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水分胁迫柠条锦鸡儿叶片均一化全长cDNA文库的构建及EST分析
被引量：
5
1
作者
郭九峰
孙国琴
乔慧蕾
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2012年第3期67-71,共5页
柠条是包括内蒙古在内干旱荒漠草原上的优势建群植物,具有极强的耐旱(寒)力,为了研究其抗逆机理,挖掘和利用其抗旱基因,用Trizol法从经过干旱处理的柠条当年新生幼嫩枝叶中提取总RNA,分离纯化mRNA,采用SMART技术反转录合成双链cDNA,DSN...
柠条是包括内蒙古在内干旱荒漠草原上的优势建群植物,具有极强的耐旱(寒)力,为了研究其抗逆机理,挖掘和利用其抗旱基因,用Trizol法从经过干旱处理的柠条当年新生幼嫩枝叶中提取总RNA,分离纯化mRNA,采用SMART技术反转录合成双链cDNA,DSN技术进行均一化,构建了柠条全长cDNA文库。经检验,文库的滴度为1.5×106 cfu/mL,重组率为93.75%,90%以上插入片段的长度为1.0～2.0 kb。从文库中随机挑取3200个克隆进行5'测序,得到3020个有效EST,合成2429个unigenes,其中,singlets 2229条,占总有效序列的91.76%,经与数据库比对,发现了脱水素、抗旱相关转录因子等多个抗旱相关基因。
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关键词
柠条锦鸡儿
干旱处理
均一化全长cDNA文库
EST分析
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职称材料
题名
水分胁迫柠条锦鸡儿叶片均一化全长cDNA文库的构建及EST分析
被引量：
5
1
作者
郭九峰
孙国琴
乔慧蕾
机构
内蒙古
大学离子束
生物
工程
自治区
重点实验室
内蒙古农牧业科学院自治区农作物生物技术育种中心
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2012年第3期67-71,共5页
基金
内蒙古农牧业科学院创新基金(2007CXJJN03)
文摘
柠条是包括内蒙古在内干旱荒漠草原上的优势建群植物,具有极强的耐旱(寒)力,为了研究其抗逆机理,挖掘和利用其抗旱基因,用Trizol法从经过干旱处理的柠条当年新生幼嫩枝叶中提取总RNA,分离纯化mRNA,采用SMART技术反转录合成双链cDNA,DSN技术进行均一化,构建了柠条全长cDNA文库。经检验,文库的滴度为1.5×106 cfu/mL,重组率为93.75%,90%以上插入片段的长度为1.0～2.0 kb。从文库中随机挑取3200个克隆进行5'测序,得到3020个有效EST,合成2429个unigenes,其中,singlets 2229条,占总有效序列的91.76%,经与数据库比对,发现了脱水素、抗旱相关转录因子等多个抗旱相关基因。
关键词
柠条锦鸡儿
干旱处理
均一化全长cDNA文库
EST分析
Keywords
Korshinsk peashrub； Water stress； Normalized full-length cDNA library； EST analysis；
分类号
S793.3 [农业科学—林木遗传育种]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水分胁迫柠条锦鸡儿叶片均一化全长cDNA文库的构建及EST分析
郭九峰
孙国琴
乔慧蕾
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2012
5
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