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不同VNTR位点组合用于北京基因型结核分枝杆菌基因分型的研究
被引量：
17
1
作者
李墨
焦伟伟
+3 位作者
孙桂芝
Igor Mokrousov
郭雅洁
申阿东
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期505-509,共5页
目的评价不同串联重复序列(VNTR)位点组合在北京地区北京基因型结核分枝杆菌基因分型中的应用。方法采用多位点数目可变串联重复序列分析(MLVA)技术对72株北京地区北京基因型菌株的24个VNTR位点进行分析,基因多态性分析采用BioNumerics...
目的评价不同串联重复序列(VNTR)位点组合在北京地区北京基因型结核分枝杆菌基因分型中的应用。方法采用多位点数目可变串联重复序列分析(MLVA)技术对72株北京地区北京基因型菌株的24个VNTR位点进行分析,基因多态性分析采用BioNumerics软件。结果24个位点的多态性差异较大,位点QUB-11b(HGI 0.651)、Mtub 21(HGI0.556)和QUB-26(HGI 0.518)的多态性较高,有两个位点(MIRU 2和MIRU 24)则不具有多态性;不同VNTR位点组合(12位点,15位点,24位点)在北京基因型菌株中的分辨指数依次升高,分别为0.788,0.990,0.992,后两个组合的差异仅是由位点Mtub 29引起的。结论不同的VNTR位点在北京地区北京基因型菌株中的分辨力存在差异;推荐的基础VNTR 15位点与Mtub 29组合可作为北京地区结核分枝杆菌分子流行病学研究的一线方法。
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关键词
结核分枝杆菌
北京基因型
串联重复序列
基因分型
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题名
不同VNTR位点组合用于北京基因型结核分枝杆菌基因分型的研究
被引量：
17
1
作者
李墨
焦伟伟
孙桂芝
Igor Mokrousov
郭雅洁
申阿东
机构
首都医科大学附属北京儿童医院儿科
研究所
北京胸科医院检验科
俄罗斯圣彼得堡巴斯德研究所
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期505-509,共5页
基金
国家自然基金资助项目(30471841)
文摘
目的评价不同串联重复序列(VNTR)位点组合在北京地区北京基因型结核分枝杆菌基因分型中的应用。方法采用多位点数目可变串联重复序列分析(MLVA)技术对72株北京地区北京基因型菌株的24个VNTR位点进行分析,基因多态性分析采用BioNumerics软件。结果24个位点的多态性差异较大,位点QUB-11b(HGI 0.651)、Mtub 21(HGI0.556)和QUB-26(HGI 0.518)的多态性较高,有两个位点(MIRU 2和MIRU 24)则不具有多态性;不同VNTR位点组合(12位点,15位点,24位点)在北京基因型菌株中的分辨指数依次升高,分别为0.788,0.990,0.992,后两个组合的差异仅是由位点Mtub 29引起的。结论不同的VNTR位点在北京地区北京基因型菌株中的分辨力存在差异;推荐的基础VNTR 15位点与Mtub 29组合可作为北京地区结核分枝杆菌分子流行病学研究的一线方法。
关键词
结核分枝杆菌
北京基因型
串联重复序列
基因分型
Keywords
Mycobacterium tuberculosis
Beijing genotype
variable number tandem repeat
genotyping
分类号
R521 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同VNTR位点组合用于北京基因型结核分枝杆菌基因分型的研究
李墨
焦伟伟
孙桂芝
Igor Mokrousov
郭雅洁
申阿东
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
17
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