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题名六盘山鸡爪大黄叶绿体基因组特征分析
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作者
曾继娟
杨雪
姚宁
梁文裕
曹荣荣
王利霞
朱强
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机构
宁夏大学生命科学学院
林木资源高效生产全国重点实验室
六盘山林草局
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出处
《种子》
北大核心
2025年第4期136-142,共7页
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基金
宁夏回族自治区重点研发计划(重点)项目“六盘山特色濒危中药材资源保护与开发利用关键技术研究与示范”
“六盘山生物多样性调查项目”。
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文摘
六盘山鸡爪大黄(Rheum tanguticum var.liupanshanense)是唐古特大黄的变种,仅分布于宁夏六盘山地区,为该地区的特有植物。采用Illumina HiSeq X Ten测序系统对六盘山鸡爪大黄叶绿体基因组DNA建库测序,借助近缘参考序列,通过最大似然法基于叶绿体全基因组序列对大黄属、酸模属共15个物种构建系统发育树。结果表明,叶绿体基因组序列全长161144 bp,包括1个长单拷贝区(LSC)86500 bp、1个短单拷贝区(SSC)12732 bp和2个反向重复序列(IR)30956 bp。叶绿体基因组编码的基因总数为112种,其中包含79种蛋白编码基因、29个tRNA基因以及4个rRNA。检测到18种基因含有内含子,其中16种含有1个内含子,2种含有2个内含子。六盘山鸡爪大黄与掌叶大黄、药用大黄的亲缘关系最近。
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关键词
六盘山鸡爪大黄
叶绿体基因组
测序与分析
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Keywords
Rheum tanguticum var.liupanshanense
chloroplast genome
sequencing and analysis
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分类号
S567.239
[农业科学—中草药栽培]
Q943
[生物学—植物学]
Q949.36
[生物学—植物学]
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