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云南会泽黑颈鹤国家级自然保护区冬季鸟类多样性研究 被引量：1
1
作者 张建军 《绿色科技》 2022年第12期243-246,共4页
采用样线法对云南会泽黑颈鹤国家级自然保护区开展了为期3年的冬季鸟类多样性调查研究,通过计算鸟类的物种多样性指数以及每一个鸟种的频率指数,进行了多样性分析。结果表明:会泽黑颈鹤国家级自然保护区共记录到鸟类206种,隶属19目56科... 采用样线法对云南会泽黑颈鹤国家级自然保护区开展了为期3年的冬季鸟类多样性调查研究,通过计算鸟类的物种多样性指数以及每一个鸟种的频率指数,进行了多样性分析。结果表明:会泽黑颈鹤国家级自然保护区共记录到鸟类206种,隶属19目56科,包括国家I级重点保护野生鸟类6种,国家Ⅱ级重点保护野生鸟类27种。其中,留鸟94种(占45.63%),夏候鸟29种(占14.07%),冬候鸟60种(占29.12%),旅鸟23种(占11.16%),在区系组成上,以广布种为主(占77.18%)。保护区鸟类多样性指数高(H=3.81),均匀度低(J=0.42),频率指数(RB)差异大。指出了保护区冬季鸟类物种多样性丰富,但各物种的数量分布不均匀,且呈现优势种和普通种数量占比高,稀有种种类多的现状。为此,提出了优化黑颈鹤栖息的湿地环境和相关生境因子,进一步丰富保护区的生物多样性,并为该地区鸟类的种群和生境提供有效保护措施。 展开更多
关键词 冬季 多样性指数 频率指数 会泽保护区
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玛卡种植对云南会泽越冬斑头雁栖息地利用和选择的影响
2
作者 刘红 雷宇 +3 位作者 孟子文 张建军 陈南英 刘强 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第20期9221-9232,共12页
玛卡(Lepidium meyenii)作为一种滋补药材在2012年引入我国西南地区,随后种植面积不断扩大,在2018年前后因市场价格回落,其种植规模迅速萎缩。云南会泽黑颈鹤国家级自然保护区念湖片区是斑头雁(Anser indicus)的重要越冬地,也是玛卡的... 玛卡(Lepidium meyenii)作为一种滋补药材在2012年引入我国西南地区,随后种植面积不断扩大,在2018年前后因市场价格回落,其种植规模迅速萎缩。云南会泽黑颈鹤国家级自然保护区念湖片区是斑头雁(Anser indicus)的重要越冬地,也是玛卡的主要产区之一,玛卡种植面积的剧烈变化也为研究农田候鸟对农耕环境的适应性提供了契机。于2015—2020年在使用卫星跟踪技术在会泽保护区对8只越冬斑头雁进行了长时跟踪,在个体水平上比较了玛卡种植期(2015—2018年)和传统作物种植期(2019—2021年)越冬斑头雁栖息地利用和选择的差异,结果表明:(1)在两个时期,斑头雁的栖息地利用模式发生了剧烈改变。在玛卡种植期斑头雁主要利用沼泽(71.29±3.54)%,其次为耕地(18.12±2.90)%和深水水域(10.59±5.97)%,而在传统作物种植期,主要的利用类型则转变为耕地(74.44±4.84)%,其次为沼泽(12.53±6.97)%和深水水域(12.25±2.44)%。(2)对于同一只斑头雁个体,在不同越冬年份,其栖息地利用模式较稳定。A5号斑头雁在2019年和2020年越冬季均表现为对耕地利用率较高,分别为76.95%和80.41%;A6号斑头雁在2019、2020和2021年越冬时,均偏好利用耕地,利用率分别为76.52%、80.61%和75.74%。(3)在栖息地选择方面,斑头雁对9个环境因子均具有选择性。根据随机森林模型评估结果,最重要的因子均为距夜栖地距离,表明斑头雁对夜栖水环境的依赖性。在其它因子上,两个时期则表现出一定的差异性。在玛卡种植期,斑头雁栖息地选择模式中各类因子的优先顺序为夜栖地>主要觅食地>回避类栖息地>人为干扰因子;在传统作物种植期则为夜栖地>回避类栖息地>人为干扰因子>主要觅食地。综合来看,玛卡种植会对斑头雁产生不利影响,不仅会直接减少斑头雁的优质栖息地面积,而且会直接改变斑头雁栖息地利用和选择模式。建议在保护区内或周边区域实施大规模农业耕种模式调整时,应充分考虑农田鸟类的栖息地需求,进行科学管理。 展开更多
关键词 斑头雁 玛卡 随机森林 栖息地选择 栖息地利用
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云南野鸟源H9N2亚型AIV的遗传进化分析 被引量：1
3
作者 杨佳 杨钦鸿 +4 位作者 王位 张永仙 代红炀 尹红斌 李素华 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期4899-4910,共12页
【目的】分析云南纳帕海国际重要湿地H9N2亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)的遗传进化和分子特征,掌握H9N2亚型AIV在野禽中的流行特点,为禽流感疫情防控提供数据支持。【方法】采集2022―2023年云南省香格里拉纳帕海国际重要... 【目的】分析云南纳帕海国际重要湿地H9N2亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)的遗传进化和分子特征,掌握H9N2亚型AIV在野禽中的流行特点,为禽流感疫情防控提供数据支持。【方法】采集2022―2023年云南省香格里拉纳帕海国际重要湿地野禽粪样及其周边家禽喉头、泄殖腔和环境水样,经尿囊腔接种10日龄SPF鸡胚分离病毒,结合HA试验和RT-PCR扩增鉴定AIV亚型。利用MBTuni-12/13引物同时扩增H9N2亚型AIV毒株的8个基因(HA、NA、M、PB2、NS、NP、PA及PB1)节段,利用二代测序获取全基因组序列,并分析遗传进化关系及关键氨基酸突变位点。【结果】分离到的4株野鸟源H9N2亚型AIV的HA、NA基因源自Y280-like亚系,M、PB 2基因为G1-like亚系,NS、NP、PA、PB 1基因为F/98-like亚系,表明4株分离株为多种亚型的重组毒株,重组模式与2013年以后在中国流行的G57基因型一致。序列相似性分析结果显示,4株H9N2亚型AIV分离株内部基因与H7N9、H5N6、H5N2等亚型AIV相似性较高,遗传多样性特征突出。HA蛋白裂解位点均符合低致病性禽流感特征,获得了多个可增加跨种感染风险及与哺乳动物致病力增强相关的氨基酸突变位点,包括A198T、Q234L、N166D(HA),I292V、A558V(PB2),I368V、L13P(PB1),N30D、T215A(M1),以及P42S(NS1)等。4株野鸟源H9N2亚型AIV毒株具有家禽源同亚型毒株特征,野禽源AIV可能源于家禽。【结论】从云南纳帕海国际重要湿地分离到的4株野鸟源H9N2亚型AIV可能是由家禽传播的多源重配病毒,属于G57基因型,且具有多个适应哺乳动物宿主相关的氨基酸突变位点。 展开更多
关键词 野鸟 H9N2亚型禽流感病毒 G57基因型
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禽腺病毒4型的研究现状 被引量：12
4
作者 薛晓岩 张振兴 +5 位作者 季佳 王雯慧 代红炀 李高银 李素华 宋建领 《动物医学进展》 北大核心 2022年第4期102-106,共5页
禽腺病毒4型(FAdV-4)是引起心包积液-肝炎综合征(HPS-IBH)的主要病原,主要危害鸡、鸭、鹅等家禽并造成家禽行业严重的经济损失。随着HPS-IBH疫病严重程度的增加,家禽间的传染性也急剧升高,国内外加强对该病的研究及防治。论文阐述了FAd... 禽腺病毒4型(FAdV-4)是引起心包积液-肝炎综合征(HPS-IBH)的主要病原,主要危害鸡、鸭、鹅等家禽并造成家禽行业严重的经济损失。随着HPS-IBH疫病严重程度的增加,家禽间的传染性也急剧升高,国内外加强对该病的研究及防治。论文阐述了FAdV-4病毒粒子主要结构蛋白六邻体(Hexon)、五邻体(Penton)和纤突(Fiber),以及主要结构蛋白在病毒感染中的不同功能。近年来国内暴发的FAdV-4的基因组序列分析特征表明毒株与印度株同源性极高,并且新毒株存在ORF19缺失。还总结了针对FAdV-4的特异性LAMP、ELISA等病毒检测技术和预防FAdV-4的基因工程疫苗和亚单位疫苗,阐述了FAdV-4的病原学特征,可为综合防控HPS-IBH提供参考。 展开更多
关键词 禽腺病毒4型 六邻体 五邻体 纤突
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禽腺病毒4型云南株分离鉴定及Hexon基因序列分析 被引量：2
5
作者 薛晓岩 张振兴 +4 位作者 曾毅 季佳 代红炀 李素华 宋建领 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第10期3932-3942,共11页
【目的】分析云南省家禽及野鸟禽腺病毒4型(Fowl adenovirus-4,FAdV-4)流行情况、Hexon基因差异性及致病性,为研究FAdV-4流行及Hexon基因对病毒毒力的影响提供参考。【方法】2020年1月―2021年6月在云南省昆明市、曲靖市、楚雄州、大理... 【目的】分析云南省家禽及野鸟禽腺病毒4型(Fowl adenovirus-4,FAdV-4)流行情况、Hexon基因差异性及致病性,为研究FAdV-4流行及Hexon基因对病毒毒力的影响提供参考。【方法】2020年1月―2021年6月在云南省昆明市、曲靖市、楚雄州、大理州、红河州、玉溪市等家禽养殖密集区采集疑似感染FAdV-4家禽肝脏组织样品158份,候鸟迁徙地采集野鸟新鲜粪便310份,采用PCR技术检测FAdV-4核酸,对获得的代表性阳性样品进行病原分离鉴定,并对分离毒株进行致病性及Hexon基因序列分析。【结果】家禽肝脏组织样品中检出FAdV-4核酸阳性样品19份,阳性率为12.03%(19/158);黑颈鹤粪便样品中检出核酸阳性样品1份,阳性率为0.3%(1/310)。从FAdV-4核酸阳性样品中分离到7株FAdV-4,致病性研究结果显示,FAdV-4云南分离株均能致鸡胚发育不良,引起4周龄肉鸡发生心包积液-肝炎综合征,鸡胚半数致死量(ELD)为10~10/mL。7株分离株均聚类于FAdV-C亚群,Hexon蛋白与国内FAdV-4高致病性毒株具有相同的R、R、Q特征。分离株感染SPF鸡后,临床症状明显,具有高致病性且高致死率,肝细胞病变明显。【结论】研究初步掌握了云南FAdV-4的流行情况,首次在黑颈鹤粪便中检测到FAdV-4病原核酸,分离获得7株FAdV-4,部分毒株Hexon蛋白存在氨基酸突变。 展开更多
关键词 禽腺病毒4型(FAdV-4) Hexon基因 致病性 遗传进化
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基于NCBI数据库的禽源H5N2 AIV的HA基因进化分析 被引量：2
6
作者 李素华 季佳 +8 位作者 李钰萍 刘强 段博芳 代红炀 张文东 宋建领 郭爱伟 王雯慧 尹红斌 《中国家禽》 北大核心 2021年第2期32-36,共5页
为了解H5N2亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)的血凝素蛋白(Hemag-glutinin,HA)系统进化特征,借助NCBI influenza virus resource数据库,下载禽源A型流感病毒(Influenza A Virus,IAV)H5N2亚型HA核酸序列,分析毒株的宿主、分离... 为了解H5N2亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)的血凝素蛋白(Hemag-glutinin,HA)系统进化特征,借助NCBI influenza virus resource数据库,下载禽源A型流感病毒(Influenza A Virus,IAV)H5N2亚型HA核酸序列,分析毒株的宿主、分离时间等特征,并构建HA蛋白的遗传进化树,分析其系统发生。结果显示:NCBI数据库收录的H5N2 AIV的HA核酸序列1272条,序列在NCBI发布时间集中于2005—2007年、2011年、2014—2016年;582条序列为野禽来源,宿主主要分布于雁形目、鸡形目和鸻形目的野禽。系统发生分析结果表明:H5N2 AIV的HA蛋白可聚类为亚欧谱系及北美谱系两大分支,前者可分为三个亚系,后者可分为两个亚系。研究结果呈现了H5N2 AIV HA基因在时间及空间上的进化特征,为H5N2AIV引起的疫病预警和防控提供理论基础。 展开更多
关键词 AIV H5N2 HA 系统发生
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云南拉市海高原湿地H9N2亚型禽流感病毒的遗传特性分析 被引量：1
7
作者 季佳 张振兴 +9 位作者 薛晓岩 王雯慧 韩联宪 代红炀 李高银 段博芳 张文东 刘强 李素华 宋建领 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期250-256,共7页
为了解禽流感病毒(AIV)在野禽和家禽之间的传播特点,本研究于2020年3月~2021年3月在野生鸟类资源丰富的拉市海国际高原湿地采集到野鸟粪便样品1367份、家禽泄殖腔拭子420份和环境水样20份,共计1807份样品,通过鸡胚接种和RT-PCR分离鉴定... 为了解禽流感病毒(AIV)在野禽和家禽之间的传播特点,本研究于2020年3月~2021年3月在野生鸟类资源丰富的拉市海国际高原湿地采集到野鸟粪便样品1367份、家禽泄殖腔拭子420份和环境水样20份,共计1807份样品,通过鸡胚接种和RT-PCR分离鉴定出1株斑头雁来源的H9N2 AIV和2株家禽来源的H9N2 AIV。利用Illumina Miseq测序平台获得3株分离病毒的全基因组序列,并构建了其遗传进化树,分析了与流感病毒的传播能力及致病力相关的关键氨基酸位点的特征。遗传进化分析结果显示,野禽源和家禽源AIV具有相同的遗传进化特征:3株H9N2 AIV均属于欧亚谱系h9.4.2.5分支的病毒,其HA、NA基因为Y280-like亚群,PB2、M基因为G1-like亚群,PB1、PA、NP和NS基因为F/98-like亚群,推测3株分离株均为重组病毒,重组模式为中国流行的H9N2 AIV S基因型。氨基酸位点分析结果显示,3株分离病毒HA、NA、PB2、PB1、M1和NS1蛋白的突变位点均与病毒跨种属传播能力和小鼠致病力增强相关;同时野禽源H9N2 AIV同样存在家禽源分离株相似的HA蛋白N166D替换和NA蛋白颈部aa63~aa65位点缺失,但PA蛋白中未发生N383D突变。以上结果表明,本研究中野禽源H9N2 AIV可能源于家禽的传播,病毒在自然宿主野禽中发生了适应性突变。本研究首次对拉市海高原湿地野禽源与家禽源H9N2 AIV的遗传变异特征进行了系统分析,为禽流感的综合防控提供基础数据。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H9N2 遗传进化分析 野鸟
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