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南瓜RPW8基因家族鉴定及响应白粉病侵染表达分析
1
作者
胡文婷
荆赞革
+7 位作者
裴徐梨
张昱
焦鹏
冯鹏宇
王定康
宋立晓
徐胜光
昂海燕
《江苏农业科学》
北大核心
2025年第12期41-47,共7页
RPW8是植物广谱抗病蛋白,是抗病育种的优良基因来源之一。利用生物信息学方法对南瓜RPW8基因家族成员等其他葫芦科植物RPW8基因家族成员进行鉴定、序列特征、共线性和系统进化分析;利用RT-qPCR技术检测南瓜RPW8基因响应白粉病侵染的表...
RPW8是植物广谱抗病蛋白,是抗病育种的优良基因来源之一。利用生物信息学方法对南瓜RPW8基因家族成员等其他葫芦科植物RPW8基因家族成员进行鉴定、序列特征、共线性和系统进化分析;利用RT-qPCR技术检测南瓜RPW8基因响应白粉病侵染的表达特征。结果表明:从南瓜中鉴定出6个RPW8基因家族成员;其编码的蛋白质氨基酸长度为386~847 aa,分子量为43 896.82~95 681.29;等电点为6.52~8.65;平均疏水性为-0.243 264~-0.066 87;该家族成员结构较为保守,每一个南瓜RPW8基因家族成员都具有MLKL_NTD超家族保守结构域;RPW8基因启动子区域含有大量与光响应、茉莉酸、防御和应激、MYB、低温和激素类相关的顺式作用元件;共线性分析发现,南瓜RPW8基因家族成员大部分通过全基因组复制或片段复制产生,仅有1个基因(CmoCh03G010070.1)通过串联重复而来。系统进化分析显示南瓜RPW8可分为RPW8-X和RPW8-NBS这2种类型,且南瓜、笋瓜、西葫芦和墨西哥南瓜亲缘关系相对较近;荧光定量分析显示,CmoCh01G019260.1基因在接种白粉病后的12、24、96 h的表达量上调为对照的3.4、2.2、3.7倍。
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关键词
南瓜
RPW8基因家族
进化分析
表达分析
白粉病
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题名
南瓜RPW8基因家族鉴定及响应白粉病侵染表达分析
1
作者
胡文婷
荆赞革
裴徐梨
张昱
焦鹏
冯鹏宇
王定康
宋立晓
徐胜光
昂海燕
机构
云南省高校生物炭工程研究中心/昆明学院农学与生命科学学院
江苏省农业科
学院
农产品质量安全与营养
研究
所
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2025年第12期41-47,共7页
基金
云南省科技计划重大科技专项(编号:202202AE090015)
昆明学院引进人才科研项目(编号:YJL19009)
+1 种基金
云南省教育厅科学研究基金(编号:2021Y717、2021Y721)
昆明市产业技术领军人才项目。
文摘
RPW8是植物广谱抗病蛋白,是抗病育种的优良基因来源之一。利用生物信息学方法对南瓜RPW8基因家族成员等其他葫芦科植物RPW8基因家族成员进行鉴定、序列特征、共线性和系统进化分析;利用RT-qPCR技术检测南瓜RPW8基因响应白粉病侵染的表达特征。结果表明:从南瓜中鉴定出6个RPW8基因家族成员;其编码的蛋白质氨基酸长度为386~847 aa,分子量为43 896.82~95 681.29;等电点为6.52~8.65;平均疏水性为-0.243 264~-0.066 87;该家族成员结构较为保守,每一个南瓜RPW8基因家族成员都具有MLKL_NTD超家族保守结构域;RPW8基因启动子区域含有大量与光响应、茉莉酸、防御和应激、MYB、低温和激素类相关的顺式作用元件;共线性分析发现,南瓜RPW8基因家族成员大部分通过全基因组复制或片段复制产生,仅有1个基因(CmoCh03G010070.1)通过串联重复而来。系统进化分析显示南瓜RPW8可分为RPW8-X和RPW8-NBS这2种类型,且南瓜、笋瓜、西葫芦和墨西哥南瓜亲缘关系相对较近;荧光定量分析显示,CmoCh01G019260.1基因在接种白粉病后的12、24、96 h的表达量上调为对照的3.4、2.2、3.7倍。
关键词
南瓜
RPW8基因家族
进化分析
表达分析
白粉病
分类号
S642.101 [农业科学—蔬菜学]
S436.5 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
南瓜RPW8基因家族鉴定及响应白粉病侵染表达分析
胡文婷
荆赞革
裴徐梨
张昱
焦鹏
冯鹏宇
王定康
宋立晓
徐胜光
昂海燕
《江苏农业科学》
北大核心
2025
0
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