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槟榔江水牛SREBF1基因克隆、分子特征及组织表达分析
1
作者
刀文彬
欧阳依娜
+3 位作者
梁建平
范新阳
陈馨瑶
苗永旺
《云南农业大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第1期61-69,共9页
【目的】阐明水牛固醇调节元件结合转录因子1(sterol regulatory element binding transcription factor 1,SREBF1)的分子特征和组织表达特异性,初步揭示其分子功能。【方法】以槟榔江水牛为研究对象,采用RT-PCR技术克隆水牛SREBF1基因...
【目的】阐明水牛固醇调节元件结合转录因子1(sterol regulatory element binding transcription factor 1,SREBF1)的分子特征和组织表达特异性,初步揭示其分子功能。【方法】以槟榔江水牛为研究对象,采用RT-PCR技术克隆水牛SREBF1基因完整编码序列(coding sequence,CDS);利用生物信息学方法分析SREBF1分子特征;采用qPCR技术检测SREBF1在泌乳期水牛多个组织中的表达特异性。【结果】水牛SREBF1 CDS全长3438 bp,编码1145个氨基酸残基组成的亲水蛋白;SREBF1包含1个bHLHzip_SREBP1(AA319~393)DNA结合结构域,无跨膜结构和信号肽,主要定位于细胞核和内质网,主要功能是结合并调控DNA转录、参与脂质代谢等。水牛与其他牛科物种SREBF1在一级结构、理化特征、结构域和高级结构上高度相似。在基于SREBF1氨基酸序列构建的系统发育树上,水牛与其他牛科物种聚为1类。在泌乳期水牛的8个组织中,SREBF1基因在乳腺中的表达水平最高,其次是肝脏、骨骼肌、垂体、肾脏,在脾脏、瘤胃和心脏中的表达水平较低。【结论】水牛与其他牛科物种SREBF1氨基酸序列具有高度的相似性。水牛SREBF1可调控DNA转录,在脂质代谢旺盛的组织中发挥作用。
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关键词
槟榔江水牛
SREBF1基因
分子特征
组织表达
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题名
槟榔江水牛SREBF1基因克隆、分子特征及组织表达分析
1
作者
刀文彬
欧阳依娜
梁建平
范新阳
陈馨瑶
苗永旺
机构
云南
农业大学动物
科学技术
学院
云南
农业大学动物遗传育种研究所
云南省
畜牧兽医
科学
院
云南省德宏州科学技术创新中心
腾冲市巴福乐槟榔江水牛良种繁育有限公司
出处
《云南农业大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第1期61-69,共9页
基金
国家自然科学基金项目(32260822,31760659)
云南省重大科技专项计划项目(202202AE09-0005)。
文摘
【目的】阐明水牛固醇调节元件结合转录因子1(sterol regulatory element binding transcription factor 1,SREBF1)的分子特征和组织表达特异性,初步揭示其分子功能。【方法】以槟榔江水牛为研究对象,采用RT-PCR技术克隆水牛SREBF1基因完整编码序列(coding sequence,CDS);利用生物信息学方法分析SREBF1分子特征;采用qPCR技术检测SREBF1在泌乳期水牛多个组织中的表达特异性。【结果】水牛SREBF1 CDS全长3438 bp,编码1145个氨基酸残基组成的亲水蛋白;SREBF1包含1个bHLHzip_SREBP1(AA319~393)DNA结合结构域,无跨膜结构和信号肽,主要定位于细胞核和内质网,主要功能是结合并调控DNA转录、参与脂质代谢等。水牛与其他牛科物种SREBF1在一级结构、理化特征、结构域和高级结构上高度相似。在基于SREBF1氨基酸序列构建的系统发育树上,水牛与其他牛科物种聚为1类。在泌乳期水牛的8个组织中,SREBF1基因在乳腺中的表达水平最高,其次是肝脏、骨骼肌、垂体、肾脏,在脾脏、瘤胃和心脏中的表达水平较低。【结论】水牛与其他牛科物种SREBF1氨基酸序列具有高度的相似性。水牛SREBF1可调控DNA转录,在脂质代谢旺盛的组织中发挥作用。
关键词
槟榔江水牛
SREBF1基因
分子特征
组织表达
Keywords
Binglangjiang buffalo
SREBF1 gene
molecular characteristics
tissue expression
分类号
S823.912 [农业科学—畜牧学]
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1
槟榔江水牛SREBF1基因克隆、分子特征及组织表达分析
刀文彬
欧阳依娜
梁建平
范新阳
陈馨瑶
苗永旺
《云南农业大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
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