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CRISPR-Cas9基因编辑报道系统于dbDNA来源的iPSC AAVS1安全港的定点整合研究
1
作者
何佳佳
陈耀
+2 位作者
曹淳
鞠小丽
周小明
《华中科技大学学报(医学版)》
北大核心
2025年第2期151-158,共8页
目的建立简便的doggybone DNA(dbDNA)制备技术路线,探讨dbDNA与传统质粒DNA基因表达与诱导免疫反应的差异;利用dbDNA诱导人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)重编程为诱导性多能干细胞(induced pluripotent ste...
目的建立简便的doggybone DNA(dbDNA)制备技术路线,探讨dbDNA与传统质粒DNA基因表达与诱导免疫反应的差异;利用dbDNA诱导人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)重编程为诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cell,iPSC);探索在iPSC AAVS1位点插入超长DNA片段的方案,并同时将Cas9表达框定点插入dbDNA来源的iPSC腺相关病毒位点1(adeno-associated virus site 1,AAVS1)安全港内,构建仅需输入目的基因靶向单向导RNA(single guide RNA,sgRNA)即可实现iPSC基因编辑的稳定细胞株。方法利用Phi29 DNA聚合酶多重置换扩增、原核端粒酶TelN酶切及共价连接、限制性内切酶和外切酶去除骨架环,从而建立简便的dbDNA制备技术路线,将dbDNA-GFP载体与pMax-dbDNA-GFP传统质粒载体分别电转至PBMC,检测绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)表达效率,利用qPCR检测两组细胞干扰素-γ(interferon-γ,IFN-γ)的mRNA表达水平;制备dbDNA重编程载体dbDNA-MOS、dbDNA-KLF4、dbDNA-MYC及dbDNA-BCL并核转PBMC诱导重编程,通过形态学、碱性磷酸酶染色、RT-PCR以及干细胞多能性标志物检测来鉴定dbDNA-iPSC细胞系;在iPSC AAVS1位点利用ZFN与TALEN基因编辑技术插入11.5 kb的含有Cas9表达框、序列中引入终止密码子的EGFP读码框、真核细胞筛选标记等元件的超长DNA片段,通过红色荧光检测、基因组PCR反应以及Western blot等方法鉴定Cas9整合入AAVS1位点的iPSC细胞株,将EGFP单链同源修复模板与EGFP sgRNA共转染阳性iPSC细胞株,靶向修复EGFP基因中错误终止密码子,正确表达绿色荧光蛋白,从而验证Cas9蛋白的基因编辑能力。结果成功制备dbDNA载体并利用其实现基因表达,dbDNA表达GFP基因效率与传统质粒DNA表达效率相近,IFN-γ的mRNA表达水平dbDNA组小于传统质粒DNA组;成功获取形态似人胚胎干细胞,碱性磷酸酶染色、多能性相关基因表达及干细胞多能性标志物阳性的iPSC细胞系;并在该细胞系安全港AAVS1位点成功基因编辑插入超长片段CRISPR-Cas9基因编辑报道系统,基因组PCR鉴定整合片段成功插入基因组,表达红色荧光蛋白,Western blot证实Cas9蛋白成功表达,并成功修复EGFP基因,使细胞表达绿色荧光。结论本研究成功建立了简便的dbDNA制备的技术路线,dbDNA载体基因表达效率与传统质粒DNA无差异,诱导免疫反应较小;经形态学、碱性磷酸酶染色、RT-PCR以及干细胞多能性标志物鉴定获取dbDNA来源的iPSC;成功在iPSC AAVS1安全港插入一个11.5 kb的超长DNA片段,构建Cas9介导基因编辑的iPSC稳定细胞株。
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关键词
诱导性多能干细胞
dbDNA
CRISPR-Cas9
腺相关病毒位点1
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职称材料
题名
CRISPR-Cas9基因编辑报道系统于dbDNA来源的iPSC AAVS1安全港的定点整合研究
1
作者
何佳佳
陈耀
曹淳
鞠小丽
周小明
机构
江苏
大学医学院基础医学系
依诺
赞
(
江苏
)
生物科技
有限公司
出处
《华中科技大学学报(医学版)》
北大核心
2025年第2期151-158,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81571546)。
文摘
目的建立简便的doggybone DNA(dbDNA)制备技术路线,探讨dbDNA与传统质粒DNA基因表达与诱导免疫反应的差异;利用dbDNA诱导人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)重编程为诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cell,iPSC);探索在iPSC AAVS1位点插入超长DNA片段的方案,并同时将Cas9表达框定点插入dbDNA来源的iPSC腺相关病毒位点1(adeno-associated virus site 1,AAVS1)安全港内,构建仅需输入目的基因靶向单向导RNA(single guide RNA,sgRNA)即可实现iPSC基因编辑的稳定细胞株。方法利用Phi29 DNA聚合酶多重置换扩增、原核端粒酶TelN酶切及共价连接、限制性内切酶和外切酶去除骨架环,从而建立简便的dbDNA制备技术路线,将dbDNA-GFP载体与pMax-dbDNA-GFP传统质粒载体分别电转至PBMC,检测绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)表达效率,利用qPCR检测两组细胞干扰素-γ(interferon-γ,IFN-γ)的mRNA表达水平;制备dbDNA重编程载体dbDNA-MOS、dbDNA-KLF4、dbDNA-MYC及dbDNA-BCL并核转PBMC诱导重编程,通过形态学、碱性磷酸酶染色、RT-PCR以及干细胞多能性标志物检测来鉴定dbDNA-iPSC细胞系;在iPSC AAVS1位点利用ZFN与TALEN基因编辑技术插入11.5 kb的含有Cas9表达框、序列中引入终止密码子的EGFP读码框、真核细胞筛选标记等元件的超长DNA片段,通过红色荧光检测、基因组PCR反应以及Western blot等方法鉴定Cas9整合入AAVS1位点的iPSC细胞株,将EGFP单链同源修复模板与EGFP sgRNA共转染阳性iPSC细胞株,靶向修复EGFP基因中错误终止密码子,正确表达绿色荧光蛋白,从而验证Cas9蛋白的基因编辑能力。结果成功制备dbDNA载体并利用其实现基因表达,dbDNA表达GFP基因效率与传统质粒DNA表达效率相近,IFN-γ的mRNA表达水平dbDNA组小于传统质粒DNA组;成功获取形态似人胚胎干细胞,碱性磷酸酶染色、多能性相关基因表达及干细胞多能性标志物阳性的iPSC细胞系;并在该细胞系安全港AAVS1位点成功基因编辑插入超长片段CRISPR-Cas9基因编辑报道系统,基因组PCR鉴定整合片段成功插入基因组,表达红色荧光蛋白,Western blot证实Cas9蛋白成功表达,并成功修复EGFP基因,使细胞表达绿色荧光。结论本研究成功建立了简便的dbDNA制备的技术路线,dbDNA载体基因表达效率与传统质粒DNA无差异,诱导免疫反应较小;经形态学、碱性磷酸酶染色、RT-PCR以及干细胞多能性标志物鉴定获取dbDNA来源的iPSC;成功在iPSC AAVS1安全港插入一个11.5 kb的超长DNA片段,构建Cas9介导基因编辑的iPSC稳定细胞株。
关键词
诱导性多能干细胞
dbDNA
CRISPR-Cas9
腺相关病毒位点1
Keywords
induced pluripotent stem cell
doggybone DNA
CRISPR-Cas9
adeno-associated virus site 1
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CRISPR-Cas9基因编辑报道系统于dbDNA来源的iPSC AAVS1安全港的定点整合研究
何佳佳
陈耀
曹淳
鞠小丽
周小明
《华中科技大学学报(医学版)》
北大核心
2025
0
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