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应用双向热循环消减SELEX技术筛选胃癌血清核酸适配体 被引量:3
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作者 翟蒙 张蕾 +6 位作者 袁红霞 田彩平 王维君 刘元强 马鸿远 陈聪盈 廖世奇 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1145-1154,共10页
胃癌是发病率及死亡率均较高的消化道恶性肿瘤之一,严重威胁人类的生命健康。血清肿瘤标志物的检测对提高早期胃癌的检出率,改善胃癌的治疗有重要的意义。核酸适配体以其灵敏度高、靶向性强等优势显示出了较强的临床适用性。本研究以双... 胃癌是发病率及死亡率均较高的消化道恶性肿瘤之一,严重威胁人类的生命健康。血清肿瘤标志物的检测对提高早期胃癌的检出率,改善胃癌的治疗有重要的意义。核酸适配体以其灵敏度高、靶向性强等优势显示出了较强的临床适用性。本研究以双向热循环消减指数富集式配基系统进化(systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技术为支持,纳米(琼脂)磁珠材料为载体,胃癌血清及正常人血清为筛选靶标,结合高通量测序技术建立了快速高效的核酸适配体筛选方法。经过19轮双向筛选,获得高重复率的胃癌血清特异性核酸适配体序列10条及正常人血清特异性核酸适配体序列8条。将这些序列分别混合并制成检测试剂A、B,结合实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)技术,对100份临床血清样本进行特异性验证。通过比较分析,建立了快速高效的胃癌血清检测技术。结果显示,核酸适配体G-AP1与N-AP1的二级结构类似于抗体的“Y”型,且呈茎环状。检测试剂A、B对胃癌及正常人血清的检出率分别为92%和88%。表明本技术可以较准确地筛选得到高特异性和强亲和力的核酸适配体,体现了核酸适配体作为新型肿瘤标志物在临床检测及治疗的应用潜力。 展开更多
关键词 指数富集式配基系统进化技术 胃癌血清 核酸适配体 纳米磁珠
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小鼠肝脏MicroRNA的提取与分离 被引量:1
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作者 庞鑫 马春林 +6 位作者 廖世奇 何科基 王怡云 王小琦 毛爱红 马瑾 陈桦 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1067-1072,共6页
本文对小鼠肝脏microRNA进行分离制备及相关性功能研究.采用poly(A)加尾方法,分离提取小鼠肝脏中的microRNA;利用T4 RNA连接酶,在microRNA两端加上连接引物,通过RT-PCR制备microRNA的cDNA文库;经过对cDNA文库的质粒连接,克隆测序获得mic... 本文对小鼠肝脏microRNA进行分离制备及相关性功能研究.采用poly(A)加尾方法,分离提取小鼠肝脏中的microRNA;利用T4 RNA连接酶,在microRNA两端加上连接引物,通过RT-PCR制备microRNA的cDNA文库;经过对cDNA文库的质粒连接,克隆测序获得microRNA.结果显示:获得4条有效序列,其中包括2条已知序列miR-122和2条未知小分子RNA序列.经查证,2条microRNA片段在miRBase库中未有记录,在二级结构分析中可形成茎环结构,符合microRNA的特征.BLAST比对显示:2个序列位于小鼠载脂蛋白B基因和小鼠28S核糖体RNA上,可能与基因调控有关,其功能有待进一步研究. 展开更多
关键词 微小RNA 小鼠肝脏 poly(A)加尾法 克隆测序
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