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粉红椋鸟线粒体基因组测定及其系统发育分析
1
作者
王潇杰
孙溪秀
+5 位作者
杨坤
宋彦文
张民迁
季荣
林峻
叶小芳
《西北农业学报》
北大核心
2025年第6期1125-1135,共11页
为获得粉红椋鸟(Pastor roseus)的线粒体全基因组序列,明确该物种的系统发育地位,基于二代测序技术进行线粒体基因组测序,对其进行注释及特征分析;并采用邻接法和最大似然法构建系统发育树。研究结果表明:粉红椋鸟线粒体基因是典型的环...
为获得粉红椋鸟(Pastor roseus)的线粒体全基因组序列,明确该物种的系统发育地位,基于二代测序技术进行线粒体基因组测序,对其进行注释及特征分析;并采用邻接法和最大似然法构建系统发育树。研究结果表明:粉红椋鸟线粒体基因是典型的环状双链DNA(GenBank登录号:PP792558),全长16840 bp,具有AT偏好性(52.75%),共编码37个基因,其中包括22个tRNA基因、2个rRNA基因以及13个蛋白质编码基因,此外还有1个非编码控制区(D-loop区)。线粒体13个蛋白质编码基因的起始密码子以ATG为主,终止密码子以TAA为主。22种tRNA均为完整的三叶草结构,2种方法构建的系统发育树具有相同的拓扑结构,其中粉红椋鸟与其他9种椋鸟科鸟类聚为一支。粉红椋鸟线粒体基因组序列特征与其他椋鸟科物种相似,系统发育分析表明粉红椋鸟与黑领椋鸟(Sturnus nigricollis)的亲缘关系最近。
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关键词
粉红椋鸟
线粒体基因组
序列特征
邻接法
最大似然法
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职称材料
题名
粉红椋鸟线粒体基因组测定及其系统发育分析
1
作者
王潇杰
孙溪秀
杨坤
宋彦文
张民迁
季荣
林峻
叶小芳
机构
新疆师范大学生命科学学院中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心
新疆维吾尔自治区草原生物灾害防控中心
新疆哈密市蝗虫鼠害预测预报防治站
伊犁祥丰农林牧生态发展有限公司
出处
《西北农业学报》
北大核心
2025年第6期1125-1135,共11页
基金
新疆维吾尔自治区天山英才青年拔尖人才项目(20243123638)
新疆维吾尔自治区天山创新团队计划(2024D14006)
+1 种基金
天山英才领军人才项目(TSYCLJ0016)
新疆师范大学2022年度青年拔尖人才项目(XJNUQB2022-30)。
文摘
为获得粉红椋鸟(Pastor roseus)的线粒体全基因组序列,明确该物种的系统发育地位,基于二代测序技术进行线粒体基因组测序,对其进行注释及特征分析;并采用邻接法和最大似然法构建系统发育树。研究结果表明:粉红椋鸟线粒体基因是典型的环状双链DNA(GenBank登录号:PP792558),全长16840 bp,具有AT偏好性(52.75%),共编码37个基因,其中包括22个tRNA基因、2个rRNA基因以及13个蛋白质编码基因,此外还有1个非编码控制区(D-loop区)。线粒体13个蛋白质编码基因的起始密码子以ATG为主,终止密码子以TAA为主。22种tRNA均为完整的三叶草结构,2种方法构建的系统发育树具有相同的拓扑结构,其中粉红椋鸟与其他9种椋鸟科鸟类聚为一支。粉红椋鸟线粒体基因组序列特征与其他椋鸟科物种相似,系统发育分析表明粉红椋鸟与黑领椋鸟(Sturnus nigricollis)的亲缘关系最近。
关键词
粉红椋鸟
线粒体基因组
序列特征
邻接法
最大似然法
Keywords
Pastor roseus
Mitochondrial genome
Sequence characteristics
Neighbor-joining method
Maximum likelihood method
分类号
Q953 [生物学—动物学]
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题名
作者
出处
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被引量
操作
1
粉红椋鸟线粒体基因组测定及其系统发育分析
王潇杰
孙溪秀
杨坤
宋彦文
张民迁
季荣
林峻
叶小芳
《西北农业学报》
北大核心
2025
0
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