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题名甘蓝型油菜REVEILLE家族鉴定及诱导表达分析
被引量：1
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作者
刘蓉
田闵玉
李光泽
谭成方
阮颖
刘春林
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机构
作物代谢调控与代谢工程实验室、湖南农业大学农学院
作物表观遗传调控与发育湖南省重点实验室、湖南农业大学生物科技学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期161-171,共11页
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基金
国家自然基金委联合重点项目(U20A2028)
湖南省教育厅项目(20K070)。
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文摘
【目的】REVEILLE家族基因具有重要生物学功能,而在甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中该家族基因研究较少,深入认识甘蓝型油菜中RVE家族基因功能及其与非生物胁迫的关系。【方法】利用生物信息学方法,在甘蓝型油菜、白菜(Brassica rapa)和甘蓝(B.oleracea)中分别鉴定到33、16和16个RVE基因,并对其系统进化、染色体定位、基因结构和理化性质以及启动子顺式元件进行分析。【结果】所有的RVE蛋白被分为两个亚家族。33个BnaRVE分别定位在18条A亚基因组的染色体和15条C亚基因组的染色体上。大部分成员属于较稳定的疏水蛋白;多数Ka/Ks值小于1,说明该家族受到强烈的纯化选择作用。基因结构变异较大,内含子数目在4-11之间。共线性分析结果表明,甘蓝型油菜和拟南芥、白菜、甘蓝存在大量的同源基因。大部分甘蓝型油菜RVE家族成员在子叶和叶都有表达且表达量最多。BnaRVE启动子上含有大量与激素和生物逆境相关的元件,通过定量PCR分析,4个BnaRVE在ABA与MeJA诱导和低温胁迫下的表达量显著上调。【结论】在甘蓝型油菜基因组中鉴定出33个BnaRVE家族成员。不同基因在不同发育时期和不同组织中表现出不同的表达模式。不同基因对各种胁迫存在响应,且表达模式不一。RVE家族成员对ABA、MeJA和冷胁迫具有正向响应功能。
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关键词
甘蓝型油菜
RVE基因家族
生物信息学分析
逆境
植物激素
表达分析
表达谱
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Keywords
Brassica napus L.
RVE genes family
bioinformatics analysis
adverse stress
phytohormone
expression analysis
expression profile
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分类号
S565.4
[农业科学—作物学]
Q943.2
[生物学—植物学]
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