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基于高通量转录组测序的辣木叶粉对小鼠肝脏差异表达基因的影响
被引量：
3
1
作者
解静
曾寰宇
+6 位作者
段胜常
戴天浥
彭磊
郝若诗
史崇颖
田洋
盛军
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2018年第3期456-467,共12页
【目的】辣木(Moringa oleifera Lam.)是一种营养价值丰富的新型食品或饲料资源,但是食用或饲用辣木后对动物机体代谢的调控机制仍不清楚。【方法】18只小鼠随机分为2组,即辣木叶粉饲料组(50%MO)和基础饲料组(对照组)。在饲料干预的第3...
【目的】辣木(Moringa oleifera Lam.)是一种营养价值丰富的新型食品或饲料资源,但是食用或饲用辣木后对动物机体代谢的调控机制仍不清楚。【方法】18只小鼠随机分为2组,即辣木叶粉饲料组(50%MO)和基础饲料组(对照组)。在饲料干预的第3、10和25天每组随机取3只小鼠进行解剖,采集肝脏组织样品,并利用高通量RNA-seq测序技术对小鼠肝脏进行RNA测序,使用Top Hat v2.0.13软件将测序得到的reads序列与小鼠(GRCm38)参考基因组序列比对,计算表达量并鉴定差异表达基因,同时对差异表达基因参与的GO功能及代谢途径进行富集。【结果】从18个样本中共获得转录组数据约109.063 Gb,1 136 175 196条clean reads;与对照组相比,辣木叶粉饲料组表达上调和下调的差异表达基因共有1 227个;GO功能分类注释发现,第3、10和25天的差异基因都主要集中在细胞过程(cellular process)、细胞(cell)和结合(binding)3个过程;差异基因显著富集的KEGG代谢通路有37条(P<0.05)。【结论】辣木叶粉对小鼠肝脏中的过氧化物酶体、病毒性心肌炎和类固醇生物合成等代谢通路有一定影响。
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关键词
辣木叶粉
肝脏转录组
高通量RNA测序
差异表达基因
代谢通路
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题名
基于高通量转录组测序的辣木叶粉对小鼠肝脏差异表达基因的影响
被引量：
3
1
作者
解静
曾寰宇
段胜常
戴天浥
彭磊
郝若诗
史崇颖
田洋
盛军
机构
云南农业大学
动物科学技术学院
云南
辣木研究所
云南农业大学生物大数据重点实验室
云南
省高原特色
农业
产业研究院
云南农业大学
食品科学技术学院
云南农业大学
普洱茶学教育部
重点
实验
出处
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2018年第3期456-467,共12页
基金
农业部热作技术试验示范项目-辣木产品加工示范(K2500053)。
文摘
【目的】辣木(Moringa oleifera Lam.)是一种营养价值丰富的新型食品或饲料资源,但是食用或饲用辣木后对动物机体代谢的调控机制仍不清楚。【方法】18只小鼠随机分为2组,即辣木叶粉饲料组(50%MO)和基础饲料组(对照组)。在饲料干预的第3、10和25天每组随机取3只小鼠进行解剖,采集肝脏组织样品,并利用高通量RNA-seq测序技术对小鼠肝脏进行RNA测序,使用Top Hat v2.0.13软件将测序得到的reads序列与小鼠(GRCm38)参考基因组序列比对,计算表达量并鉴定差异表达基因,同时对差异表达基因参与的GO功能及代谢途径进行富集。【结果】从18个样本中共获得转录组数据约109.063 Gb,1 136 175 196条clean reads;与对照组相比,辣木叶粉饲料组表达上调和下调的差异表达基因共有1 227个;GO功能分类注释发现,第3、10和25天的差异基因都主要集中在细胞过程(cellular process)、细胞(cell)和结合(binding)3个过程;差异基因显著富集的KEGG代谢通路有37条(P<0.05)。【结论】辣木叶粉对小鼠肝脏中的过氧化物酶体、病毒性心肌炎和类固醇生物合成等代谢通路有一定影响。
关键词
辣木叶粉
肝脏转录组
高通量RNA测序
差异表达基因
代谢通路
Keywords
Moringa oleifera leaves powder
liver transcriptome
high-throughput RNA sequencing
differential expression gene
metabolic pathway
分类号
R966 [医药卫生—药理学]
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作者
出处
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被引量
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1
基于高通量转录组测序的辣木叶粉对小鼠肝脏差异表达基因的影响
解静
曾寰宇
段胜常
戴天浥
彭磊
郝若诗
史崇颖
田洋
盛军
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2018
3
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