利用微卫星DNA标记分析槟榔江水牛群体遗传特征 被引量：6

1

作者 刘伟 苗永旺 +3 位作者 李大林 唐贺 张慧芳 章纯熙 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1543-1549,共7页

槟榔江水牛是近年在我国云南西部发现的第一个本土河流型水牛。为了揭示其群体遗传多样性、群体遗传组成、其与河流型和沼泽型水牛的遗传关系及沼泽型水牛对该水牛的基因渗入等重要遗传背景信息,本研究采用30个微卫星DNA标记对141份槟... 槟榔江水牛是近年在我国云南西部发现的第一个本土河流型水牛。为了揭示其群体遗传多样性、群体遗传组成、其与河流型和沼泽型水牛的遗传关系及沼泽型水牛对该水牛的基因渗入等重要遗传背景信息,本研究采用30个微卫星DNA标记对141份槟榔江水牛样品和对照群体24份河流型水牛(摩拉水牛)样品、41份沼泽型水牛(滇东南水牛)样品进行了检测分析。结果,在槟榔江水牛群体中共检测到253个等位基因,其中,54个为3个群体所共享的等位基因,58个为只在槟榔江水牛与摩拉水牛间共享的等位基因,73个为只在槟榔江水牛与滇东南水牛间共享的等位基因,其余68个等位基因为该群体所独有。槟榔江水牛平均等位基因数、平均表观杂合度、平均期望杂合度和多态信息含量等参数均显著高于对照组群体,分别为8.433 3、0.640 5、0.600 9和0.594 7。该水牛群体近交系数FIS值为0.061 9。槟榔江水牛与摩拉水牛间的DA遗传距离为最小(0.114 4),在NJ树上聚为一支;而滇东南水牛与槟榔江水牛和摩拉水牛间的遗传距离较大(分别为0.382 9和0.555 3),其在NJ树上单独聚为一支。群体遗传结构分析显示,槟榔江水牛遗传组分为河流型与沼泽型2种类型水牛混合的模式(当K=2时),整个群体中有相当数量的个体存在沼泽型水牛的遗传渗入(群体中沼泽型水牛遗传组分为0.067 2)。结果揭示,槟榔江水牛遗传资源独特,群体遗传多样性丰富,但该群体杂合子缺乏,且存在一定沼泽型水牛的基因渗入。 展开更多

关键词 槟榔江水牛 微卫星DNA标记 遗传变异 基因渗入

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固定化酶的研究方法概述 被引量：11

2

作者 李小冬 吴嘉 +3 位作者 贾东晨 万永虎 乔昕 乔敏 《中国酿造》 CAS 北大核心 2011年第11期5-9,共5页

固定化酶在现代的工业生产中扮演着举足轻重的作用,从固定化酶的发展过程着手,重点描述了传统的固定化酶的制备方法,组合固定化及交联酶晶体(CLECs),交联酶聚集体(CLEAs)等。并对这些方法的研究手段,应用前景进行了介绍。

关键词 固定化酶 组合固定化 交联酶晶体 交联酶聚集体

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74种鸟类线粒体基因组碱基组成及特征分析 被引量：12

3

作者 高英凯 苗永旺 +3 位作者 苏小茜 池振奋 俞赟 姜枫 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期51-58,共8页

在鸟类线粒体基因组中，不同物种的线粒体碱基组成和特性存在明显的差异。截至2008年5月，Gen-Bank细胞器基因组资源数据库共公布了74种鸟类线粒体全基因组数据。本研究利用已公布的鸟类线粒体基因组全序列分析其碱基组成特征。结果表... 在鸟类线粒体基因组中，不同物种的线粒体碱基组成和特性存在明显的差异。截至2008年5月，Gen-Bank细胞器基因组资源数据库共公布了74种鸟类线粒体全基因组数据。本研究利用已公布的鸟类线粒体基因组全序列分析其碱基组成特征。结果表明：（1）鸟类线粒体基因组密码子第2位的GC含量值波动范围十分狭窄，而密码子第3位的GC含量值波动范围很大。（2）密码子第3位碱基中C的含量波动范围较大，为32．60％～50．70％。（3）线粒体基因组GC含量主要由密码子第3位的碱基C和T的变化引起。（4）密码子第3位碱基的GC含量与线粒体基因组的GC含量的变化存在相关性。本次结果为今后深入研究鸟类线粒体基因组提供了一定的借鉴和参考资料。 展开更多

关键词 鸟类 线粒体基因组 碱基组成 GC含量 特征

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文山山地乌骨鸡微卫星DNA多态性分析 被引量：10

4

作者 苗永旺 叶朗惠 +2 位作者 陈涛 霍金龙 李大林 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期63-66,共4页

利用位于家鸡24条染色体上的33个微卫星标记对云南文山山地乌骨鸡50个个体进行了遗传多样性检测。共检测到118个等位基因，每个座位等位基因数目从2到9个不等，平均等位基因数为3．5758±1．5619，有效等位基因数在1．4274—6．125... 利用位于家鸡24条染色体上的33个微卫星标记对云南文山山地乌骨鸡50个个体进行了遗传多样性检测。共检测到118个等位基因，每个座位等位基因数目从2到9个不等，平均等位基因数为3．5758±1．5619，有效等位基因数在1．4274—6．1250之间，平均为2．9750±1．1389；群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0．8927±0．2172，0．6214±0．1259和0．5447±0．1528。研究结果表明：文山山地乌骨鸡群体内存在丰富的遗传多样性。 展开更多

关键词 文山山地乌骨鸡 微卫星标记 遗传变异 多态信息含量 杂合度

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4个黄牛群体黑素皮质素受体1(MC1R)基因变异研究 被引量：5

5

作者 唐贺 高英凯 苗永旺 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期639-643,共5页

为了评价E(extension)座位对牛毛色性状的影响,采用DNA序列分析和PCR-RFLP技术对云南地区4个黄牛群体(3个本地群体和1个引进品种)的黑素皮质素受体1(MC1R)基因的编码区进行了基因特征分析和群体变异检测。结果,在文山黄牛、昭通黄牛和... 为了评价E(extension)座位对牛毛色性状的影响,采用DNA序列分析和PCR-RFLP技术对云南地区4个黄牛群体(3个本地群体和1个引进品种)的黑素皮质素受体1(MC1R)基因的编码区进行了基因特征分析和群体变异检测。结果,在文山黄牛、昭通黄牛和短角牛中发现E+和e2种等位基因,检测到E+/E+、E+/e和e/e3种基因型。在文山黄牛中E+和e等位基因的频率分别为0.54和0.46,在昭通黄牛中分别为0.70和0.30;而在迪庆黄牛中共检测到E+、ED和e3种等位基因,它们的频率分别为0.76、0.14和0.10,该群体存在E+/E+、ED/ED、E+/ED、E+/e和ED/e5种基因型,未发现e/e型个体。与所研究个体的毛色性状相联系,发现E座位对牛的毛色有重要影响,E+和ED等位基因与黑色表型有关,而e等位基因与红色表型有关,但黄色、棕色和红色表型还与其它座位基因相关联。 展开更多

关键词 牛 云南 黑素皮质素受体1基因 毛色 PCR-RFLP

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明光小耳猪遗传多样性分析 被引量：4

6

作者 霍金龙 苗永旺 +4 位作者 霍海龙 李大林 沈雪鹰 屈在久 尹玉安 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期272-279,共8页

为深入了解明光小耳猪群体遗传结构，使之得到更好的保护和利用，采用分布在家猪19对染色体上的76个微卫星标记对该猪种65个样品进行群体遗传变异分析。共检测到343个等位基因，每个座位的等位基因数从2到9不等，有效等位基因数在1．223... 为深入了解明光小耳猪群体遗传结构，使之得到更好的保护和利用，采用分布在家猪19对染色体上的76个微卫星标记对该猪种65个样品进行群体遗传变异分析。共检测到343个等位基因，每个座位的等位基因数从2到9不等，有效等位基因数在1．2239～4．8079之间，平均每个座位等位基因数为（4．5132±1．2055）个，有效等位基因数为（3．2169±0．7736）个，群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0．9442±0．1595、0．6685±0．0945和0．6103±0．1083。结果表明，明光小耳猪群体遗传变异丰富。 展开更多

关键词 明光小耳猪 微卫星标记 等位基因数 有效等位基因数 杂合度 多态信息含量

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水牛催乳素基因第3外显子群体遗传特征分析 被引量：2

7

作者 袁峰 苗永旺 +4 位作者 李大林 刘丽仙 熊飞 刘伟 贡潘偏抽 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期312-316,共5页

催乳素基因(PRL)第3外显子(exon 3)对奶牛产奶量、乳脂产量和乳蛋白产量有显著影响,但在水牛中该基因的遗传特征及其与产奶性状是否有遗传关联目前还不清楚。本研究采用PCR-SSCP并结合PCR产物直接测序技术,分析了沼泽型水牛和河流型水牛... 催乳素基因(PRL)第3外显子(exon 3)对奶牛产奶量、乳脂产量和乳蛋白产量有显著影响,但在水牛中该基因的遗传特征及其与产奶性状是否有遗传关联目前还不清楚。本研究采用PCR-SSCP并结合PCR产物直接测序技术,分析了沼泽型水牛和河流型水牛共12个群体275个个体PRL exon 3的遗传变异,结果表明:水牛PRL exon 3由108个核苷酸组成,编码36个氨基酸,在水牛群体中未检测到单核苷酸多态性位点(SNPs),PRL exon 3与水牛产奶量之间没有直接相关性。通过序列比对发现在不同物种中PRL exon 3具有高度保守性。但在PRL第2内含子(intron 2)的2 265 nt和2 335 nt分别检测到G>A突变和C>T突变,其中2 335 nt位点突变仅在2头槟榔江水牛中检测到。 展开更多

关键词 河流型水牛 沼泽型水牛 催乳素 EXON 3 PCR—SSCP

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真菌线粒体基因组大小变化 被引量：4

8

作者 杨丹 米飞 +2 位作者 董建勇 张云润 吴金燕 《安徽农业科学》 CAS 2016年第1期36-39,共4页

近年来研究表明,真菌线粒体基因组大小存在明显变化,范围在10 kb到100多kb之间。这种变化引起了真菌学家、遗传学家及进化生物学家的浓厚兴趣。该研究综述了影响真菌物种内及物种间线粒体基因组大小变化的一些因素,包括内含子、线粒体... 近年来研究表明,真菌线粒体基因组大小存在明显变化,范围在10 kb到100多kb之间。这种变化引起了真菌学家、遗传学家及进化生物学家的浓厚兴趣。该研究综述了影响真菌物种内及物种间线粒体基因组大小变化的一些因素,包括内含子、线粒体质粒和其他可移动遗传因子。了解和认识真菌线粒体基因组的遗传变化,可以更好地帮助理解真菌乃至其他真核生物的进化。 展开更多

关键词 线粒体 基因组尺寸 内含子 线粒体质粒 可移动因子

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水牛ABCG2基因第9外显子群体遗传特征分析 被引量：2

9

作者 李卓然 李卫真 +5 位作者 苗永旺 李大林 袁跃云 袁峰 刘丽仙 章纯熙 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期188-192,197,共6页

三磷酸腺苷结合转运蛋白G超家族成员2(ABCG2)对普通奶牛泌乳性状有直接影响。水牛中该基因的遗传特征与产奶性状间是否有遗传关联目前还不十分清楚。本文采用PCR-SSCP和PCR产物直接测序相结合的技术,对4个河流型水牛群体和9个沼泽型水... 三磷酸腺苷结合转运蛋白G超家族成员2(ABCG2)对普通奶牛泌乳性状有直接影响。水牛中该基因的遗传特征与产奶性状间是否有遗传关联目前还不十分清楚。本文采用PCR-SSCP和PCR产物直接测序相结合的技术,对4个河流型水牛群体和9个沼泽型水牛群体共计466个个体的ABCG2基因第9外显子进行了变异检测。结果表明,水牛ABCG2基因第9外显子由251个核苷酸组成,所有的河流型和沼泽型水牛序列相同,未发现SNP位点,但在第9内含子内检测到1个T>C替换(g.SNP44769 T>C)。与GenBank数据库中已发表的牛科物种同源序列比对后发现,数据库中一条河流型水牛序列该外显子第66位核苷酸处有1个G>A替换(c.SNP1018 G>A),导致所编码的氨基酸发生p.V340I的改变;与普通牛、山羊和绵羊该基因第9外显子序列的核苷酸差异位点个数分别为5,8和11个,表明水牛与其他牛科物种间具有较大的遗传差异。本文结果提示ABCG2基因第9外显子在水牛中已纯化固定,且与水牛产奶量性状间无直接关联性。 展开更多

关键词 河流型水牛 沼泽型水牛 三磷酸腺苷结合转运蛋白 第9外显子 PCR-SSCP

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应用UV-X-IP分析酿酒酵母HSF和靶DNA的相互作用

10

作者 刘开辉 丁小维 +2 位作者 邓百万 陈文强 张乐民 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期109-113,共5页

利用紫外激光交联和免疫沉淀技术(UV laser crosslinking and immunoprecipitation,UV-X-IP)分析原核表达的酿酒酵母热激因子(heat shock factors,HSFs)和片段化的基因组靶DNA的相互作用。分别在ScSSA1、ScSSA4启动子区和编码区设计引... 利用紫外激光交联和免疫沉淀技术(UV laser crosslinking and immunoprecipitation,UV-X-IP)分析原核表达的酿酒酵母热激因子(heat shock factors,HSFs)和片段化的基因组靶DNA的相互作用。分别在ScSSA1、ScSSA4启动子区和编码区设计引物对免疫沉淀的DNA进行PCR分析。结果发现,紫外激光交联和免疫沉淀DNA库中富集了ScSSA1、ScSSA4启动子区HSF结合的DNA片段,而没有编码区DNA,表明HSF特异结合了靶DNA。从未经紫外激光交联样品的免疫沉淀DNA库中未获得相应PCR扩增产物,说明紫外激光在酿酒酵母HSF与靶DNA之间形成共价结合中起重要作用。 展开更多

关键词 紫外激光交联 免疫沉淀 酿酒酵母 热激因子 靶DNA

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一株耐酒精酿酒酵母的絮凝性研究

11

作者 吴嘉 贾东晨 +2 位作者 李小冬 万永虎 乔敏 《中国酿造》 CAS 2012年第3期25-27,共3页

通过对一株耐酒精酿酒酵母菌株1912的絮凝性进行研究,结果表明,该菌株的絮凝出现在稳定期,当培养基的pH值为4.5、Ca2+浓度为0.1mol/L时,该菌株细胞的絮凝程度较高,其絮凝细胞达79.01%。其絮凝受甘露糖、麦芽糖、葡萄糖的抑制。

关键词 酿酒酵母 絮凝 优化

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紫外激光交联和染色质免疫沉淀技术及其应用

12

作者 刘开辉 丁小维 +2 位作者 邓百万 陈文强 张乐民 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第20期6058-6059,6061,共3页

紫外激光交联和染色质免疫沉淀技术(UV laser crosslinking and chromatin immunoprecipitation,UV-X-ChIP)是研究蛋白质与DNA的相互作用及鉴定转录因子靶DNA的一条新途径。该技术结合DNA芯片、Southern杂交及DNA文库的构建可用于研究... 紫外激光交联和染色质免疫沉淀技术(UV laser crosslinking and chromatin immunoprecipitation,UV-X-ChIP)是研究蛋白质与DNA的相互作用及鉴定转录因子靶DNA的一条新途径。该技术结合DNA芯片、Southern杂交及DNA文库的构建可用于研究蛋白质与DNA的相互作用及高通量筛选已知转录因子在全基因组范围内的结合位点,这为转录因子调控网络的绘制奠定基础。笔者对紫外激光交联和染色质免疫沉淀技术及应用作一综述。 展开更多

关键词 紫外激光交联 染色质免疫沉淀 转录因子

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关于两个独立二项总体推断的Bayes样本容量的确定

13

作者 赵占平 苗永旺 蔡威 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 2008年第6期836-839,共4页

样本容量的确定在现代生物医学研究以及在对两个独立的二项实验进行统计分析时,是经常遇到的一个问题。在实验设计阶段,往往需要计算最佳样本容量,目的是为了保证两个二项参数差的估计值与真实值的误差在所要求的范围内概率最大。巧妙... 样本容量的确定在现代生物医学研究以及在对两个独立的二项实验进行统计分析时,是经常遇到的一个问题。在实验设计阶段,往往需要计算最佳样本容量,目的是为了保证两个二项参数差的估计值与真实值的误差在所要求的范围内概率最大。巧妙地利用先验信息是实验设计的一个关键环节,目前正在广泛应用的样本量的计算公式在利用先验信息时通常采用点估计的形式。本文提出了确定样本容量的Bayes风险准则,给出了样本容量计算的Monte Carlo方法,并把这些方法应用到估计两个二项比例差的实验设计上。最后考虑了0-1损失函数和平方损失函数下计算样本容量的Bayes方法。 展开更多

关键词 Bayes样本容量 Beta先验分布 Bayes风险 边际后验分布

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蛋白质的连接模型及机理研究

14

作者 杨力权 桑鹏 李珍贵 《楚雄师范学院学报》 2013年第6期61-64,101,共5页

蛋白质是通过与其他蛋白质或生物分子的识别和连接来发挥功能的,阐明连接的驱动力及机理对理解蛋白质的功能发挥有很大帮助。文章对三种蛋白质连接的模型进行了描述和比较,对三种模型的驱动力和机理进行了研究,强调了蛋白质的连接是由... 蛋白质是通过与其他蛋白质或生物分子的识别和连接来发挥功能的,阐明连接的驱动力及机理对理解蛋白质的功能发挥有很大帮助。文章对三种蛋白质连接的模型进行了描述和比较,对三种模型的驱动力和机理进行了研究,强调了蛋白质的连接是由热力学的熵焓互补平衡控制的过程。 展开更多

关键词 蛋白质连接 连接机理 构象选择模型 吉布斯自由能 熵焓互补

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福安水牛线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析 被引量：11

15

作者 张瑞光 梁建平 +3 位作者 陈云 林斌 陈诚 苗永旺 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期525-529,共5页

采用PCR产物直接测序的方法对20头福安水牛的线粒体DNA(mtDNA)D-LOOP区全序列进行了测定,并对所得数据进行了比对和分析。结果共检测到16种单倍型,48个核苷酸多态位点,其中单一变异位点9个,简约信息位点39个。在所分析的序列中,T,C,A和... 采用PCR产物直接测序的方法对20头福安水牛的线粒体DNA(mtDNA)D-LOOP区全序列进行了测定,并对所得数据进行了比对和分析。结果共检测到16种单倍型,48个核苷酸多态位点,其中单一变异位点9个,简约信息位点39个。在所分析的序列中,T,C,A和G的平均含量分别为27.9%,25.6%,31.9%和14.6%,核苷酸多样度为0.019 46±0.002 88,单倍型多样度为0.957±0.032,序列间平均核苷酸差异数是17.238,结果显示福安水牛线粒体DNA遗传多样性丰富。系统发育和遗传距离分析显示:福安水牛与河流型水牛存在较大差异,其自身聚为支持率极高的两大支,即世系A和世系B,揭示福安水牛存在两个母系血统来源。 展开更多

关键词 福安水牛 MTDNA D-LOOP 遗传多态性 遗传分化

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