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猪轮状病毒的分离鉴定和全基因组序列分析
被引量:
12
1
作者
樊高
申翰钦
+7 位作者
王连想
马保华
周庆丰
李群辉
李薇
林丽苗
蔡新斌
张辉华
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2023年第6期47-54,共8页
为了解广东省规模化猪场中猪轮状病毒(PoRV)流行毒株的基因特征,本试验在广东省某猪场采集腹泻仔猪肠道组织样品,经实时荧光定量PCR(qPCR)进行病毒初步鉴定;分离获得病毒后,通过间接免疫荧光、电镜观察进一步鉴定,并对分离毒株进行全基...
为了解广东省规模化猪场中猪轮状病毒(PoRV)流行毒株的基因特征,本试验在广东省某猪场采集腹泻仔猪肠道组织样品,经实时荧光定量PCR(qPCR)进行病毒初步鉴定;分离获得病毒后,通过间接免疫荧光、电镜观察进一步鉴定,并对分离毒株进行全基因组高通量测序和遗传进化分析。结果显示,qPCR初步鉴定该腹泻仔猪病料为PoRV感染,从阳性病料中分离获得1株能引起典型细胞病变的毒株,在电镜下可观察到似车轮状的病毒颗粒,在倒置荧光显微镜下观察有绿色荧光,将该PoRV分离毒株命名为GD2022,其完整基因型为G9-P[23]-I5-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1;基因遗传进化分析结果显示,GD2022为人轮状病毒、猪轮状病毒和狗轮状病毒基因组重组后的毒株。本试验结果丰富了PoRV基因组学和分子流行病学相关的研究资料,为轮状病毒防控提供了数据支持。
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关键词
猪轮状病毒(PoRV)
全基因组测序
腹泻
电镜观察
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职称材料
题名
猪轮状病毒的分离鉴定和全基因组序列分析
被引量:
12
1
作者
樊高
申翰钦
王连想
马保华
周庆丰
李群辉
李薇
林丽苗
蔡新斌
张辉华
机构
佛山科学技术学院生命与工程学院
广东省温氏食品集团股份有限公司研究院
佛山
海关综合
技术
中心
出处
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2023年第6期47-54,共8页
基金
广州海关科研项目(2022GZCK04)
广东省科技专项资金(江科[2021]183号)。
文摘
为了解广东省规模化猪场中猪轮状病毒(PoRV)流行毒株的基因特征,本试验在广东省某猪场采集腹泻仔猪肠道组织样品,经实时荧光定量PCR(qPCR)进行病毒初步鉴定;分离获得病毒后,通过间接免疫荧光、电镜观察进一步鉴定,并对分离毒株进行全基因组高通量测序和遗传进化分析。结果显示,qPCR初步鉴定该腹泻仔猪病料为PoRV感染,从阳性病料中分离获得1株能引起典型细胞病变的毒株,在电镜下可观察到似车轮状的病毒颗粒,在倒置荧光显微镜下观察有绿色荧光,将该PoRV分离毒株命名为GD2022,其完整基因型为G9-P[23]-I5-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1;基因遗传进化分析结果显示,GD2022为人轮状病毒、猪轮状病毒和狗轮状病毒基因组重组后的毒株。本试验结果丰富了PoRV基因组学和分子流行病学相关的研究资料,为轮状病毒防控提供了数据支持。
关键词
猪轮状病毒(PoRV)
全基因组测序
腹泻
电镜观察
Keywords
porcine rotavirus(PoRV)
whole genome sequencing
diarrhea
electron microscope observation
分类号
S852.659.4 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪轮状病毒的分离鉴定和全基因组序列分析
樊高
申翰钦
王连想
马保华
周庆丰
李群辉
李薇
林丽苗
蔡新斌
张辉华
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2023
12
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