期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
基于生物信息学方法分析动静脉内瘘成熟机制中铁死亡的关键基因
1
作者
金爱莲
汪欢
《中国血液净化》
CSCD
2024年第11期849-853,858,共6页
目的动静脉内瘘(arteriovenous fistula,AVF)是血液透析患者首选的血管通路,但低成熟率严重影响终末期肾病患者的治疗。影响AVF成熟的分子机制目前仍不完全清楚。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载AVF血管组织基因表达数...
目的动静脉内瘘(arteriovenous fistula,AVF)是血液透析患者首选的血管通路,但低成熟率严重影响终末期肾病患者的治疗。影响AVF成熟的分子机制目前仍不完全清楚。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载AVF血管组织基因表达数据集(GSE220796和GSE119296),从FerrDb数据库获取铁死亡数据集,鉴定差异的铁死亡相关基因(ferroptosis-related genes,FRGs),并进行功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络及枢纽基因鉴定,应用ROC曲线分析其诊断功效。通过免疫细胞浸润分析、转录因子预测及竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络,研究低氧诱导因子1α(hypoxia-inducible factor-1alpha,HIF1A)潜在的生物学机制。结果共鉴定出70个差异FRGs(45个上调基因和25个下调基因)。功能富集分析提示对营养水平的反应、细胞对低氧水平的反应、调节平滑肌细胞增殖及叉头盒蛋白O(forkhead box protein O,FoxO)信号通路参与AVF成熟过程。鉴定出10个重要的枢纽基因,其中HIF1A在成熟AVF血管组织中高表达。ROC分析显示HIF1A评估AVF成熟的AUC为0.926。HIF1A与AVF血管组织中激活状态的树突细胞(r=0.663,P=0.003)及激活状态的肥大细胞(r=0.644,P=0.004)呈正相关。预测到叉头盒蛋白M1(forkhead box protein M1,FOXM1)为调控HIF1A表达的转录因子,并成功构建了一个包含71个长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、62个微小RNA(microRNAs,miRNA)和1个信使RNA(messenger RNA,mRNA)的竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络。结论AVF成熟过程中血管组织中存在铁死亡,HIF1A是AVF成熟的潜在生物标志物。本研究为揭示HIF1A可提高AVF成熟的临床策略提供了理论依据。
展开更多
关键词
维持性血液透析
动静脉内瘘
铁死亡
低氧诱导因子
生物信息学分析
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
基于生物信息学方法分析动静脉内瘘成熟机制中铁死亡的关键基因
1
作者
金爱莲
汪欢
机构
仙桃市第一人民医院血液净化中心
仙桃市
第一
人民医院
肾病内科
出处
《中国血液净化》
CSCD
2024年第11期849-853,858,共6页
文摘
目的动静脉内瘘(arteriovenous fistula,AVF)是血液透析患者首选的血管通路,但低成熟率严重影响终末期肾病患者的治疗。影响AVF成熟的分子机制目前仍不完全清楚。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载AVF血管组织基因表达数据集(GSE220796和GSE119296),从FerrDb数据库获取铁死亡数据集,鉴定差异的铁死亡相关基因(ferroptosis-related genes,FRGs),并进行功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络及枢纽基因鉴定,应用ROC曲线分析其诊断功效。通过免疫细胞浸润分析、转录因子预测及竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络,研究低氧诱导因子1α(hypoxia-inducible factor-1alpha,HIF1A)潜在的生物学机制。结果共鉴定出70个差异FRGs(45个上调基因和25个下调基因)。功能富集分析提示对营养水平的反应、细胞对低氧水平的反应、调节平滑肌细胞增殖及叉头盒蛋白O(forkhead box protein O,FoxO)信号通路参与AVF成熟过程。鉴定出10个重要的枢纽基因,其中HIF1A在成熟AVF血管组织中高表达。ROC分析显示HIF1A评估AVF成熟的AUC为0.926。HIF1A与AVF血管组织中激活状态的树突细胞(r=0.663,P=0.003)及激活状态的肥大细胞(r=0.644,P=0.004)呈正相关。预测到叉头盒蛋白M1(forkhead box protein M1,FOXM1)为调控HIF1A表达的转录因子,并成功构建了一个包含71个长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、62个微小RNA(microRNAs,miRNA)和1个信使RNA(messenger RNA,mRNA)的竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络。结论AVF成熟过程中血管组织中存在铁死亡,HIF1A是AVF成熟的潜在生物标志物。本研究为揭示HIF1A可提高AVF成熟的临床策略提供了理论依据。
关键词
维持性血液透析
动静脉内瘘
铁死亡
低氧诱导因子
生物信息学分析
Keywords
Maintenance hemodialysis
Arteriovenous fistula
Ferroptosis
Hypoxia inducible factor
Bioinformatics analysis
分类号
R318.16 [医药卫生—生物医学工程]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学方法分析动静脉内瘘成熟机制中铁死亡的关键基因
金爱莲
汪欢
《中国血液净化》
CSCD
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
