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云南苹果产区苹果茎沟病毒(ASGV)的发现及其分子变异
被引量:
7
1
作者
姬盼
王连春
+3 位作者
孔宝华
李晓鹏
曹克强
马钧
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期397-403,共7页
【目的】为了查明云南省苹果产区的苹果茎沟病毒病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)的侵染情况和不同来源分离物间的分子变异情况,【方法】以云南昭通、丽江、昆明、曲靖等地采集的325份苹果病毒样品为试材,采用RT-PCR技术对其是否携...
【目的】为了查明云南省苹果产区的苹果茎沟病毒病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)的侵染情况和不同来源分离物间的分子变异情况,【方法】以云南昭通、丽江、昆明、曲靖等地采集的325份苹果病毒样品为试材,采用RT-PCR技术对其是否携带ASGV进行检测,运用DNAMAN6.0、MEGA5.0对实验获得的6个分离物和GenBank上已登录的34个分离物进行序列比对分析。【结果】ASGV在云南各大苹果产区的发病率高达48%。序列比对结果显示,这些分离物的核苷酸序列相似性为87.3%~93.8%,氨基酸序列相似性为90.7%~98.7%。系统发育树显示,云南的6个分离物聚为一簇,而陕西省苹果分离物YL06与云南省分离物ZT1、TJX1亲缘关系比较近,聚为一支;ASGV苹果分离物要明显区别于ASGV梨分离物和CTLV柑橘分离物。【结论】云南省苹果产区苹果树的ASGV带毒率高达48%,推测可能是一种发生率比较普遍的病毒病,这是云南省发现的首次报道。系统发育树显示:本研究获得的6个苹果分离物明显区别于其他寄主分离物,并且与其他地区的分离物具有一定差异,推测在我国,ASGV的分子变异与寄主/地域来源存在着一定的相关性。
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关键词
苹果茎沟病毒(ASGV)
CP外壳蛋白
克隆
序列分析
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职称材料
题名
云南苹果产区苹果茎沟病毒(ASGV)的发现及其分子变异
被引量:
7
1
作者
姬盼
王连春
孔宝华
李晓鹏
曹克强
马钧
机构
云南农业大学植物保护学院·云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室
玉溪师范
学院
资源环境
学院
国家苹果产业技术体系
病虫害
防控研究室
国家苹果产业技术体系
云南
综合试验站
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期397-403,共7页
基金
国家苹果产业技术体系(nycytx-08-04-01和CARS-28-21)
文摘
【目的】为了查明云南省苹果产区的苹果茎沟病毒病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)的侵染情况和不同来源分离物间的分子变异情况,【方法】以云南昭通、丽江、昆明、曲靖等地采集的325份苹果病毒样品为试材,采用RT-PCR技术对其是否携带ASGV进行检测,运用DNAMAN6.0、MEGA5.0对实验获得的6个分离物和GenBank上已登录的34个分离物进行序列比对分析。【结果】ASGV在云南各大苹果产区的发病率高达48%。序列比对结果显示,这些分离物的核苷酸序列相似性为87.3%~93.8%,氨基酸序列相似性为90.7%~98.7%。系统发育树显示,云南的6个分离物聚为一簇,而陕西省苹果分离物YL06与云南省分离物ZT1、TJX1亲缘关系比较近,聚为一支;ASGV苹果分离物要明显区别于ASGV梨分离物和CTLV柑橘分离物。【结论】云南省苹果产区苹果树的ASGV带毒率高达48%,推测可能是一种发生率比较普遍的病毒病,这是云南省发现的首次报道。系统发育树显示:本研究获得的6个苹果分离物明显区别于其他寄主分离物,并且与其他地区的分离物具有一定差异,推测在我国,ASGV的分子变异与寄主/地域来源存在着一定的相关性。
关键词
苹果茎沟病毒(ASGV)
CP外壳蛋白
克隆
序列分析
Keywords
Apple stem grooving virus (ASGV)
CP
Clone
Sequence analysis
分类号
S661.1 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南苹果产区苹果茎沟病毒(ASGV)的发现及其分子变异
姬盼
王连春
孔宝华
李晓鹏
曹克强
马钧
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
7
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