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2022—2024年中国部分地区牛病毒性腹泻病毒分子检测及基因分型
1
作者
安乐乐
任晓婷
+5 位作者
蓝秋菊
莫永利
曹小安
丁玉林
马忠仁
马晓霞
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第10期5328-5334,共7页
牛病毒性腹泻病毒(BVDV)是引起牛群中重要经济损失的病毒之一,尤其对幼牛的健康和发展造成了严重影响。本试验旨在建立通用型BVDV SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR(BVDV SYBR GreenⅠqPCR)方法并对中国部分地区散养牛群样本进行病原学检测...
牛病毒性腹泻病毒(BVDV)是引起牛群中重要经济损失的病毒之一,尤其对幼牛的健康和发展造成了严重影响。本试验旨在建立通用型BVDV SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR(BVDV SYBR GreenⅠqPCR)方法并对中国部分地区散养牛群样本进行病原学检测,掌握中国部分地区散养牛群BVDV感染情况、流行基因型及亚型。依据GenBank不同基因亚型BVDV 5′UTR序列建立通用型BVDV SYBR GreenⅠqPCR方法。使用该方法对2022年6月—2024年12月采集的712份散养牛血清样本及咳嗽、发烧、拉稀症状犊牛组织样本进行检测及遗传进化分析,同时对犊牛样本进行病毒分离、间接免疫荧光(IFA)鉴定和苏木精-伊红染色法(HE染色)观察。结果显示,建立的BVDV SYBR GreenⅠqPCR方法标准曲线的线性关系良好、敏感性高、特异性强和重复性好。散养牛血清样本阳性率为19.10%,并成功分离BVDV-24GS毒株。在5′UTR基因系统进化树分析中,BVDV基因亚型包括1c、1m、1o、1i、1q、1b和2。以上结果表明,成功建立通用型BVDV SYBR GreenⅠqPCR方法并实施初步检测,中国部分地区散养牛群中均存在不同程度BVDV感染,病毒基因分型鉴定丰富了BVDV的分子流行病学基础数据,为BVDV的科学防控、疫苗研制和免疫策略优化提供了依据。
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关键词
牛病毒性腹泻病毒
SYBR
GreenⅠ实时荧光定量PCR
分子检测
基因分型鉴定
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职称材料
BVDV-2d毒株的分离鉴定及同义密码子使用模式分析
2
作者
杨宣叶
高明阳
+5 位作者
胡欣妍
王进千
王慧慧
丁玉林
曹小安
马晓霞
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第11期2111-2121,共11页
本研究通过对腹泻犊牛肠道内容物中分离到的牛病毒性腹泻病毒(BVDV)毒株进行分析,首次确认该毒株为BVDV-2d亚型,命名为22-Gansu-F3。通过病毒分离、鉴定及全基因组测序,本研究不仅探讨了腹泻犊牛肠道的病理变化,还分析了其同义密码子使...
本研究通过对腹泻犊牛肠道内容物中分离到的牛病毒性腹泻病毒(BVDV)毒株进行分析,首次确认该毒株为BVDV-2d亚型,命名为22-Gansu-F3。通过病毒分离、鉴定及全基因组测序,本研究不仅探讨了腹泻犊牛肠道的病理变化,还分析了其同义密码子使用模式的遗传特征。结果表明,在开放阅读框中,CpG二核苷酸的使用频率显著降低,并且在选择同义密码子的过程中,精氨酸对含CpG同义密码子的使用具有显著抑制作用。为了进一步明确不同功能性蛋白质编码序列的同义密码子使用模式的遗传学特征,本研究比较了不同编码序列的同义密码子使用差异,发现N^(pro)和NS4A的编码区在同义密码子使用上与其他蛋白质显著不同。此外,BVDV-2d型22-Gansu-F3毒株的不同蛋白质编码区在适应猪、羊和骆驼的同义密码子使用模式上表现出良好的适应性,为这些动物体内病毒蛋白的翻译提供了潜在的物质基础。本研究结果为中国BVDV-2型的进化动态提供了新的理论依据,并为预防该亚型成为中国主要流行亚型提供了早期预警。
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关键词
牛病毒性腹泻病毒
BVDV-2d
病理变化
同义密码子
遗传
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职称材料
题名
2022—2024年中国部分地区牛病毒性腹泻病毒分子检测及基因分型
1
作者
安乐乐
任晓婷
蓝秋菊
莫永利
曹小安
丁玉林
马忠仁
马晓霞
机构
西北民族
大学
生物医学研究中心生物工程与
技术
国家民委
重点
实验室
西北民族
大学
生命科学与工程
学院
中国
农业
科
学院
兰州
兽医
研究所
动物
疫病防控全国
重点
实验室
内蒙古农业大学兽医学院动物疾病临床诊疗技术重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第10期5328-5334,共7页
基金
甘肃省自然科学基金(23JRRA715)
西北民族大学引进人才科研项目(xbmuyjrc202225)。
文摘
牛病毒性腹泻病毒(BVDV)是引起牛群中重要经济损失的病毒之一,尤其对幼牛的健康和发展造成了严重影响。本试验旨在建立通用型BVDV SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR(BVDV SYBR GreenⅠqPCR)方法并对中国部分地区散养牛群样本进行病原学检测,掌握中国部分地区散养牛群BVDV感染情况、流行基因型及亚型。依据GenBank不同基因亚型BVDV 5′UTR序列建立通用型BVDV SYBR GreenⅠqPCR方法。使用该方法对2022年6月—2024年12月采集的712份散养牛血清样本及咳嗽、发烧、拉稀症状犊牛组织样本进行检测及遗传进化分析,同时对犊牛样本进行病毒分离、间接免疫荧光(IFA)鉴定和苏木精-伊红染色法(HE染色)观察。结果显示,建立的BVDV SYBR GreenⅠqPCR方法标准曲线的线性关系良好、敏感性高、特异性强和重复性好。散养牛血清样本阳性率为19.10%,并成功分离BVDV-24GS毒株。在5′UTR基因系统进化树分析中,BVDV基因亚型包括1c、1m、1o、1i、1q、1b和2。以上结果表明,成功建立通用型BVDV SYBR GreenⅠqPCR方法并实施初步检测,中国部分地区散养牛群中均存在不同程度BVDV感染,病毒基因分型鉴定丰富了BVDV的分子流行病学基础数据,为BVDV的科学防控、疫苗研制和免疫策略优化提供了依据。
关键词
牛病毒性腹泻病毒
SYBR
GreenⅠ实时荧光定量PCR
分子检测
基因分型鉴定
Keywords
bovine viral diarrhea virus
SYBR Green I real-time quantitative PCR
molecular detection
genotype identification
分类号
S852.653 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
BVDV-2d毒株的分离鉴定及同义密码子使用模式分析
2
作者
杨宣叶
高明阳
胡欣妍
王进千
王慧慧
丁玉林
曹小安
马晓霞
机构
西北民族
大学
生物医学研究中心/生物工程与
技术
国家民委
重点
实验室
西北民族
大学
生命科学与工程
学院
中国
农业
科
学院
兰州
兽医
研究所
动物
疫病防控全国
重点
实验室
内蒙古农业大学兽医学院动物疾病临床诊疗技术重点实验室
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第11期2111-2121,共11页
基金
甘肃省自然科学基金项目(23JRRA715)。
文摘
本研究通过对腹泻犊牛肠道内容物中分离到的牛病毒性腹泻病毒(BVDV)毒株进行分析,首次确认该毒株为BVDV-2d亚型,命名为22-Gansu-F3。通过病毒分离、鉴定及全基因组测序,本研究不仅探讨了腹泻犊牛肠道的病理变化,还分析了其同义密码子使用模式的遗传特征。结果表明,在开放阅读框中,CpG二核苷酸的使用频率显著降低,并且在选择同义密码子的过程中,精氨酸对含CpG同义密码子的使用具有显著抑制作用。为了进一步明确不同功能性蛋白质编码序列的同义密码子使用模式的遗传学特征,本研究比较了不同编码序列的同义密码子使用差异,发现N^(pro)和NS4A的编码区在同义密码子使用上与其他蛋白质显著不同。此外,BVDV-2d型22-Gansu-F3毒株的不同蛋白质编码区在适应猪、羊和骆驼的同义密码子使用模式上表现出良好的适应性,为这些动物体内病毒蛋白的翻译提供了潜在的物质基础。本研究结果为中国BVDV-2型的进化动态提供了新的理论依据,并为预防该亚型成为中国主要流行亚型提供了早期预警。
关键词
牛病毒性腹泻病毒
BVDV-2d
病理变化
同义密码子
遗传
Keywords
bovine viral diarrhea virus
BVDV-2d
pathological change
synonymous codon
heredity
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2022—2024年中国部分地区牛病毒性腹泻病毒分子检测及基因分型
安乐乐
任晓婷
蓝秋菊
莫永利
曹小安
丁玉林
马忠仁
马晓霞
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
BVDV-2d毒株的分离鉴定及同义密码子使用模式分析
杨宣叶
高明阳
胡欣妍
王进千
王慧慧
丁玉林
曹小安
马晓霞
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024
0
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