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中国辣椒ADH基因家族鉴定及表达分析
1
作者
叶楚
林蔚
+9 位作者
王川
谢炳春
徐小万
徐晓美
王恒明
吕俊恒
邓明华
吴智明
李涛
衡周
《广东农业科学》
2025年第2期95-107,共13页
[目的]中国辣椒(Capsicum chinense)为茄科(Solanaceae)辣椒属(Capsicum)植物,大多具由支链酯类物质产生的浓郁果香。乙醇脱氢酶(Alcohol dehydrogenase,ADH)是影响支链酯类物质含量的重要酶,催化相应的醇和醛之间的可逆转化。鉴定中国...
[目的]中国辣椒(Capsicum chinense)为茄科(Solanaceae)辣椒属(Capsicum)植物,大多具由支链酯类物质产生的浓郁果香。乙醇脱氢酶(Alcohol dehydrogenase,ADH)是影响支链酯类物质含量的重要酶,催化相应的醇和醛之间的可逆转化。鉴定中国辣椒ADH基因家族成员并分析其在植株各部位的表达模式,可为辣椒果实香气合成机理研究提供参考。[方法]通过生物信息学方法、实时荧光定量PCR分析中国辣椒ADH基因家族成员及表达特征,再利用气相色谱质谱联用(Gaschromatography-mass spectrometry,GC-MS)方法分析中国辣椒果实挥发性物质。[结果]从中国辣椒基因组中鉴定到8个ADH基因,分布在4条染色体上,分别命名为CcADH1~8。理化性质分析结果显示,ADH基因家族编码的氨基酸序列长度在368~457 aa,分子质量范围为40~49 kD,等电点范围为5.50~9.12,CcADH4~6的亲水系数为正值、其余成员为负值;不稳定指数为22.23~44.81。蛋白质结构预测显示,CcADH的二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三级结构中CcADH4和CcADH6、CcADH7和CcADH8的结构相近。亚细胞定位预测发现,CcADH均定位于细胞质中。启动子区域顺式作用元件预测结果显示,CcADH启动子上存在12种顺式调控元件。时空表达分析表明,CcADH6在‘金田1号’‘7054’植株各器官均未检测到表达。在‘金田1号’中,CcADH7在花和果实第4时期高表达;在‘7054’中,CcADH5在果实第3时期高表达。利用GC-MS检测果实不同发育时期香气物质含量变化发现,‘金田1号’在果实第4时期香气物质总含量最高,而‘7054’在果实第3时期香气物质总含量最高。[结论]中国辣椒果实中的挥发性物质在其发育中后期大量积累,CcADH基因家族中的CcADH5和CcADH7分别与‘7054’和‘金田1号’果实中支链酯类物质变化趋势一致。它们参与的反应为下游的醇酰基转移酶(Alcohol acetyl transferase,AAT)提供特异底物,影响果实支链酯类物质含量。
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关键词
中国辣椒
乙醇脱氢酶
支链醇
基因鉴定
表达分析
生物信息学
实时荧光定量PCR
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职称材料
《中国果业信息》2008年刊载文章统计与分析
被引量:
1
2
作者
张兴旺
《中国南方果树》
北大核心
2009年第5期78-80,共3页
将《中国果业信息》期刊2008年刊载文章,从栏目、树种、涉及国家(地区)、作者分布等角度进行了计量分析;结合与国内涉果期刊的比较,指出该刊信息量大、覆盖面广、时效性强,为名副其实、独具特色的信息刊物。结合国内果树产业状况,提出...
将《中国果业信息》期刊2008年刊载文章,从栏目、树种、涉及国家(地区)、作者分布等角度进行了计量分析;结合与国内涉果期刊的比较,指出该刊信息量大、覆盖面广、时效性强,为名副其实、独具特色的信息刊物。结合国内果树产业状况,提出若干有针对性的建议,并指出了通讯员在该刊中的作用。
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关键词
期刊
《中国果业信息》
文献计量分析
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职称材料
题名
中国辣椒ADH基因家族鉴定及表达分析
1
作者
叶楚
林蔚
王川
谢炳春
徐小万
徐晓美
王恒明
吕俊恒
邓明华
吴智明
李涛
衡周
机构
仲恺
农业
工程
学院
园艺
园林
学院
广东省
农业
科
学院
蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室
广东省
农业
技术推广中心
云南农业大学园艺园林学院
出处
《广东农业科学》
2025年第2期95-107,共13页
基金
国家重点研发计划项目(2023YFD1201502)
广东省农业厅种业振兴与科技兴农项目(2024-440000-87020100-8753)
+1 种基金
广州市科技计划项目(2023B03J1082)
毕节市科学技术揭榜挂帅项目。
文摘
[目的]中国辣椒(Capsicum chinense)为茄科(Solanaceae)辣椒属(Capsicum)植物,大多具由支链酯类物质产生的浓郁果香。乙醇脱氢酶(Alcohol dehydrogenase,ADH)是影响支链酯类物质含量的重要酶,催化相应的醇和醛之间的可逆转化。鉴定中国辣椒ADH基因家族成员并分析其在植株各部位的表达模式,可为辣椒果实香气合成机理研究提供参考。[方法]通过生物信息学方法、实时荧光定量PCR分析中国辣椒ADH基因家族成员及表达特征,再利用气相色谱质谱联用(Gaschromatography-mass spectrometry,GC-MS)方法分析中国辣椒果实挥发性物质。[结果]从中国辣椒基因组中鉴定到8个ADH基因,分布在4条染色体上,分别命名为CcADH1~8。理化性质分析结果显示,ADH基因家族编码的氨基酸序列长度在368~457 aa,分子质量范围为40~49 kD,等电点范围为5.50~9.12,CcADH4~6的亲水系数为正值、其余成员为负值;不稳定指数为22.23~44.81。蛋白质结构预测显示,CcADH的二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三级结构中CcADH4和CcADH6、CcADH7和CcADH8的结构相近。亚细胞定位预测发现,CcADH均定位于细胞质中。启动子区域顺式作用元件预测结果显示,CcADH启动子上存在12种顺式调控元件。时空表达分析表明,CcADH6在‘金田1号’‘7054’植株各器官均未检测到表达。在‘金田1号’中,CcADH7在花和果实第4时期高表达;在‘7054’中,CcADH5在果实第3时期高表达。利用GC-MS检测果实不同发育时期香气物质含量变化发现,‘金田1号’在果实第4时期香气物质总含量最高,而‘7054’在果实第3时期香气物质总含量最高。[结论]中国辣椒果实中的挥发性物质在其发育中后期大量积累,CcADH基因家族中的CcADH5和CcADH7分别与‘7054’和‘金田1号’果实中支链酯类物质变化趋势一致。它们参与的反应为下游的醇酰基转移酶(Alcohol acetyl transferase,AAT)提供特异底物,影响果实支链酯类物质含量。
关键词
中国辣椒
乙醇脱氢酶
支链醇
基因鉴定
表达分析
生物信息学
实时荧光定量PCR
Keywords
Capsicum chinense
alcohol dehydrogenase
branched alcohol
gene identification
expression analysis
bioinformatics
real-time qunantitative PCR
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
《中国果业信息》2008年刊载文章统计与分析
被引量:
1
2
作者
张兴旺
机构
云南农业大学园艺园林学院
出处
《中国南方果树》
北大核心
2009年第5期78-80,共3页
文摘
将《中国果业信息》期刊2008年刊载文章,从栏目、树种、涉及国家(地区)、作者分布等角度进行了计量分析;结合与国内涉果期刊的比较,指出该刊信息量大、覆盖面广、时效性强,为名副其实、独具特色的信息刊物。结合国内果树产业状况,提出若干有针对性的建议,并指出了通讯员在该刊中的作用。
关键词
期刊
《中国果业信息》
文献计量分析
分类号
G353.1 [文化科学—情报学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国辣椒ADH基因家族鉴定及表达分析
叶楚
林蔚
王川
谢炳春
徐小万
徐晓美
王恒明
吕俊恒
邓明华
吴智明
李涛
衡周
《广东农业科学》
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
《中国果业信息》2008年刊载文章统计与分析
张兴旺
《中国南方果树》
北大核心
2009
1
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职称材料
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