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题名杧果MiNPR1抗病基因克隆及生物信息学分析
被引量：1
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作者
陈思宇
詹儒林
姜成东
柳凤
张国辉
姚全胜
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机构
海南大学园艺学院
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/海南省热带园艺产品采后生理与保鲜重点实验室/农业部热带果树生物学重点实验室
云南省华坪县有机晚熟杧果研究中心
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出处
《中国南方果树》
北大核心
2023年第4期45-50,共6页
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基金
海南省重点研发计划(ZDYF2021XDNY158)
海南省自然科学基金(320QN319)
中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630062022014)资助。
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文摘
NPR1是水杨酸(SA)介导的植物抗病通路中的转录共激活因子。本试验采用RT-PCR技术从杧果Mangifera indica叶片中分离得到MiNPR1-1和MiNPR1-2。序列分析显示,MiNPR1-1基因编码氨基酸471个,MiNPR1-2基因编码氨基酸445个。2种MiNPR1蛋白皆含BTB/POZ结构域和锚蛋白重复序列,非跨膜蛋白且无信号肽,为不稳定酸性亲水蛋白。蛋白结构预测表明,MiNPR1蛋白由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-折叠构成,三级结构与二级结构相符。分析进化关系发现,MiNPR1-1蛋白为单独分支起源,MiNPR1-2与阿月浑子Pistacia vera的XP_031280798.1聚类为一簇。本研究克隆了杧果NPR1基因,预测其编码蛋白特征,为后续研究该基因在杧果上的功能及培育杧果优良抗病品种提供参考。
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关键词
杧果
MiNPR1
基因克隆
生物信息学
进化树
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分类号
S436.67
[农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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