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保山猪CDYL基因的转录调控及表达特征研究
1
作者 席学敏 赵加鼎 +6 位作者 翟兰 赵桂英 富国文 吴玲想 龚绍荣 潘洪彬 霍金龙 《河北农业大学学报》 北大核心 2025年第1期90-96,106,共8页
本研究旨在分析染色质结构域Y样蛋白(Chromodomain Y-Like,CDYL)在保山猪(Baoshan pig,BS)睾丸组织中的分子结构、转录调控与潜在的生物学功能。通过RNA测序技术对BS睾丸进行全转录组测序;借助Uniprot数据库对CDYL基因进行功能注释,并... 本研究旨在分析染色质结构域Y样蛋白(Chromodomain Y-Like,CDYL)在保山猪(Baoshan pig,BS)睾丸组织中的分子结构、转录调控与潜在的生物学功能。通过RNA测序技术对BS睾丸进行全转录组测序;借助Uniprot数据库对CDYL基因进行功能注释,并构建其转录调控网络;分析CDYL基因编码的氨基酸序列、蛋白结构特征及相互作用蛋白,对互作蛋白进行网络构建。结果表明,该基因位于猪的7号染色体,含9个外显子和8个内含子;CDYL蛋白含有磷酸化位点且具有3个跨膜螺旋结构;系统进化分析表明,CDYL氨基酸序列在黄牛、绵羊和山羊等哺乳动物中相对保守;蛋白质相互作用网络结果显示CDYL与EHMT2和MIER1等多个蛋白质存在互作关系;基因功能分析发现,CDYL主要与精细胞的发育、DNA模板转录的负调控和转录辅助抑制因子活性等有关;基因靶向作用分析发现,ssc-miR-9、ssc-miR-9-1和ssc-miR-9-2可以靶向调控CDYL基因,并通过3个miRNAs和2个lncRNAs构建了保山猪ceRNA网络。不同15个组织的qPCR表达分析显示CDYL在睾丸中高度表达。阐明了BS CDYL基因重要转录本的核酸及氨基酸序列特征、蛋白质结构并构建了转录调控网络,研究结果为保山猪精子发生过程中的生物学功能和调控特性提供理论依据。 展开更多
关键词 保山猪 CDYL 转录调控 精子发生 表达分析
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谷胱甘肽过氧化物酶4在保山猪中的转录调控
2
作者 袁清婷 林万 +5 位作者 赵桂英 赵加鼎 龚绍荣 富国文 王配 霍金龙 《云南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第2期32-41,共10页
【目的】研究谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxidase 4,GPX4)基因在保山猪中的序列特征、分子结构和表达调控模式。【方法】利用前期保山猪公猪睾丸转录组测序结果定量GPX4基因的表达水平,并对其蛋白质的一级结构、二级结构及三... 【目的】研究谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxidase 4,GPX4)基因在保山猪中的序列特征、分子结构和表达调控模式。【方法】利用前期保山猪公猪睾丸转录组测序结果定量GPX4基因的表达水平,并对其蛋白质的一级结构、二级结构及三级结构特征进行分析;构建多物种氨基酸序列进化树和蛋白互作网络图,分析各物种间的保守同源性和互作蛋白的功能;构建竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络分析图,并进行KEGG和GO功能注释。【结果】GPX4的编码序列长594 bp,编码197个氨基酸,位于猪的2号染色体上,含有7个外显子和6个内含子。疏水性分析结果发现该蛋白质N端和C端都疏水,其二级和三级结构中无规则卷曲占比为36.55%,高于其他结构域。系统进化分析表明:GPX4的氨基酸序列在哺乳动物中较为保守,尤其与偶蹄目的山羊和绵羊亲缘关系最近。蛋白互作网络发现了多个与GPX4互作的蛋白,如GSR、PRDX6、GRSF1、CHAC1、HSPA5,这些蛋白主要在甲状腺激素合成、铂类药物耐药性、肝细胞癌、铁死亡等相关通路中发挥作用。基因功能分析发现:GPX4基因主要参与精子发生、抗氧化、抗铁死亡等过程。ceRNA调控网络分析发现:保山猪GPX4基因受ssc-miR-214-3p靶向调控。GPX4的qPCR结果显示:GPX4在保山猪睾丸中的相对表达量最高,且其表达量随着保山猪年龄的增长而增加。【结论】研究结果为深入研究GPX4在保山猪精子发生过程中的转录调控作用奠定了基础。 展开更多
关键词 保山猪 谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4) 精子发生 转录调控
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TPPP2基因在保山猪睾丸中的表达、转录调控及潜在的生物学作用机制
3
作者 翟兰 席学敏 +6 位作者 常勇诚 赵加鼎 富国文 徐世雄 龚绍荣 赵桂英 霍金龙 《福建农林大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第3期325-334,共10页
【目的】研究保山猪睾丸组织TPPP2基因的基本生物学特性及多个组织TPPP2基因的表达水平,为进一步解析TPPP2基因在保山猪中的作用机制提供依据。【方法】通过全转录组测序分析不同月龄保山猪睾丸TPPP2基因的表达量,构建TPPP2 mRNA与miRNA... 【目的】研究保山猪睾丸组织TPPP2基因的基本生物学特性及多个组织TPPP2基因的表达水平,为进一步解析TPPP2基因在保山猪中的作用机制提供依据。【方法】通过全转录组测序分析不同月龄保山猪睾丸TPPP2基因的表达量,构建TPPP2 mRNA与miRNA、lncRNA的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,分析TPPP2的氨基酸同源性及蛋白互作网络,对TPPP2的互作蛋白进行GO、KEGG富集分析,并将获得的互作蛋白与转录组测序所获得的基因表达量进行关联性分析。【结果】TPPP2基因编码序列(CDS)全长516 bp,位于猪第7号染色体上,有4个外显子和3个内含子;蛋白质功能分析发现,TPPP2有171个氨基酸,具有疏水性,含有磷酸化位点;系统进化、同源性和临近基因分析显示,保山猪的TPPP2与多个物种的聚类符合分类学标准,相似度均超过80%,且具有较高保守性的相邻基因。蛋白互作分析显示,TPPP2与OAZ3、NME8蛋白的互作较为密切。KEGG富集分析显示,这些互作蛋白主要富集在T细胞受体信号、鞘脂信号和mRNA监视等通路上。GO富集分析发现,这些蛋白主要富集在精子鞭毛运动、精子DNA凝结、精子能动性、精子核分化等条目上。TPPP2基因受3个miRNA(ssc-miR-150、ssc-miR-205、ssc-miR-222)靶向调控。qPCR检测显示:TPPP2基因在保山猪15个组织中呈现差异表达现象,且在睾丸中的表达量最高;睾丸中TPPP2基因的表达量随着保山猪月龄的增大逐渐上调。【结论】获得了保山猪睾丸组织TPPP2基因的分子特征、蛋白质结构及相互作用转录调控网络,揭示了TPPP2在睾丸中的高表达水平,表明TPPP2基因在猪精子发生中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 微管蛋白聚合促进蛋白家族成员2 猪 分子结构 蛋白特征 转录调控
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保山猪资源保护与利用策略研究
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作者 龚绍荣 赵加鼎 杨旭 《农业开发与装备》 2024年第10期214-216,共3页
保山猪主要分布在云南省保山市及其周边地区,其生存环境独特,具有重要的生态和经济价值。为了更好地促进保山猪资源的可持续发展,确保其在未来的生态和经济环境中发挥更大的作用,就需要采取合适的策略做好资源利用和保护工作。针对保山... 保山猪主要分布在云南省保山市及其周边地区,其生存环境独特,具有重要的生态和经济价值。为了更好地促进保山猪资源的可持续发展,确保其在未来的生态和经济环境中发挥更大的作用,就需要采取合适的策略做好资源利用和保护工作。针对保山猪资源的分布特征进行了分析,探究了保山猪资源保护利用策略。 展开更多
关键词 保山猪资源 保护与利用 策略
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保山猪和杜洛克猪IGF-1基因的SNP筛选及生物信息学分析 被引量：1
5
作者 李文君 富国文 +5 位作者 龚绍荣 赵加鼎 李再磊 吴正明 周戚斌 赵桂英 《现代畜牧兽医》 2023年第1期26-32,共7页
试验旨在探究IGF-1基因单核苷酸突变位点对保山猪和杜洛克猪生长性能的影响。试验以保山猪和杜洛克猪为研究对象,采用直接测序法对IGF-1基因的多态性进行检测,利用生物信息学软件分析编码蛋白结构。结果显示:在保山猪IGF-1基因编码蛋白... 试验旨在探究IGF-1基因单核苷酸突变位点对保山猪和杜洛克猪生长性能的影响。试验以保山猪和杜洛克猪为研究对象,采用直接测序法对IGF-1基因的多态性进行检测,利用生物信息学软件分析编码蛋白结构。结果显示:在保山猪IGF-1基因编码蛋白的外显子上共筛选出1个SNP位点(Exon4-G189A),该突变属于同义突变,引起密码子改变,但所编码的氨基酸未改变。生物信息学分析结果显示,保山猪IGF-1基因CDS区编码164个氨基酸,分子式为C782H1265N247O239S11,相对分子质量为18303.82,理论等电点为9.89,不稳定性指数为73.25,整体表现为亲水性,不具有跨膜结构,含有信号肽序列;蛋白质二级结构只含有无规则卷曲和α-螺旋,分别占60.37%、39.63%,三级结构预测模型与保山猪IGF-1基因的蛋白结构匹配度为-1.15,具有较好的一致性。研究表明,IGF-1基因在物种进化过程中高度保守,使其编码保山猪和杜洛克猪的氨基酸序列相同,蛋白质结构和功能差异很小或不存在差异,能否作为调控保山猪瘦肉少、脂肪多、生长慢的候选基因还需进行关联性的研究。 展开更多
关键词 保山猪 杜洛克猪 IGF-1 SNP 生物信息学
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云南施甸县猪病病原调查情况
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作者 王雅 赵加鼎 +3 位作者 张海彪 杨忠刚 富国文 李朝震 《畜牧兽医科技信息》 2024年第6期169-172,共4页
为了解云南施甸地区猪病情况,该研究采集全县9个乡镇、56家猪场提供的1717个样品,利用qPCR方法检测猪病。结果显示,施甸地区病毒性疾病蓝耳、猪瘟、伪狂犬、圆环2型、圆环3型、流行性腹泻、轮状病毒、传染性胃肠炎病毒、细小、乙脑检出... 为了解云南施甸地区猪病情况,该研究采集全县9个乡镇、56家猪场提供的1717个样品,利用qPCR方法检测猪病。结果显示,施甸地区病毒性疾病蓝耳、猪瘟、伪狂犬、圆环2型、圆环3型、流行性腹泻、轮状病毒、传染性胃肠炎病毒、细小、乙脑检出率分别为25.93%、1.41%、3.59%、15.49%、14.02%、7.68%、8.71%、5.25%、0.06%、0.51%;细菌性疾病和支原体方面、大肠杆菌、副猪嗜血杆菌、2型链球菌、巴氏杆菌、放线杆菌、产气荚膜梭菌、丹毒杆菌、沙门氏菌检出率分别为37.35%、4.32%、8.02%、26.54%、8.64%、12.04%、0.62%、0.62%、1.85%。 展开更多
关键词 猪病 病原 检测
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无抗条件下从肠道健康方面控制断奶仔猪腹泻的策略 被引量：5
7
作者 龚绍荣 赵加鼎 于治晓 《中国饲料》 北大核心 2019年第18期17-21,共5页
在过去的几十年里,抗菌化合物已被用于预防亚临床和临床疾病,促进断奶仔猪生长等方面。但人们越来越关注细菌耐药性、耐药菌株及其相关基因对人类健康的潜在影响。欧盟从2006年1月1日起禁止在猪和家禽生产中使用抗生素作为生长促进剂。... 在过去的几十年里,抗菌化合物已被用于预防亚临床和临床疾病,促进断奶仔猪生长等方面。但人们越来越关注细菌耐药性、耐药菌株及其相关基因对人类健康的潜在影响。欧盟从2006年1月1日起禁止在猪和家禽生产中使用抗生素作为生长促进剂。此外,高锌和高铜等矿物质也具有促生长作用,但饲料中添加高锌、高铜会严重污染环境。因此,在不使用抗生素的条件下,有必要制定相应的营养和饲喂策略,以便控制与断奶过渡有关的问题。本文综述改善胃肠道结构、功能,促进断奶后仔猪生长的营养策略,重点介绍益生菌、益生元、有机酸、微量元素来源及水平。 展开更多
关键词 抗生素 肠道健康 断奶仔猪 腹泻
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云南省地方猪种精液的冷冻保存 被引量：2
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作者 李春平 赵加鼎 +2 位作者 叶吉荣 任文辉 赵家才 《养殖与饲料》 2022年第4期10-12,共3页
云南地方猪种资源丰富,品质优良,为了加强云南地方优良猪种资源的保护和可持续利用,对云南不同猪种精液进行冷冻保存。采用人工徒手法,采集撒坝猪、大河猪、滇南小耳猪和保山猪的精液,分别测定种公猪精液的采精量、精子密度和原精活力等... 云南地方猪种资源丰富,品质优良,为了加强云南地方优良猪种资源的保护和可持续利用,对云南不同猪种精液进行冷冻保存。采用人工徒手法,采集撒坝猪、大河猪、滇南小耳猪和保山猪的精液,分别测定种公猪精液的采精量、精子密度和原精活力等,并进行猪种间的比较。试验结果显示:保山猪精液质量优于滇南小耳猪、大河猪和撒坝猪,不同猪种间采精量、原精活力、精子密度、冷冻精液解冻活力差异均不显著。只要保存精液条件适宜,在40 h内精液品质下降不明显,可用于制作冷冻精液。 展开更多
关键词 地方猪种 徒手采精 离心 冷冻精液
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