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云南欧洲甜樱桃品种SSR鉴定及遗传多样性分析: 1; 作者杨跃仙段利武 +2 位作者卯梅华王毅马山俊《西南林业大学学报（自然科学）》 CAS 北大核心 2024年第6期72-80,共9页; 为了解云南省目前引种和栽培的欧洲甜樱桃品种情况及其遗传多样性状况,经过SSR标记的筛选,对云南省昆明市、马龙县、石林县、牟定县不同基地和资源圃的85份欧洲甜樱桃品种进行基因型鉴定和遗传多样性分析。结果表明:共筛选出16个稳定性... 展开更多; 关键词甜樱桃品种鉴定遗传多样性 SSR; 在线阅读下载PDF 职称材料

云南松林下干巴菌生长土壤的理化性质及有效态微量元素特征被引量：7: 2; 作者张珊珊毛云玲 +1 位作者冯志伟杨文忠《西部林业科学》 CAS 北大核心 2020年第6期35-42,53,共9页; 干巴菌是我国西南地区常见的菌根食用菌,目前无法进行人工栽培,因此确定云南松林下干巴菌生长的土壤环境对于其人工栽培的实现极为关键。为了解云南松林下干巴菌生长土壤的理化性质及有效态微量元素特征,本研究以云南松林下干巴菌生长... 展开更多; 关键词云南松干巴菌土壤环境微量元素; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于转录组序列的非洲菊密码子偏好性分析被引量：3: 3; 作者卢珍红原晓龙 +2 位作者李绅崇单芹丽王毅《西南林业大学学报（自然科学）》北大核心 2023年第5期77-86,共10页; 利用CodonW 1.4.2和在线软件CUSP分析非洲菊转录组13769条编码序列的密码子碱基组成、同义密码子相对使用度和密码子偏好性,并通过中性绘图分析、ENC-plot和PR2-plot分析影响密码子偏好性的因素。结果表明:非洲菊编码基因序列的密码子... 展开更多; 关键词非洲菊转录组密码子; 在线阅读下载PDF 职称材料

蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性分析被引量：41: 4; 作者原晓龙刘音 +3 位作者康洪梅陈中华李云琴王毅《西南林业大学学报（自然科学）》 CAS 北大核心 2021年第3期15-22,共8页; 为了解蒜头果叶绿体基因组密码子的使用偏性,利用Codon W 1.4.2和CUSP软件对蒜头果叶绿体基因组中33个基因的密码子进行中性绘图,应用ENC−plot、PR2−plot绘图分析并确定了其最优密码子。结果表明:蒜头果叶绿体基因组密码子的第3位碱基G... 展开更多; 关键词蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性; 在线阅读下载PDF 职称材料

迪庆州核桃种质资源的遗传多样性与遗传结构被引量：6: 5; 作者陆婷陈少瑜 +1 位作者吴涛肖良俊《西部林业科学》 CAS 北大核心 2021年第2期71-77,共7页; 利用SSR分子标记技术对云南省迪庆藏族自治州3个群体共161份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示资源的遗传多样性水平及遗传结构特征,为其保护和利用提供依据。结果表明:18对SSR引物对161份DNA样本进行扩增,共检测到171个等位基因... 展开更多; 关键词深纹核桃种质资源遗传多样性遗传结构 SSR分子标记; 在线阅读下载PDF 职称材料

球孢白僵菌中与致病相关的NRPS基因的克隆与表达被引量：1: 6; 作者原晓龙李桂凤 +1 位作者李云琴王毅《西部林业科学》 CAS 北大核心 2019年第6期135-139,共5页; 以真菌球孢白僵菌为研究对象,以基因序列相似性为基础从球孢白僵菌基因组中挖掘获得Bbnrps1基因,再通过序列相似性和聚类分析等生物信息学方法推断该基因功能,并比较相同环境下不同的培养基配方对该基因表达水平差异等手段以寻找能够诱... 展开更多; 关键词球孢白僵菌非核糖体多肽合成酶聚类分析基因克隆基因表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于二代测序哈巴乌头叶绿体基因组分析: 7; 作者马福仙魏健生 +1 位作者耿云芬张汉尧《西部林业科学》 CAS 北大核心 2023年第1期175-181,共7页; 为了解哈巴乌头叶绿体基因组特征及密码子偏好性,本研究采用Illumina HiSeq对哈巴乌头叶绿体基因组进行测序,组装获得完整叶绿体基因组序列,并利用CUSP和Codon W软件分析该物种叶绿体基因组密码子偏好性。结果显示:哈巴乌头叶绿体基因... 展开更多; 关键词哈巴乌头 Illumina测序叶绿体基因组密码子偏好性; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名云南欧洲甜樱桃品种SSR鉴定及遗传多样性分析: 1; 作者杨跃仙段利武卯梅华王毅马山俊; 机构云南林业职业技术学院云南省林业和草原科学院; 出处《西南林业大学学报（自然科学）》 CAS 北大核心 2024年第6期72-80,共9页; 基金云南省教育厅科学研究基金项目(2023J1620)资助云南省“兴滇英才支持计划”教学名师项目(YNWR−JXMS−2019−038)资助。; 文摘为了解云南省目前引种和栽培的欧洲甜樱桃品种情况及其遗传多样性状况,经过SSR标记的筛选,对云南省昆明市、马龙县、石林县、牟定县不同基地和资源圃的85份欧洲甜樱桃品种进行基因型鉴定和遗传多样性分析。结果表明:共筛选出16个稳定性好、高度多态性的SSR标记;85份欧洲甜樱桃品种中有71份品种都有不同程度的重复,剔除同物异名和异物同名的品种后,筛选出31份欧洲甜樱桃品种;31份品种用16个SSR标记共扩增出74个等位片段,有效等位基因(Ne)的大小为1.1027~3.8363,平均值为2.70,香农指数(I)范围为0.2245~1.5151,平均值1.1295。观测杂合度(Ho)的范围为0.0968~0.7742,平均值0.6250,多态信息含量(PIC)的范围为0.0931~0.7393,平均值0.5953。该研究结果表明云南省85份甜樱桃品种实为31个基因型,遗传多样性水平中等偏高。; 关键词甜樱桃品种鉴定遗传多样性 SSR; Keywords Prunus avium variety identification genetic diversity SSR; 分类号 S662.5 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名云南松林下干巴菌生长土壤的理化性质及有效态微量元素特征被引量：7: 2; 作者张珊珊毛云玲冯志伟杨文忠; 机构云南省林业和草原科学院; 出处《西部林业科学》 CAS 北大核心 2020年第6期35-42,53,共9页; 基金中央引导地方科技发展专项资金(YDZX201953000002889),云南省林业和草原科学院基金项目(MS2019-08,MS2019-09)。; 文摘干巴菌是我国西南地区常见的菌根食用菌,目前无法进行人工栽培,因此确定云南松林下干巴菌生长的土壤环境对于其人工栽培的实现极为关键。为了解云南松林下干巴菌生长土壤的理化性质及有效态微量元素特征,本研究以云南松林下干巴菌生长土壤为研究对象,通过野外调查与室内分析相结合的手段,对云南松林下干巴菌生长土壤的理化性质与有效态微量元素特征进行了测定分析;并根据综合得分模型计算出所有样地的综合主成分值,将其按综合主成分值进行了排序。结果表明:云南松林下干巴菌生长土壤的pH为4.69~5.70,有机质含量为35.85~129.59 g/kg,全氮含量为1.33~3.29 g/kg,全磷含量为0.38~0.63 g/kg,全钾含量为4.81~22.42 g/kg,水解性氮含量为104.24~285.17 mg/kg,有效磷含量为2.76~16.07 mg/kg,速效钾含量为74.33~368.80 mg/kg,有效锌含量为1.08~15.68 mg/kg,有效锰含量为8.74~39.37 mg/kg,有效铜含量为0.42~1.60 mg/kg,有效铁含量为53.44~232.36 mg/kg,有效硼含量为0.39~0.97 mg/kg。pH值与其他指标均不相关,全钾与其他指标间呈负相关或不相关,其余11个指标之间的相关性都是显著或极显著。综合评价得分表明,样地E和H的综合得分较高。因此,适宜干巴菌生长的土壤环境为弱酸性,有机质、全氮、全磷、全钾、水解性氮、有效磷和速效钾含量较高,有效态微量元素含量较丰富;有效锌、有效锰、有效铁和有效硼含量,均与有机质、碱解氮、有效磷、速效钾、全氮和全磷含量分别呈显著正相关,且有效态微量元素间关系也呈显著正相关。研究结果明确了干巴菌适宜栽培的土壤环境,可为其人工种植提供理论基础。; 关键词云南松干巴菌土壤环境微量元素; Keywords Pinus yunnanensis Thelephora ganbajun soil environment microelement; 分类号 S714 [农业科学—林学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于转录组序列的非洲菊密码子偏好性分析被引量：3: 3; 作者卢珍红原晓龙李绅崇单芹丽王毅; 机构云南省农业科学院花卉研究所云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南省林业和草原科学院国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室; 出处《西南林业大学学报（自然科学）》北大核心 2023年第5期77-86,共10页; 基金国家自然科学基金项目(31860177)资助云南省重大科技专项计划项目(202102AE090001)资助云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(202205AC160044)资助。; 文摘利用CodonW 1.4.2和在线软件CUSP分析非洲菊转录组13769条编码序列的密码子碱基组成、同义密码子相对使用度和密码子偏好性,并通过中性绘图分析、ENC-plot和PR2-plot分析影响密码子偏好性的因素。结果表明:非洲菊编码基因序列的密码子偏好性整体偏弱,影响密码子偏好性的主要因素为突变,同时确定UUG、UUU、UAU、AUU、UGU、GUU、AGA、GGU、UCU、UCA、CCA、ACC、GCU等13个最优密码子,最优密码子偏好以A/U结尾。本研究为进一步明确非洲菊密码子进化特征和遗传转化中最优密码子的选择提供参考依据。; 关键词非洲菊转录组密码子; Keywords Gerbera jamesonii transcriptome codon; 分类号 Q754.1 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性分析被引量：41: 4; 作者原晓龙刘音康洪梅陈中华李云琴王毅; 机构云南省林业和草原科学院云南省水文水资源局昆明分局/云南省水环境监测中心昆明市分中心; 出处《西南林业大学学报（自然科学）》 CAS 北大核心 2021年第3期15-22,共8页; 基金国家自然科学基金项目(31860177)资助云南省应用基础研究青年项目(2016FD100,2017FD169)资助云南省林业和草原科学院分子生物学研究团队(LKYTD-2020-001)资助。; 文摘为了解蒜头果叶绿体基因组密码子的使用偏性,利用Codon W 1.4.2和CUSP软件对蒜头果叶绿体基因组中33个基因的密码子进行中性绘图,应用ENC−plot、PR2−plot绘图分析并确定了其最优密码子。结果表明:蒜头果叶绿体基因组密码子的第3位碱基GC含量为28.43%,远低于第1位(47.74%)和第2位(41.05%),RSCU值大于1的密码子有30个,其中12个以A结尾,16个以U结尾,说明蒜头果叶绿体基因组的编码基因偏好以A和U结尾。GC_(12)和GC_(3)的相关系数为0.1646,相关性不显著,回归系数为0.0004;有效密码子数(ENC)范围为40.39~54.86,大于45的有25个,ENC比值主要分布在−0.05~0.05之外。蒜头果叶绿体基因组中的大部分基因分布在PR2平面图的下半部或右下半部,说明蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性更多地受选择的影响,同时亦受其他因素的影响。蒜头果叶绿体基因组的最优密码子确定为UUU、UUA、GUA等18个。; 关键词蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性; Keywords Malania oleifera chloroplast genome codon bias; 分类号 S792 [农业科学—林木遗传育种] Q781 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名迪庆州核桃种质资源的遗传多样性与遗传结构被引量：6: 5; 作者陆婷陈少瑜吴涛肖良俊; 机构云南省林业和草原技术推广总站云南省林业和草原科学院经济林研究所云南省林业和草原科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室; 出处《西部林业科学》 CAS 北大核心 2021年第2期71-77,共7页; 基金国家自然科学基金项目(3166024)。; 文摘利用SSR分子标记技术对云南省迪庆藏族自治州3个群体共161份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示资源的遗传多样性水平及遗传结构特征,为其保护和利用提供依据。结果表明:18对SSR引物对161份DNA样本进行扩增,共检测到171个等位基因,平均每对引物9.5个。3个群体的观察杂合度(H_(o))和期望杂合度(H_(e))的变化范围分别为0.390~0.580和0.580~0.619,平均值分别为0.467和0.598;Shannon信息指数(I)介于1.153~1.313之间,平均为1.231,数据表明迪庆州核桃种质资源的遗传多样性属于中等水平。群体间的遗传分化系数(F_(ST))介于0.0052~0.2253之间,平均为0.0652,表明遗传变异主要来源于群体内的个体,仅有6.52%来源于群体间,各位点的基因流(N_(m))平均为4.2663(N_(m)>1),群体间的基因交流阻止了群体间的分化。STRUCTURE分析将161份核桃资源分成3个类群,而基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类将3个群体划分成2组,维西和香格里拉聚为一组,德钦单独为一组。; 关键词深纹核桃种质资源遗传多样性遗传结构 SSR分子标记; Keywords Juglans sigillata germplasm resources genetic diversity genetic structure SSR molecular markers; 分类号 S664.1 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名球孢白僵菌中与致病相关的NRPS基因的克隆与表达被引量：1: 6; 作者原晓龙李桂凤李云琴王毅; 机构云南省林业和草原科学院沾益海峰省级自然保护区管护局; 出处《西部林业科学》 CAS 北大核心 2019年第6期135-139,共5页; 基金国家自然科学基金项目(31860177) 云南省应用基础研究计划面上项目(2016FB055) 云南省林业科学院创新基金项目(QN2018-01); 文摘以真菌球孢白僵菌为研究对象,以基因序列相似性为基础从球孢白僵菌基因组中挖掘获得Bbnrps1基因,再通过序列相似性和聚类分析等生物信息学方法推断该基因功能,并比较相同环境下不同的培养基配方对该基因表达水平差异等手段以寻找能够诱导该基因表达的最佳条件。结果表明,Bbnrps1基因的cDNA全长4032bp,编码1343个氨基酸;BbNRPS1是一种定位于细胞质基质,无信号肽具7个跨膜结构域的蛋白;BbNRPS1与羊毛状小孢子菌(Microsporum canis,XP_002842845)、Nannizzia gypsea(XP_003169294)、Xylona heveae(XP_018190776)聚为一支,可能负责参与ETP类毒素的生物合成。在以乳糖、葡萄糖、山梨醇和肌醇为碳源添加物的培养基上,Bbnrps1基因表达量较高,在以甘露糖和果糖为碳源添加物的培养基上表达量较低,在麦芽糖上不表达;在以牛肉浸粉(SGB)、胰蛋白胨(SGT)和马铃薯浸粉(SGP)为氮源添加物的培养基上表达量较高,在酪蛋白胨(SGC)上不表达。本研究有助于预测nrps基因功能,为异源表达球孢白僵菌中nrps基因奠定基础。; 关键词球孢白僵菌非核糖体多肽合成酶聚类分析基因克隆基因表达; Keywords Beauveria bassiana nonribosomal peptide synthetase phylogenetic analysis gene cloning /gene expression; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于二代测序哈巴乌头叶绿体基因组分析: 7; 作者马福仙魏健生耿云芬张汉尧; 机构西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室哈巴雪山省级自然保护区管护局; 出处《西部林业科学》 CAS 北大核心 2023年第1期175-181,共7页; 基金昆明市国际(对外)科技合作基地(GHJD-2020031) 云南省产业技术领军人才(YNWR-CYJS-2018-037) “气候变化影响下哈巴雪山珍稀濒危植物种质资源保存与人工繁育技术研究项目”共同资助。; 文摘为了解哈巴乌头叶绿体基因组特征及密码子偏好性,本研究采用Illumina HiSeq对哈巴乌头叶绿体基因组进行测序,组装获得完整叶绿体基因组序列,并利用CUSP和Codon W软件分析该物种叶绿体基因组密码子偏好性。结果显示:哈巴乌头叶绿体基因组全长155800 bp,是典型的四分结构,由1对长为29296 bp的IR、1个长为16864 bp的SSC和1个长86399 bp的LSC组成;该基因组包括84个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因;系统进化分析显示,哈巴乌头和中甸乌头聚在同一个分支;叶绿体基因组密码子的3个位置上GC含量依次为GC1(46.65%)>GC2(39.71%)>GC3(29.01%),说明其偏好以A/U结尾;有效密码子数(ENC)范围为36.77~58.98,ENC值>45的编码序列有36个,说明密码子偏性低;中性绘图等分析显示哈巴乌头叶绿体基因组密码子偏好性受选择的影响较大;最优密码子有14个,均以A/U结尾。本研究为哈巴乌头叶绿体基因工程、种源鉴定等研究提供参考依据。; 关键词哈巴乌头 Illumina测序叶绿体基因组密码子偏好性; Keywords Aconitum habaense Illumina sequencing chloroplast genome codon usage bias; 分类号 S567.239 [农业科学—中草药栽培]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	云南欧洲甜樱桃品种SSR鉴定及遗传多样性分析	杨跃仙段利武卯梅华王毅马山俊	《西南林业大学学报（自然科学）》 CAS 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	云南松林下干巴菌生长土壤的理化性质及有效态微量元素特征	张珊珊毛云玲冯志伟杨文忠	《西部林业科学》 CAS 北大核心	2020	7	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于转录组序列的非洲菊密码子偏好性分析	卢珍红原晓龙李绅崇单芹丽王毅	《西南林业大学学报（自然科学）》北大核心	2023	3	在线阅读下载PDF 职称材料
4	蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性分析	原晓龙刘音康洪梅陈中华李云琴王毅	《西南林业大学学报（自然科学）》 CAS 北大核心	2021	41	在线阅读下载PDF 职称材料
5	迪庆州核桃种质资源的遗传多样性与遗传结构	陆婷陈少瑜吴涛肖良俊	《西部林业科学》 CAS 北大核心	2021	6	在线阅读下载PDF 职称材料
6	球孢白僵菌中与致病相关的NRPS基因的克隆与表达	原晓龙李桂凤李云琴王毅	《西部林业科学》 CAS 北大核心	2019	1	在线阅读下载PDF 职称材料
7	基于二代测序哈巴乌头叶绿体基因组分析	马福仙魏健生耿云芬张汉尧	《西部林业科学》 CAS 北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料