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基于全基因组测序的蒙古马运动相关的正向选择基因筛选
1
作者
潘静
吴凯峰
+1 位作者
周欢敏
张焱如
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期1985-1996,共12页
旨在从基因组水平对蒙古马运动性状涉及的相关基因进行分析。本研究利用全基因组测序技术,对蒙古马的血液进行采样和基因组测序,并且结合人、牛、小鼠等7种哺乳动物的基因组数据,对蒙古马的特有基因和正向选择基因进行筛选。分析数据得...
旨在从基因组水平对蒙古马运动性状涉及的相关基因进行分析。本研究利用全基因组测序技术,对蒙古马的血液进行采样和基因组测序,并且结合人、牛、小鼠等7种哺乳动物的基因组数据,对蒙古马的特有基因和正向选择基因进行筛选。分析数据得到已注释的蛋白编码基因19475种,并筛选出了38种蒙古马特有基因和45种正向选择基因。根据GO富集、KEGG通路富集分析和前人研究,发现包括MAPK13、CCN2、FSCN3、BTG1、TF等17种正向选择的蛋白编码基因可能参与蒙古马的运动过程。这些运动相关正向选择基因的生物学功能涉及到肌动蛋白丝结构、心肌收缩的正调节、钙离子结合、调节细胞内pH、血管生成、胶原生物合成过程的正调节等。而7种miRNAs(包括eca-miR-302c、eca-miR-8974、eca-miR-9077等)则通过与mRNA的3′UTR区域作用分别潜在靶向调控运动相关的MAPK13、LOC100057755、EHD4、MICAL3、TMBIM1和F11R。以上涉及的运动相关正向选择的蛋白编码基因可以促进人们对于蒙古马运动性状的了解,并为靶向竞技型的家畜育种提供分子理论基础。
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关键词
蒙古马
运动性状
全基因组测序
正向选择
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职称材料
题名
基于全基因组测序的蒙古马运动相关的正向选择基因筛选
1
作者
潘静
吴凯峰
周欢敏
张焱如
机构
内蒙古农业大学生命科学学院内蒙古生物制造重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期1985-1996,共12页
基金
国家自然科学基金(31560621)
文摘
旨在从基因组水平对蒙古马运动性状涉及的相关基因进行分析。本研究利用全基因组测序技术,对蒙古马的血液进行采样和基因组测序,并且结合人、牛、小鼠等7种哺乳动物的基因组数据,对蒙古马的特有基因和正向选择基因进行筛选。分析数据得到已注释的蛋白编码基因19475种,并筛选出了38种蒙古马特有基因和45种正向选择基因。根据GO富集、KEGG通路富集分析和前人研究,发现包括MAPK13、CCN2、FSCN3、BTG1、TF等17种正向选择的蛋白编码基因可能参与蒙古马的运动过程。这些运动相关正向选择基因的生物学功能涉及到肌动蛋白丝结构、心肌收缩的正调节、钙离子结合、调节细胞内pH、血管生成、胶原生物合成过程的正调节等。而7种miRNAs(包括eca-miR-302c、eca-miR-8974、eca-miR-9077等)则通过与mRNA的3′UTR区域作用分别潜在靶向调控运动相关的MAPK13、LOC100057755、EHD4、MICAL3、TMBIM1和F11R。以上涉及的运动相关正向选择的蛋白编码基因可以促进人们对于蒙古马运动性状的了解,并为靶向竞技型的家畜育种提供分子理论基础。
关键词
蒙古马
运动性状
全基因组测序
正向选择
Keywords
Mongolian horse
athletics character
whole-genome sequencing
positive selection
分类号
S821.2 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于全基因组测序的蒙古马运动相关的正向选择基因筛选
潘静
吴凯峰
周欢敏
张焱如
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
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