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健康人和T-ALL患者BCL11B-3’UTR miRNA结合位点区域的单核苷酸多态性/突变情况
被引量：
1
1
作者
陆帅
何子凡
+5 位作者
廖紫薇
曾成武
杨力建
陈少华
Suming HUANG
李扬秋
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期1228-1231,共4页
目的:建立检测B细胞淋巴瘤/白血病11B基因3’端非翻译区(BCL11B-3’UTR)微小RNA(miRNA)结合位点区域单核苷酸多态性(SNP)和突变的方法,并初步分析健康人和T细胞型急性淋巴细胞白血病(TALL)患者的SNP/突变情况。方法:通过Target Scan等...
目的:建立检测B细胞淋巴瘤/白血病11B基因3’端非翻译区(BCL11B-3’UTR)微小RNA(miRNA)结合位点区域单核苷酸多态性(SNP)和突变的方法,并初步分析健康人和T细胞型急性淋巴细胞白血病(TALL)患者的SNP/突变情况。方法:通过Target Scan等生物学软件对Gen Bank数据库中BCL11B-3’UTR序列的miRNA结合位点进行预测分析;设计扩增包含主要BCL11B-3’UTR中miRNA结合位点区域的特异性引物,PCR扩增20例健康人和21例T-ALL患者外周血单个核细胞DNA的相应片段并送核苷酸序列分析后比对其序列变化情况。结果:根据context++score和seed match类型等评价标准筛选得到BCL11B-3’UTR中24个高度保守的潜在miRNA结合位点;发现1例T-ALL患者存在BCL11B-3’UTR第2 402位点核苷酸替换(T>C),该突变已在db SNP数据库登记(rs184678181);健康人BCL11B-3’UTR miRNA结合位点区域未检测到SNP/突变。结论:健康人和TALL患者BCL11B-3’UTR序列突变罕见。本研究率先发现1例T-ALL患者BCL11B-3’UTR的第2 402位点存在T>C改变,涉及hsa-miR-6814-5p结合位点区域。该SNP对BCL11B表达调控的影响有待进一步研究,以期为BCL11B在T-ALL中的作用研究提供新的资料。
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关键词
B细胞淋巴瘤/白血病11B
T细胞型急性淋巴细胞白血病
3’端非翻译区
微小RNA
单核苷酸多态性
突变
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题名
健康人和T-ALL患者BCL11B-3’UTR miRNA结合位点区域的单核苷酸多态性/突变情况
被引量：
1
1
作者
陆帅
何子凡
廖紫薇
曾成武
杨力建
陈少华
Suming HUANG
李扬秋
机构
暨南
大学
再生
医学
教育部重点实验室
暨南
大学
基础
医学院
血液学研究所
佛罗里达大学医学院生化与分子生物学系
出处
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期1228-1231,共4页
基金
2015年度广东省协同创新与平台环境建设专项资金(国际科技合作领域)资助项目(No.2015A050502029)
文摘
目的:建立检测B细胞淋巴瘤/白血病11B基因3’端非翻译区(BCL11B-3’UTR)微小RNA(miRNA)结合位点区域单核苷酸多态性(SNP)和突变的方法,并初步分析健康人和T细胞型急性淋巴细胞白血病(TALL)患者的SNP/突变情况。方法:通过Target Scan等生物学软件对Gen Bank数据库中BCL11B-3’UTR序列的miRNA结合位点进行预测分析;设计扩增包含主要BCL11B-3’UTR中miRNA结合位点区域的特异性引物,PCR扩增20例健康人和21例T-ALL患者外周血单个核细胞DNA的相应片段并送核苷酸序列分析后比对其序列变化情况。结果:根据context++score和seed match类型等评价标准筛选得到BCL11B-3’UTR中24个高度保守的潜在miRNA结合位点;发现1例T-ALL患者存在BCL11B-3’UTR第2 402位点核苷酸替换(T>C),该突变已在db SNP数据库登记(rs184678181);健康人BCL11B-3’UTR miRNA结合位点区域未检测到SNP/突变。结论:健康人和TALL患者BCL11B-3’UTR序列突变罕见。本研究率先发现1例T-ALL患者BCL11B-3’UTR的第2 402位点存在T>C改变,涉及hsa-miR-6814-5p结合位点区域。该SNP对BCL11B表达调控的影响有待进一步研究,以期为BCL11B在T-ALL中的作用研究提供新的资料。
关键词
B细胞淋巴瘤/白血病11B
T细胞型急性淋巴细胞白血病
3’端非翻译区
微小RNA
单核苷酸多态性
突变
Keywords
B-cell lymphoma / leukemia 11B
T-cell acute lymphoid leukemia
3’-untranslated region
Mi-croRNAs
Single nucleotide polymorphism
Mutation
分类号
R557.4 [医药卫生—血液循环系统疾病]
R394.3 [医药卫生—医学遗传学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
健康人和T-ALL患者BCL11B-3’UTR miRNA结合位点区域的单核苷酸多态性/突变情况
陆帅
何子凡
廖紫薇
曾成武
杨力建
陈少华
Suming HUANG
李扬秋
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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