期刊文献+
共找到3篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
基于SSR标记的云南省核桃种质资源遗传多样性及核心种质构建 被引量:21
1
作者 吴涛 陈少瑜 +4 位作者 肖良俊 宁德鲁 潘莉 贺娜 朱云凤 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期767-774,共8页
利用SSR分子标记技术对云南省14个州市1061份核桃种质资源进行遗传多样性分析,在此基础上,通过最小距离逐步取样法构建核心种质并进行了核心种质的多样性检测。结果表明,19对SSR引物共检测到322个等位基因,每对引物平均16.95个,Shannon... 利用SSR分子标记技术对云南省14个州市1061份核桃种质资源进行遗传多样性分析,在此基础上,通过最小距离逐步取样法构建核心种质并进行了核心种质的多样性检测。结果表明,19对SSR引物共检测到322个等位基因,每对引物平均16.95个,Shannon信息指数(I)平均为1.3375,期望杂合度(He)平均为0.6040,Nei′s遗传多样性指数(Nei)平均为0.6043,数据表明云南核桃种质资源具有较为丰富的遗传多样性。遗传多样性在各州市分布不均,其中,迪庆州核桃资源的遗传多样性相对最高,最低的是临沧地区。基于遗传距离的UPGMA聚类结果,以5%~30%的取样比例分别构建初级种质(PC)、次级种质(SC)、核心种质-1(CC-1)、核心种质-2(CC-2)等4个核心种质,经遗传多样性分析及t检验,最终确定10.84%取样比例、115份样本量的核心种质-1(CC-1)为云南核桃资源的核心种质。 展开更多
关键词 核桃 SSR分子标记 种质资源 遗传多样性 核心种质
在线阅读 下载PDF
云南沟谷雨林建群种绒毛番龙眼居群的遗传多样性 被引量:4
2
作者 陈少瑜 李江 +1 位作者 陈伟 冯弦 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期850-858,共9页
【目的】了解云南特有的沟谷雨林主要建群种绒毛番龙眼居群的遗传多样性及遗传结构特征,为雨林植被恢复的采种规划和恢复效果评估提供重要参考。【方法】采用SSR分子标记技术,检测分析云南省西双版纳州和普洱市思茅区的绒毛番龙眼3个天... 【目的】了解云南特有的沟谷雨林主要建群种绒毛番龙眼居群的遗传多样性及遗传结构特征,为雨林植被恢复的采种规划和恢复效果评估提供重要参考。【方法】采用SSR分子标记技术,检测分析云南省西双版纳州和普洱市思茅区的绒毛番龙眼3个天然居群和1个人工居群共82个样本的SSR多态性,采用POPGENE v.1.32、GenAlEx 6.501和STRUCTURE 2.3.3等进行遗传多样性及遗传结构分析。【结果】19对SSR引物共检测到88个等位基因,每对引物平均4.632个,19个位点的Shannon’s信息指数(I)变化范围为0.264~1.687,平均为0.879;多态信息指数(PIC)变化范围为0.128~0.729,平均为0.422,期望杂合度(He)的变化范围为0.138~0.765,平均为0.473;4个居群I和He的均值分别为0.785,0.437。19个位点的遗传分化系数(F_(ST))均值为0.069,基因流(Nm)的均值为3.363。STRUCTURE分析将绒毛番龙眼4个居群82个样本分为4个类群,基于遗传距离的UPGMA聚类显示4个居群聚为2个分支,菜阳河天然林居群、普文人工林居群和普文天然林居群聚为一支,勐养镇天然林居群单独为另一支。【结论】绒毛番龙眼的遗传多样性处于中等水平;居群间的遗传分化较低,遗传变异主要来源于居群内;建议特别关注居群内个体的选择和保护,在沟谷雨林植被恢复中设定天然居群多样性水平的恢复目标,并通过科学的采种规划实现这一目标。 展开更多
关键词 绒毛番龙眼 SSR分子标记 珍稀濒危树种 沟谷雨林建群种 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
竹叶花椒MYB基因家族的鉴定及其表达特性的分析 被引量:10
3
作者 冯发玉 王毅 +4 位作者 王丽娟 罗玛妮娅 徐令文 杨彦萍 陆斌 《经济林研究》 北大核心 2021年第4期148-157,共10页
【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据... 【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据,为后续的无刺竹叶花椒品种的基因工程培育奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法,从测序获得的竹叶花椒转录组数据库中筛选MYB转录因子,对其蛋白基序、理化性质、系统进化关系、基因表达特性等进行分析,并利用qRT-PCR技术和基因克隆,对所选基因进行验证。【结果】从竹叶花椒中共鉴定出39条MYB转录因子序列,其中包括9个R1-MYB型基因、28个R2R3-MYB型基因、1个R3型基因和1个R4型基因。对其蛋白理化性质的分析结果表明:39个MYB转录因子所含氨基酸数量为101~621个,其均为可溶性蛋白,而其二级结构以无规则卷曲为主。亚细胞定位预测结果显示:39个MYB转录因子定位于细胞核的可能性最大,这符合转录因子调控下游基因的表达特性。基因表达情况的分析结果显示:部分MYB转录因子在竹叶花椒同一组织的不同发育时期的表达差异显著,其中ZaMYB10、ZaMYB23和ZaMYB25这3个基因的表达量随着皮刺的不断发育均呈逐渐增长的趋势,表明这3个基因可能与皮刺的生长发育相关。qRT-PCR分析结果表明:ZaMYB10基因在皮刺中有特异表达。基因克隆结果表明:ZaMYB10基因具有长为1032 bp的完整的cDNA开放阅读框,其编码343个氨基酸。【结论】鉴定出39个竹叶花椒MYB转录因子,其均包含SANT保守结构域,根据表达模式判断,其中的ZaMYB10转录因子可能参与了竹叶花椒皮刺生长发育的调控。 展开更多
关键词 竹叶花椒 MYB 皮刺 生物信息学分析 基因表达分析
在线阅读 下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部