样品186份经ELISA方法检测其HEV IgG抗体;收集猪粪便样品96份提取总RNA,经套式PCR检测HEV ORF2基因,测序后采用MEGA11.0...
为调查内蒙古包头地区猪戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,并分析其基因特征,本研究从内蒙古包头周边地区共收集猪血清样品186份经ELISA方法检测其HEV IgG抗体;收集猪粪便样品96份提取总RNA,经套式PCR检测HEV ORF2基因,测序后采用MEGA11.0构建进化树。结果显示,猪血清样品中HEV IgG抗体的总阳性率高达78.49%(146/186);猪粪便样品检测到2份HEV阳性样品,经克隆ORF2部分基因并测序后推导分析氨基酸序列,结果显示2份HEV阳性样品所属HEV基因型为Genotype 4,氨基酸序列分析首次检测到HEV ORF2氨基酸突变位点E^(276)G;HEV ORF2编码病毒衣壳蛋白,包含S(Shell)、M(Middle)和P(Protruding)3个结构域,ColabFold预测结果显示,S结构域的E^(276)G突变可能导致HEV ORF2与受体结合的P结构域的折叠发生约90°偏转。上述结果表明内蒙古包头地区猪群中存在HEV的流行,且感染情况很普遍、感染率较高,主要流行株为HEV Genotype 4,小型饲养场中感染率较饲养散户的感染率更高;2份粪便阳性样品均来自同一养殖场可证明该养殖场正处于HEV感染期;新发现的E^(276)G突变可使HEV ORF2 P结构域折叠发生改变,是否导致HEV抗原性改变仍需进一步探究。本研究揭示了内蒙古包头地区圈养猪群中HEV的感染特征,并首次发现其ORF2 E^(276)G突变对其受体结合区(P区)结构存在潜在影响,为HEV的人兽共患防控和机制研究提供新的依据。
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关键词
戊型肝炎病毒
感染与流行
蛋白质结构预测
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题名
内蒙古包头地区猪戊型肝炎病毒的流行特征及其ORF2分子特征分析
1
作者
王树鹏
方苓
任可
刘锦龙
张宇
白慧敏
机构
内蒙古
科技大学
包头
医学院基础医学与法医学院
广东省
疾病预防控制中心
病原微生物检验所
内蒙古包头市昆都仑区疾病预防控制中心
出处
《中国预防兽医学报》
CSCD
北大核心
2024年第12期1293-1297,共5页
基金
内蒙古自然科学基金(2021MS08059)
2022年度内蒙古自治区留学人员创新创业启动支持项目(HEV嵌合疫苗设计及其ORF3疫苗免疫协同作用的研究)。
文摘
为调查内蒙古包头地区猪戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,并分析其基因特征,本研究从内蒙古包头周边地区共收集猪血清样品186份经ELISA方法检测其HEV IgG抗体;收集猪粪便样品96份提取总RNA,经套式PCR检测HEV ORF2基因,测序后采用MEGA11.0构建进化树。结果显示,猪血清样品中HEV IgG抗体的总阳性率高达78.49%(146/186);猪粪便样品检测到2份HEV阳性样品,经克隆ORF2部分基因并测序后推导分析氨基酸序列,结果显示2份HEV阳性样品所属HEV基因型为Genotype 4,氨基酸序列分析首次检测到HEV ORF2氨基酸突变位点E^(276)G;HEV ORF2编码病毒衣壳蛋白,包含S(Shell)、M(Middle)和P(Protruding)3个结构域,ColabFold预测结果显示,S结构域的E^(276)G突变可能导致HEV ORF2与受体结合的P结构域的折叠发生约90°偏转。上述结果表明内蒙古包头地区猪群中存在HEV的流行,且感染情况很普遍、感染率较高,主要流行株为HEV Genotype 4,小型饲养场中感染率较饲养散户的感染率更高;2份粪便阳性样品均来自同一养殖场可证明该养殖场正处于HEV感染期;新发现的E^(276)G突变可使HEV ORF2 P结构域折叠发生改变,是否导致HEV抗原性改变仍需进一步探究。本研究揭示了内蒙古包头地区圈养猪群中HEV的感染特征,并首次发现其ORF2 E^(276)G突变对其受体结合区(P区)结构存在潜在影响,为HEV的人兽共患防控和机制研究提供新的依据。
关键词
戊型肝炎病毒
感染与流行
蛋白质结构预测
Keywords
hepatitis E virus
infection and prevalence
protein structure prediction
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
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1
内蒙古包头地区猪戊型肝炎病毒的流行特征及其ORF2分子特征分析
王树鹏
方苓
任可
刘锦龙
张宇
白慧敏
《中国预防兽医学报》
CSCD
北大核心
2024
0
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