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CXCL家族作为肝癌微环境预后与治疗标志物的生物信息学分析
被引量：
4
1
作者
马莉
杨文娟
+4 位作者
马青梅
马梦婷
张娇弟
张倩
刘欣跃
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期29-42,共14页
目的:探讨CXCL趋化因子家族作为肝癌治疗与预后标志物的价值。方法:检索UNIPROT、ONCOMINE、TCGA、GEPIA、TIMER数据库,分析肝癌中异常表达的CXCL因子类型。在KMPLOT网站分析CXCL与肝癌患者不良预后的相关性。使用R语言绘制热图并计算C...
目的:探讨CXCL趋化因子家族作为肝癌治疗与预后标志物的价值。方法:检索UNIPROT、ONCOMINE、TCGA、GEPIA、TIMER数据库,分析肝癌中异常表达的CXCL因子类型。在KMPLOT网站分析CXCL与肝癌患者不良预后的相关性。使用R语言绘制热图并计算CXCL家族与上皮间质转化(EMT)、免疫因子浸润的相关性。结果:CXCL6、CXCL8、CXCL9、CXCL10在肝癌组织中显著高表达,CXCL2、CXCL12、CXCL14在肝癌中显著低表达。高转录水平CXCL2、CXCL4、CXCL6、CXCL7、CXCL9、CXCL10、CXCL12、低转录水平CXCL6的肝癌患者有更长的生存期。CXCL8与肝癌EMT关系最为密切。CXCL2、CXCL4、CXCL6、CXCL7、CXCL9、CXCL10、CXCL11、CXCL12、CXCL14、CXCL16、CXCL17与常见的6种免疫细胞(B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞)浸润相关。结论:CXCL家族在肝癌组织中具有显著的差异表达,并与肝癌细胞的转移、免疫细胞浸润、预后相关,可作为肝癌临床治疗与预后的潜在标记物。
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关键词
肝癌
肿瘤标志物
免疫治疗
生物信息学分析
趋化因子
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题名
CXCL家族作为肝癌微环境预后与治疗标志物的生物信息学分析
被引量：
4
1
作者
马莉
杨文娟
马青梅
马梦婷
张娇弟
张倩
刘欣跃
机构
兰州大学第二医院药物基因组学重点实验室
兰州大学
第二
医院
检验医
学
中心
出处
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期29-42,共14页
基金
兰州大学第二医院“萃英科技创新”计划项目(CY2017-MS17)。
文摘
目的:探讨CXCL趋化因子家族作为肝癌治疗与预后标志物的价值。方法:检索UNIPROT、ONCOMINE、TCGA、GEPIA、TIMER数据库,分析肝癌中异常表达的CXCL因子类型。在KMPLOT网站分析CXCL与肝癌患者不良预后的相关性。使用R语言绘制热图并计算CXCL家族与上皮间质转化(EMT)、免疫因子浸润的相关性。结果:CXCL6、CXCL8、CXCL9、CXCL10在肝癌组织中显著高表达,CXCL2、CXCL12、CXCL14在肝癌中显著低表达。高转录水平CXCL2、CXCL4、CXCL6、CXCL7、CXCL9、CXCL10、CXCL12、低转录水平CXCL6的肝癌患者有更长的生存期。CXCL8与肝癌EMT关系最为密切。CXCL2、CXCL4、CXCL6、CXCL7、CXCL9、CXCL10、CXCL11、CXCL12、CXCL14、CXCL16、CXCL17与常见的6种免疫细胞(B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞)浸润相关。结论:CXCL家族在肝癌组织中具有显著的差异表达,并与肝癌细胞的转移、免疫细胞浸润、预后相关,可作为肝癌临床治疗与预后的潜在标记物。
关键词
肝癌
肿瘤标志物
免疫治疗
生物信息学分析
趋化因子
Keywords
liver cancer
tumor markers
immunotherapy
bioinformatics analysis
chemokines
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CXCL家族作为肝癌微环境预后与治疗标志物的生物信息学分析
马莉
杨文娟
马青梅
马梦婷
张娇弟
张倩
刘欣跃
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
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