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烟草脉带花叶病毒云南分离物全基因序列分析
被引量:
3
1
作者
秦西云
卢训
+3 位作者
方琦
尹跃艳
丁铭
张仲凯
《中国烟草科学》
CSCD
北大核心
2015年第5期44-46,共3页
应用电子显微镜负染色法在烟草叶片斑驳、脉间褪绿病样中观察到马铃薯Y病毒属病毒粒子,通过马铃薯Y病毒属兼并引物扩增获得目的片段,序列分析表明病样中病原物为TVBMV,命名为YN-YX-TVBMV。根据Gen Bank已知序列,分别合成引物,对YN-YX-TV...
应用电子显微镜负染色法在烟草叶片斑驳、脉间褪绿病样中观察到马铃薯Y病毒属病毒粒子,通过马铃薯Y病毒属兼并引物扩增获得目的片段,序列分析表明病样中病原物为TVBMV,命名为YN-YX-TVBMV。根据Gen Bank已知序列,分别合成引物,对YN-YX-TVBMV进行克隆及测序,得到一条6047 bp的不完整的病毒基因组核苷酸序列,将该序列与国内报道的TVBMV全基因序列进行对比分析发现该分离物与报道的TVBMV其他分离物具有明显的地域分布差异,即云南获得的分离物均独立聚为一簇。
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关键词
烟草脉带花叶病毒
全基因
分析
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职称材料
马铃薯Y病毒云南昭通烟草分离物的检测及年度间差异比较
被引量:
4
2
作者
卢训
丁铭
+4 位作者
方琦
黄韡
游堂贵
秦西云
张仲凯
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期56-60,共5页
利用DAS-ELISA检测试剂盒检测昭通烟草脉斑病样品,结果表明存在马铃薯Y病毒O株系和马铃薯Y病毒N株系两个不同株系病毒。利用Sprimer和M4引物扩增、克隆、测序,得到长度为1 771bp目的片段,该片段包含病毒的外壳蛋白基因序列、3′UTR序列...
利用DAS-ELISA检测试剂盒检测昭通烟草脉斑病样品,结果表明存在马铃薯Y病毒O株系和马铃薯Y病毒N株系两个不同株系病毒。利用Sprimer和M4引物扩增、克隆、测序,得到长度为1 771bp目的片段,该片段包含病毒的外壳蛋白基因序列、3′UTR序列以及部分Nib基因序列;序列分析表明与湖南HN-2分离物(GenBankNo.GQ200836)和美国NE-11分离物(GenBank No.DQ157180)核苷酸序列相似性均为98%,系统进化分析表明其具有较近的亲缘关系。
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关键词
马铃薯Y病毒
检测
变异分析
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职称材料
题名
烟草脉带花叶病毒云南分离物全基因序列分析
被引量:
3
1
作者
秦西云
卢训
方琦
尹跃艳
丁铭
张仲凯
机构
云南省
烟草
农业
科学
研究
院
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南农业基因资源与种质创制重点实验室
出处
《中国烟草科学》
CSCD
北大核心
2015年第5期44-46,共3页
基金
中国烟草总公司科技项目"全国烟草有害生物调查"(110200902065)
云南省烟草公司项目"云南烟草有害生物调查"(2010YN19)
文摘
应用电子显微镜负染色法在烟草叶片斑驳、脉间褪绿病样中观察到马铃薯Y病毒属病毒粒子,通过马铃薯Y病毒属兼并引物扩增获得目的片段,序列分析表明病样中病原物为TVBMV,命名为YN-YX-TVBMV。根据Gen Bank已知序列,分别合成引物,对YN-YX-TVBMV进行克隆及测序,得到一条6047 bp的不完整的病毒基因组核苷酸序列,将该序列与国内报道的TVBMV全基因序列进行对比分析发现该分离物与报道的TVBMV其他分离物具有明显的地域分布差异,即云南获得的分离物均独立聚为一簇。
关键词
烟草脉带花叶病毒
全基因
分析
Keywords
TVBMV
complete genomic sequence
analysis
分类号
S435.72 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
马铃薯Y病毒云南昭通烟草分离物的检测及年度间差异比较
被引量:
4
2
作者
卢训
丁铭
方琦
黄韡
游堂贵
秦西云
张仲凯
机构
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南农业基因资源与种质创制重点实验室
云南省
烟草公司昭通市公司
云南省
烟草
农业
科学
研究
院
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期56-60,共5页
基金
云南省烟草公司科技计划项目(09YN034
2010YN19)
中国烟草总公司重点科技项目(110200902066)
文摘
利用DAS-ELISA检测试剂盒检测昭通烟草脉斑病样品,结果表明存在马铃薯Y病毒O株系和马铃薯Y病毒N株系两个不同株系病毒。利用Sprimer和M4引物扩增、克隆、测序,得到长度为1 771bp目的片段,该片段包含病毒的外壳蛋白基因序列、3′UTR序列以及部分Nib基因序列;序列分析表明与湖南HN-2分离物(GenBankNo.GQ200836)和美国NE-11分离物(GenBank No.DQ157180)核苷酸序列相似性均为98%,系统进化分析表明其具有较近的亲缘关系。
关键词
马铃薯Y病毒
检测
变异分析
Keywords
PVY
detection
variation analysis
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
烟草脉带花叶病毒云南分离物全基因序列分析
秦西云
卢训
方琦
尹跃艳
丁铭
张仲凯
《中国烟草科学》
CSCD
北大核心
2015
3
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职称材料
2
马铃薯Y病毒云南昭通烟草分离物的检测及年度间差异比较
卢训
丁铭
方琦
黄韡
游堂贵
秦西云
张仲凯
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
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