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思茅松1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)基因的克隆及功能分析
被引量：
14
1
作者
王毅
周旭
+3 位作者
毕玮
杨宇明
李江
王娟
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2015年第6期833-838,共6页
1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)是甲基–D–赤藓醇–4–磷酸(MEP)途径中的第一个酶,也是限速酶。本文根据思茅松(Pinus kesiya var.langbianensis(A.Chev.)Gaussen)树皮转录组数据分析结果,获得思茅松DXS基因片段,然后根据获得的基因...
1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)是甲基–D–赤藓醇–4–磷酸(MEP)途径中的第一个酶,也是限速酶。本文根据思茅松(Pinus kesiya var.langbianensis(A.Chev.)Gaussen)树皮转录组数据分析结果,获得思茅松DXS基因片段,然后根据获得的基因片段设计特异引物,运用RT-PCR和RACE技术从思茅松树皮中克隆得到完整的DXS基因(Pk DXS1)。Pk DXS1基因的c DNA全长序列2 888 bp,含有1个2 223 bp的开放阅读框(ORF),编码740个氨基酸,该基因推断的蛋白与赤松(Pinus densiflora Siebold&Zucc)DXS蛋白的相似性为99%,与欧洲云杉(Picea abies(L.)H.Karst.)DXS的相似性为97%;经氨基酸序列比对,推断思茅松DXS具有高等植物DXS酶特有的叶绿体转运肽,二磷酸硫胺结合位点和转酮醇酶结构域。半定量RT-PCR检测表明树皮的创伤促进DXS基因的表达。
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关键词
思茅松
DXS
CDNA克隆
基因功能分析
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职称材料
巨龙竹肉桂醇脱氢酶基因(DsCAD)的克隆及功能分析
被引量：
6
2
作者
孙金金
朱金鑫
+2 位作者
王娟
杨宇明
王毅
《竹子学报》
北大核心
2016年第4期1-7,共7页
肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)是木质素生物合成途径的关键酶。研究根据巨龙竹转录组数据设计的一对特异引物,运用逆转录PCR(RT-PCR)技术从巨龙竹茎秆中克隆得到肉桂醇脱氢酶基因DsCAD,该基因包含1080 bp的完整c DN...
肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)是木质素生物合成途径的关键酶。研究根据巨龙竹转录组数据设计的一对特异引物,运用逆转录PCR(RT-PCR)技术从巨龙竹茎秆中克隆得到肉桂醇脱氢酶基因DsCAD,该基因包含1080 bp的完整c DNA开放阅读框,编码359个氨基酸,理论相对分子质量38689.6,等电点6.18。利用生物信息学方法对DsCAD进行分析,结果显示:DsCAD氨基酸序列包含CAD超家族的保守结构域,具有植物CAD基因的典型特征;其与禾本科植物CAD基因的同源性较高,亲缘关系较近,其中与孝顺竹的同源性高达95%。荧光定量PCR检测结果显示DsCAD基因在巨龙竹竹笋中的表达量要高于茎秆,而在茎秆中的表达量有明显高于叶。
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关键词
肉桂醇脱氢酶
巨龙竹
基因克隆
荧光定量
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职称材料
七彩虹竹4-香豆酸辅酶A连接酶基因(Ih4CL)的克隆及功能分析
被引量：
1
3
作者
孙金金
朱金鑫
+2 位作者
杨宇明
王娟
王毅
《西部林业科学》
CAS
2017年第1期26-31,37,共7页
4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)是苯丙烷类代谢途径的关键酶,在上游调控木质素代谢、黄酮代谢。本研究根据转录组数据设计的1对特异引物,采用逆转录PCR(RT-PCR)方法从七彩红竹1年生红秆中克隆到4-香豆酸辅酶A连接酶基因Ih4CL,该基因包含1 67...
4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)是苯丙烷类代谢途径的关键酶,在上游调控木质素代谢、黄酮代谢。本研究根据转录组数据设计的1对特异引物,采用逆转录PCR(RT-PCR)方法从七彩红竹1年生红秆中克隆到4-香豆酸辅酶A连接酶基因Ih4CL,该基因包含1 677bp完整的c DNA开放阅读框,编码558个氨基酸;生物信息学方法对Ih4CL编码的氨基酸蛋白序列进行的分析表明,Ih4CL与禾本科植物4CL蛋白具有较近的亲缘关系,其中与短花药野生稻的同源性达88%;荧光定量PCR检测结果显示Ih4CL基因在七彩红竹的嫩叶中的表达量明显低于茎秆中的表达量。
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关键词
4-香豆酸辅酶A连接酶
七彩虹竹
基因克隆
荧光定量PCR
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职称材料
题名
思茅松1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)基因的克隆及功能分析
被引量：
14
1
作者
王毅
周旭
毕玮
杨宇明
李江
王娟
机构
云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室
云南省
林业
科学院
西南
林业
大学
出处
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2015年第6期833-838,共6页
基金
林业公益性行业科研专项(201304105)资助
云南省应用基础研究重点项目(2013FA054)
云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010CI016)资助
文摘
1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)是甲基–D–赤藓醇–4–磷酸(MEP)途径中的第一个酶,也是限速酶。本文根据思茅松(Pinus kesiya var.langbianensis(A.Chev.)Gaussen)树皮转录组数据分析结果,获得思茅松DXS基因片段,然后根据获得的基因片段设计特异引物,运用RT-PCR和RACE技术从思茅松树皮中克隆得到完整的DXS基因(Pk DXS1)。Pk DXS1基因的c DNA全长序列2 888 bp,含有1个2 223 bp的开放阅读框(ORF),编码740个氨基酸,该基因推断的蛋白与赤松(Pinus densiflora Siebold&Zucc)DXS蛋白的相似性为99%,与欧洲云杉(Picea abies(L.)H.Karst.)DXS的相似性为97%;经氨基酸序列比对,推断思茅松DXS具有高等植物DXS酶特有的叶绿体转运肽,二磷酸硫胺结合位点和转酮醇酶结构域。半定量RT-PCR检测表明树皮的创伤促进DXS基因的表达。
关键词
思茅松
DXS
CDNA克隆
基因功能分析
Keywords
Pinus kesiya var. langbianensis （ A. Chev. ） Gaussen
1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate synthase gene
eDNA clone
gene function analysis
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
巨龙竹肉桂醇脱氢酶基因(DsCAD)的克隆及功能分析
被引量：
6
2
作者
孙金金
朱金鑫
王娟
杨宇明
王毅
机构
西南
林业
大学
云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室
云南省
林业
科学院
云南省
森林
培育与开发利用
重点
实验室
出处
《竹子学报》
北大核心
2016年第4期1-7,共7页
基金
云南省对外科技合作计划(2014IA3)
云南省基础研究重点项目(2013FA054)
云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010CI016)
文摘
肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)是木质素生物合成途径的关键酶。研究根据巨龙竹转录组数据设计的一对特异引物,运用逆转录PCR(RT-PCR)技术从巨龙竹茎秆中克隆得到肉桂醇脱氢酶基因DsCAD,该基因包含1080 bp的完整c DNA开放阅读框,编码359个氨基酸,理论相对分子质量38689.6,等电点6.18。利用生物信息学方法对DsCAD进行分析,结果显示:DsCAD氨基酸序列包含CAD超家族的保守结构域,具有植物CAD基因的典型特征;其与禾本科植物CAD基因的同源性较高,亲缘关系较近,其中与孝顺竹的同源性高达95%。荧光定量PCR检测结果显示DsCAD基因在巨龙竹竹笋中的表达量要高于茎秆,而在茎秆中的表达量有明显高于叶。
关键词
肉桂醇脱氢酶
巨龙竹
基因克隆
荧光定量
Keywords
Cinnamyl alcohol dehydrogenase
Dendrocalamus sinicus
Gene clone
Real time PCR
分类号
S795 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
七彩虹竹4-香豆酸辅酶A连接酶基因(Ih4CL)的克隆及功能分析
被引量：
1
3
作者
孙金金
朱金鑫
杨宇明
王娟
王毅
机构
西南
林业
大学
云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室
云南省
林业
科学院
云南省
森林
培育与开发利用
重点
实验室
出处
《西部林业科学》
CAS
2017年第1期26-31,37,共7页
基金
云南省基础研究重点项目(2013FA054)
云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010CI016)
国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室开发基金共同资助
文摘
4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)是苯丙烷类代谢途径的关键酶,在上游调控木质素代谢、黄酮代谢。本研究根据转录组数据设计的1对特异引物,采用逆转录PCR(RT-PCR)方法从七彩红竹1年生红秆中克隆到4-香豆酸辅酶A连接酶基因Ih4CL,该基因包含1 677bp完整的c DNA开放阅读框,编码558个氨基酸;生物信息学方法对Ih4CL编码的氨基酸蛋白序列进行的分析表明,Ih4CL与禾本科植物4CL蛋白具有较近的亲缘关系,其中与短花药野生稻的同源性达88%;荧光定量PCR检测结果显示Ih4CL基因在七彩红竹的嫩叶中的表达量明显低于茎秆中的表达量。
关键词
4-香豆酸辅酶A连接酶
七彩虹竹
基因克隆
荧光定量PCR
Keywords
4-Coumarate coenzyme A ligase
Indosasa hispida cv. ‘Rainbow＇
gene clone
real time PCR
分类号
S795.9 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
思茅松1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)基因的克隆及功能分析
王毅
周旭
毕玮
杨宇明
李江
王娟
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2015
14
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
巨龙竹肉桂醇脱氢酶基因(DsCAD)的克隆及功能分析
孙金金
朱金鑫
王娟
杨宇明
王毅
《竹子学报》
北大核心
2016
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
七彩虹竹4-香豆酸辅酶A连接酶基因(Ih4CL)的克隆及功能分析
孙金金
朱金鑫
杨宇明
王娟
王毅
《西部林业科学》
CAS
2017
1
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职称材料
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