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新疆甜瓜种质资源遗传多样性及果肉硬度性状GWAS分析
1
作者
朱婉婷
李江峰
+4 位作者
詹倩如
耍振阳
朱迎春
郭艳霞
骆翔
《果树学报》
北大核心
2025年第5期979-992,共14页
[目的]甜瓜作为重要的全球性果蔬作物,果肉硬度等品质性状直接影响市场竞争力。旨在分析甜瓜种质资源遗传多样性和群体结构,定位果肉硬度相关基因。[方法]利用高通量测序技术对292份全球各地的甜瓜种质资源进行基因组分析,构建了一个大...
[目的]甜瓜作为重要的全球性果蔬作物,果肉硬度等品质性状直接影响市场竞争力。旨在分析甜瓜种质资源遗传多样性和群体结构,定位果肉硬度相关基因。[方法]利用高通量测序技术对292份全球各地的甜瓜种质资源进行基因组分析,构建了一个大规模遗传变异图谱,并结合果肉硬度性状开展全基因组关联分析(GWAS)及单倍型分析。[结果]甜瓜种质群体可以分为地方品种(Pop1)和栽培品种(Pop2)两个主要分支,这两类品种在遗传多样性和群体结构上均存在显著差异。GWAS分析表明,在甜瓜8号染色体上存在与果肉硬度显著相关的SNP位点,该区域涉及多个细胞壁合成和重塑相关的候选基因,如肌醇单磷酸酶(MELO3C007440.2)和核苷酸-糖转运蛋白(MELO3C007449.2)等。这些基因可能通过调控果胶及细胞壁多糖的合成和重塑,从而影响果肉硬度。单倍型分析进一步揭示,硬质果肉与hap001单倍型密切相关,而软质或脆性果肉则与hap004单倍型显著关联。[结论]研究分析了新疆甜瓜种质资源遗传多样性,定位了甜瓜果肉硬度的候选基因,发掘了与果肉硬度相关的单倍型,为甜瓜果肉硬度及其他品质性状的遗传改良提供了新的分子标记,并为甜瓜分子标记辅助选择育种奠定了基础。
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关键词
甜瓜
全基因组关联分析
果肉硬度
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题名
新疆甜瓜种质资源遗传多样性及果肉硬度性状GWAS分析
1
作者
朱婉婷
李江峰
詹倩如
耍振阳
朱迎春
郭艳霞
骆翔
机构
哈密市
农业
农机技术推广服务中心
河南大学农
学院
信阳市农业科学院油料作物研究所
河南
农业
大学
中国
农业
科学院
西部
农业
研究
中心
出处
《果树学报》
北大核心
2025年第5期979-992,共14页
基金
河南省农业援疆项目(202107)
新疆人才发展基金重点人才计划项目(XJARS-06-22)
新疆维吾尔自治区重点研发计划项目(2023B02017-2)。
文摘
[目的]甜瓜作为重要的全球性果蔬作物,果肉硬度等品质性状直接影响市场竞争力。旨在分析甜瓜种质资源遗传多样性和群体结构,定位果肉硬度相关基因。[方法]利用高通量测序技术对292份全球各地的甜瓜种质资源进行基因组分析,构建了一个大规模遗传变异图谱,并结合果肉硬度性状开展全基因组关联分析(GWAS)及单倍型分析。[结果]甜瓜种质群体可以分为地方品种(Pop1)和栽培品种(Pop2)两个主要分支,这两类品种在遗传多样性和群体结构上均存在显著差异。GWAS分析表明,在甜瓜8号染色体上存在与果肉硬度显著相关的SNP位点,该区域涉及多个细胞壁合成和重塑相关的候选基因,如肌醇单磷酸酶(MELO3C007440.2)和核苷酸-糖转运蛋白(MELO3C007449.2)等。这些基因可能通过调控果胶及细胞壁多糖的合成和重塑,从而影响果肉硬度。单倍型分析进一步揭示,硬质果肉与hap001单倍型密切相关,而软质或脆性果肉则与hap004单倍型显著关联。[结论]研究分析了新疆甜瓜种质资源遗传多样性,定位了甜瓜果肉硬度的候选基因,发掘了与果肉硬度相关的单倍型,为甜瓜果肉硬度及其他品质性状的遗传改良提供了新的分子标记,并为甜瓜分子标记辅助选择育种奠定了基础。
关键词
甜瓜
全基因组关联分析
果肉硬度
Keywords
Cucumis melo L.
Genome-wide association analysis(GWAS)
Flesh hardness
分类号
S651 [农业科学—果树学]
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作者
出处
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被引量
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1
新疆甜瓜种质资源遗传多样性及果肉硬度性状GWAS分析
朱婉婷
李江峰
詹倩如
耍振阳
朱迎春
郭艳霞
骆翔
《果树学报》
北大核心
2025
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