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用16S rRNA基因克隆文库研究腹泻粪便中菌群分布
被引量:
5
1
作者
张守印
张集
+3 位作者
叶长芸
李振军
卢金星
徐建国
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期164-166,共3页
目的建立16S rRNA基因克隆文库分析菌群的方法,用于临床标本菌群分布的检测。方法临床标本直接提取核酸,用16S rRNA基因的通用引物进行PCR扩增、纯化、连接、克隆和测序,建立16S rRNA基因克隆文库,序列与数据库进行比对分析。结果通过16...
目的建立16S rRNA基因克隆文库分析菌群的方法,用于临床标本菌群分布的检测。方法临床标本直接提取核酸,用16S rRNA基因的通用引物进行PCR扩增、纯化、连接、克隆和测序,建立16S rRNA基因克隆文库,序列与数据库进行比对分析。结果通过16S rRNA基因克隆文库分析,腹泻标本中检出4种细菌,脆弱拟杆菌为绝对优势菌,占91%;腹泻恢复后的粪便标本中菌群呈多样性,检出12种确定种属的细菌,其中脆弱拟杆菌占14%。结论16S rRNA基因克隆文库是一种较好地研究粪便标本菌群的方法,可直接进行粪便标本的菌群分析和研究各种细菌在腹泻中的作用。
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关键词
16S
RRNA基因
序列分析
厌氧菌
腹泻
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职称材料
某屠宰场猪粪便中单增李斯特菌携带调查
2
作者
刘凯
王艳
+9 位作者
王天姝
贺春月
代航
于波
袁雪娇
叶正兴
王毅
许华青
孟双
叶长芸
《中国动物检疫》
CAS
2014年第6期47-49,67,共4页
为了初步探索猪的李斯特菌携带情况以及屠宰加工环境中污染的可能性,并进一步对分离到的单增李斯特菌进行分型分析,以了解其分子流行病学特征,为预防控制食源性李斯特菌病提供参考。2011年3月至2012年2月每月月初定点采集某一屠宰场的...
为了初步探索猪的李斯特菌携带情况以及屠宰加工环境中污染的可能性,并进一步对分离到的单增李斯特菌进行分型分析,以了解其分子流行病学特征,为预防控制食源性李斯特菌病提供参考。2011年3月至2012年2月每月月初定点采集某一屠宰场的猪粪便标本和加工场所环境水样标本,进行李斯特菌的病原学分离,对分离到的单增李斯特菌进行血清分型、多位点序列分型(MLST)和脉冲场电泳分型(PFGE)分析。1322份猪粪便标本和104份环境标本中,共分离到7株单增李斯特菌、56株无害李斯特菌。5株单增李斯特菌属于1/2c血清型(ST9型),1株1/2a血清型(ST199型),1株1/2b血清型(ST5型)。4株1/2c型菌株具有完全相同的PFEG带型,与另外1株1/2c型菌株具有相似带型,而与其他2株菌株(分别为1/2a型和1/2b型)的带型具有较大差异。猪的单增李斯特菌携带率较低,但存在污染加工环境的可能性,进而导致生猪肉食品受到污染。对屠宰及加工场所采取有效的消毒灭菌措施能够避免单增李斯特菌的污染和传播。
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关键词
单增李斯特菌
猪粪便标本
分子分型
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职称材料
题名
用16S rRNA基因克隆文库研究腹泻粪便中菌群分布
被引量:
5
1
作者
张守印
张集
叶长芸
李振军
卢金星
徐建国
机构
传染病预防控制国家重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
出处
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期164-166,共3页
基金
国家科技攻关计划课题(2003BA712A02)
文摘
目的建立16S rRNA基因克隆文库分析菌群的方法,用于临床标本菌群分布的检测。方法临床标本直接提取核酸,用16S rRNA基因的通用引物进行PCR扩增、纯化、连接、克隆和测序,建立16S rRNA基因克隆文库,序列与数据库进行比对分析。结果通过16S rRNA基因克隆文库分析,腹泻标本中检出4种细菌,脆弱拟杆菌为绝对优势菌,占91%;腹泻恢复后的粪便标本中菌群呈多样性,检出12种确定种属的细菌,其中脆弱拟杆菌占14%。结论16S rRNA基因克隆文库是一种较好地研究粪便标本菌群的方法,可直接进行粪便标本的菌群分析和研究各种细菌在腹泻中的作用。
关键词
16S
RRNA基因
序列分析
厌氧菌
腹泻
Keywords
16S rRNA gene
sequence analysis
anaerobe
diarrhoea
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
某屠宰场猪粪便中单增李斯特菌携带调查
2
作者
刘凯
王艳
王天姝
贺春月
代航
于波
袁雪娇
叶正兴
王毅
许华青
孟双
叶长芸
机构
传染病预防控制国家重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
贵州省黔南州人民医院检验科
湖南省怀化市妇幼保健院
贵阳医学院微生物学教研室
出处
《中国动物检疫》
CAS
2014年第6期47-49,67,共4页
基金
国家重大传染病防治科技重大专项(2011ZX10004-001
2013ZX10004-101)资助
文摘
为了初步探索猪的李斯特菌携带情况以及屠宰加工环境中污染的可能性,并进一步对分离到的单增李斯特菌进行分型分析,以了解其分子流行病学特征,为预防控制食源性李斯特菌病提供参考。2011年3月至2012年2月每月月初定点采集某一屠宰场的猪粪便标本和加工场所环境水样标本,进行李斯特菌的病原学分离,对分离到的单增李斯特菌进行血清分型、多位点序列分型(MLST)和脉冲场电泳分型(PFGE)分析。1322份猪粪便标本和104份环境标本中,共分离到7株单增李斯特菌、56株无害李斯特菌。5株单增李斯特菌属于1/2c血清型(ST9型),1株1/2a血清型(ST199型),1株1/2b血清型(ST5型)。4株1/2c型菌株具有完全相同的PFEG带型,与另外1株1/2c型菌株具有相似带型,而与其他2株菌株(分别为1/2a型和1/2b型)的带型具有较大差异。猪的单增李斯特菌携带率较低,但存在污染加工环境的可能性,进而导致生猪肉食品受到污染。对屠宰及加工场所采取有效的消毒灭菌措施能够避免单增李斯特菌的污染和传播。
关键词
单增李斯特菌
猪粪便标本
分子分型
Keywords
Listeria monocytogenes
Stool sample of swine
Molecular subtyping
分类号
R378.994 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用16S rRNA基因克隆文库研究腹泻粪便中菌群分布
张守印
张集
叶长芸
李振军
卢金星
徐建国
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008
5
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职称材料
2
某屠宰场猪粪便中单增李斯特菌携带调查
刘凯
王艳
王天姝
贺春月
代航
于波
袁雪娇
叶正兴
王毅
许华青
孟双
叶长芸
《中国动物检疫》
CAS
2014
0
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