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油茶CKX基因家族鉴定及表达分析
1
作者
乔新派
郝文乾
+6 位作者
叶希琛
魏子申
王文峰
付盼
赖勇
杨超臣
张党权
《河南农业大学学报》
北大核心
2025年第4期614-624,共11页
【目的】在油茶基因组范围内鉴定油茶CKX基因家族成员,并研究其在抗病过程中对该基因家族表达模式的影响,为进一步研究油茶CKX基因参与调控响应逆境的分子机制奠定基础。【方法】通过油茶全基因组数据对油茶CKX(CoCKX)基因家族成员进行...
【目的】在油茶基因组范围内鉴定油茶CKX基因家族成员,并研究其在抗病过程中对该基因家族表达模式的影响,为进一步研究油茶CKX基因参与调控响应逆境的分子机制奠定基础。【方法】通过油茶全基因组数据对油茶CKX(CoCKX)基因家族成员进行鉴定与分析,包括蛋白理化性质分析、系统进化树构建、基因结构分析、蛋白二级结构及三级结构分析、启动子顺式作用元件分析、共线性分析,并以炭疽菌对油茶叶片进行侵染,分析处理后12、24、48 d的油茶CKX基因家族的表达模式。【结果】CoCKX基因家族中共有7个成员,根据进化关系分为4个亚族;油茶共15条染色体,其中油茶CKX基因家族分布在5条染色体上;7个CoCKX基因家族成员均属于亲水性蛋白,主要定位于叶绿体中,且在结构上主要由α-螺旋和无规则卷曲组成;7个基因家族成员均有外显子和内含子,有2个成员无非编码区域(UTR),蛋白结构较为相似,基序一致;顺式作用元件表明,CoCKX基因家族启动子区域存在大量与光响应、水杨酸、茉莉酸甲酯响应及逆境响应等相关元件;共线性结果表明,CoCKX基因家族有1对串联重复基因;在油茶叶片抗病3个时期中7个基因表达量相较于健康植株有不同程度的上调,其中CoCKX1/2基因上调表达量较高,可较大程度地调控油茶在抗病过程中的响应机制。【结论】CoCKX基因家族成员功能上存在一定差异,基因结构在进化中有较高的保守性;在受到炭疽菌侵害过程中,CKX基因表达量上调,推测其具有调控叶片抵御炭疽菌的能力。
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关键词
油茶
CKX基因家族
抗病
基因表达
生物信息学
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职称材料
油茶炭疽病研究进展
被引量：
1
2
作者
付盼
陈锋
+4 位作者
夏建梅
吴金
杨超臣
余洁
桂世超
《河南林业科技》
2024年第4期55-58,61,共5页
油茶炭疽病是油茶产区的主要病害之一,严重影响我国油茶产业健康发展。综述了油茶炭疽病病原及形态特征、油茶炭疽病侵染特性和发病规律、油茶炭疽病防治技术、油茶炭疽病抗性育种和抗病基因研究,总结了油茶炭疽病研究上存在的问题,并...
油茶炭疽病是油茶产区的主要病害之一,严重影响我国油茶产业健康发展。综述了油茶炭疽病病原及形态特征、油茶炭疽病侵染特性和发病规律、油茶炭疽病防治技术、油茶炭疽病抗性育种和抗病基因研究,总结了油茶炭疽病研究上存在的问题,并展望了今后的研究方向,为油茶抗炭疽病良种选育及油茶产业发展提供参考。
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关键词
油茶
炭疽病
抗病育种
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职称材料
题名
油茶CKX基因家族鉴定及表达分析
1
作者
乔新派
郝文乾
叶希琛
魏子申
王文峰
付盼
赖勇
杨超臣
张党权
机构
河南农业大学林学院
国家
林业
和草原局管理干部学院
信阳市林业技术工作站
出处
《河南农业大学学报》
北大核心
2025年第4期614-624,共11页
基金
国家自然科学基金项目(32171835)
河南农业大学高层次人才专项支持基金项目(30501511)
国家林业和草原局管理干部学院重点项目(202308)。
文摘
【目的】在油茶基因组范围内鉴定油茶CKX基因家族成员,并研究其在抗病过程中对该基因家族表达模式的影响,为进一步研究油茶CKX基因参与调控响应逆境的分子机制奠定基础。【方法】通过油茶全基因组数据对油茶CKX(CoCKX)基因家族成员进行鉴定与分析,包括蛋白理化性质分析、系统进化树构建、基因结构分析、蛋白二级结构及三级结构分析、启动子顺式作用元件分析、共线性分析,并以炭疽菌对油茶叶片进行侵染,分析处理后12、24、48 d的油茶CKX基因家族的表达模式。【结果】CoCKX基因家族中共有7个成员,根据进化关系分为4个亚族;油茶共15条染色体,其中油茶CKX基因家族分布在5条染色体上;7个CoCKX基因家族成员均属于亲水性蛋白,主要定位于叶绿体中,且在结构上主要由α-螺旋和无规则卷曲组成;7个基因家族成员均有外显子和内含子,有2个成员无非编码区域(UTR),蛋白结构较为相似,基序一致;顺式作用元件表明,CoCKX基因家族启动子区域存在大量与光响应、水杨酸、茉莉酸甲酯响应及逆境响应等相关元件;共线性结果表明,CoCKX基因家族有1对串联重复基因;在油茶叶片抗病3个时期中7个基因表达量相较于健康植株有不同程度的上调,其中CoCKX1/2基因上调表达量较高,可较大程度地调控油茶在抗病过程中的响应机制。【结论】CoCKX基因家族成员功能上存在一定差异,基因结构在进化中有较高的保守性;在受到炭疽菌侵害过程中,CKX基因表达量上调,推测其具有调控叶片抵御炭疽菌的能力。
关键词
油茶
CKX基因家族
抗病
基因表达
生物信息学
Keywords
Camellia oleifera
CKX gene family
disease resistance
gene expression
bioinformatics
分类号
S723 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
油茶炭疽病研究进展
被引量：
1
2
作者
付盼
陈锋
夏建梅
吴金
杨超臣
余洁
桂世超
机构
信阳市林业技术工作站
河南新县羚锐油茶研究院
长沙县自然资源局
中国
林业
科学研究院亚热带
林业
研究所
信阳市
林业
科学研究所
出处
《河南林业科技》
2024年第4期55-58,61,共5页
基金
中央财政林业项目(GTH[2023]26号)。
文摘
油茶炭疽病是油茶产区的主要病害之一,严重影响我国油茶产业健康发展。综述了油茶炭疽病病原及形态特征、油茶炭疽病侵染特性和发病规律、油茶炭疽病防治技术、油茶炭疽病抗性育种和抗病基因研究,总结了油茶炭疽病研究上存在的问题,并展望了今后的研究方向,为油茶抗炭疽病良种选育及油茶产业发展提供参考。
关键词
油茶
炭疽病
抗病育种
Keywords
Camellia oleifera
Anthracnose
Resistance breeding
分类号
S794.4 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
油茶CKX基因家族鉴定及表达分析
乔新派
郝文乾
叶希琛
魏子申
王文峰
付盼
赖勇
杨超臣
张党权
《河南农业大学学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
油茶炭疽病研究进展
付盼
陈锋
夏建梅
吴金
杨超臣
余洁
桂世超
《河南林业科技》
2024
1
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参考文献
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