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题名基于SSR标记的思茅松种质资源遗传多样性分析
被引量：3
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作者
陈少瑜
李江
陈伟
罗婷
陈绍安
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机构
云南省林业和草原科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室
云南省林业和草原科学院林业研究所
云南省林业和草原科学院普文热带林业研究所
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出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第3期532-541,共10页
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基金
云南省重点研发项目(202102AE090022)
云南省种子种业联合实验室首席科学家项目(202205AR070001-17)。
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文摘
【目的】揭示思茅松主要分布区内11个群体共338份种质资源遗传多样性水平和遗传结构状况,为思茅松育种群体构建及高轮次遗传改良提供理论依据。【方法】用筛选出的18对引物进行SSR-PCR扩增,产物经毛细管电泳后用PowerMarker v3.25、GenALEx v6.4.1及Structure 2.3.4等软件分析思茅松种质资源的遗传多样性。【结果】18对SSR引物共检测到120个等位基因,平均每个位点的等位基因数为6.667个;种质资源的平均期望杂合度(H_(e))为0.524;平均Shannon信息指数(I)为1.016;平均多态信息指数(PIC)为0.468。思茅松种质资源的遗传变异主要来源于群体内的个体。种质资源的群体分化系数(F_(ST))平均为0.091,即群体间的遗传变异只占总变异的9.1%,分子方差分析(AMOVA)得到了同样的结果。各位点的基因流(N_(m))平均为4.627(N_(m)>1),较大的基因流减小了群体间的分化。STRUCTURE分析将338份思茅松种质资源划分为2个类群,基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类将11个群体划分成3组,普洱市6个群体聚为一组;西双版纳州的2个群体、临沧市和保山市的各1个群体聚为一组;德宏州的1个群体单独为一组。【结论】思茅松种质资源具有丰富的遗传多样性,遗传变异主要来源于群体内,在进行思茅松的遗传改良时,应根据其遗传结构特征,重点选择多样性高的群体,也要特别关注对群体内优良单株的选择。
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关键词
思茅松
种质资源
SSR分子标记
遗传多样性
遗传结构
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Keywords
Pinus kesiya var.langbianensis
Germplasm resouces
SSR molecular markers
Genetic diversity
Genetic structure
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分类号
S72
[农业科学—林木遗传育种]
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题名迪庆州核桃种质资源的遗传多样性与遗传结构
被引量：6
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作者
陆婷
陈少瑜
吴涛
肖良俊
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机构
云南省林业和草原技术推广总站
云南省林业和草原科学院经济林研究所
云南省林业和草原科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室
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出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2021年第2期71-77,共7页
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基金
国家自然科学基金项目(3166024)。
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文摘
利用SSR分子标记技术对云南省迪庆藏族自治州3个群体共161份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示资源的遗传多样性水平及遗传结构特征,为其保护和利用提供依据。结果表明:18对SSR引物对161份DNA样本进行扩增,共检测到171个等位基因,平均每对引物9.5个。3个群体的观察杂合度(H_(o))和期望杂合度(H_(e))的变化范围分别为0.390~0.580和0.580~0.619,平均值分别为0.467和0.598;Shannon信息指数(I)介于1.153~1.313之间,平均为1.231,数据表明迪庆州核桃种质资源的遗传多样性属于中等水平。群体间的遗传分化系数(F_(ST))介于0.0052~0.2253之间,平均为0.0652,表明遗传变异主要来源于群体内的个体,仅有6.52%来源于群体间,各位点的基因流(N_(m))平均为4.2663(N_(m)>1),群体间的基因交流阻止了群体间的分化。STRUCTURE分析将161份核桃资源分成3个类群,而基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类将3个群体划分成2组,维西和香格里拉聚为一组,德钦单独为一组。
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关键词
深纹核桃
种质资源
遗传多样性
遗传结构
SSR分子标记
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Keywords
Juglans sigillata
germplasm resources
genetic diversity
genetic structure
SSR molecular markers
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分类号
S664.1
[农业科学—果树学]
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