动物遗传学课程教学改革探索 被引量：14

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作者 苗永旺 王配 +1 位作者 滕晓红 张永云 《安徽农业科学》 CAS 2020年第6期276-279,共4页

动物遗传学是动物科学专业本科生的一门重要专业基础课。由于近年高校改革和本学科的飞速发展,该课程教学的改革已成为必然趋势。为了能够更好地改进该课程教学,适应学科发展,使授课质量得到进一步提高,从教学内容的优化与重组,选择合... 动物遗传学是动物科学专业本科生的一门重要专业基础课。由于近年高校改革和本学科的飞速发展,该课程教学的改革已成为必然趋势。为了能够更好地改进该课程教学,适应学科发展,使授课质量得到进一步提高,从教学内容的优化与重组,选择合适教材,改革完善课程的理论和实验教学方法和教学手段及完善考核评价制度等方面提出了改革设想。 展开更多

关键词 动物遗传学 理论教学 实验教学 课程考核制度 教学改革

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大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡mtDNA D-loop遗传多样性分析 被引量：11

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作者 欧阳依娜 阮谦 +4 位作者 钱林东 孙利民 张永云 滕晓红 苗永旺 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2017年第1期70-77,共8页

大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡是近年在云南发现的地方鸡遗传资源,具有优良的种质特性,为了阐明其群体遗传背景,采用mtDNA D-loop区序列为遗传标记,对采自3个地方鸡的共257个样品进行了检测分析。结果表明:大围山微型鸡、云龙... 大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡是近年在云南发现的地方鸡遗传资源,具有优良的种质特性,为了阐明其群体遗传背景,采用mtDNA D-loop区序列为遗传标记,对采自3个地方鸡的共257个样品进行了检测分析。结果表明:大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡的单倍型多样度分别为0.083±0.018、0.851±0.029和0.784±0.039;核苷酸多样度分别为0.014 67±0.000 45、0.013 42±0.000 80、0.011 66±0.001 55;群体内遗传距离分别为0.014±0.003、0.014±0.003、0.012±0.003。中介网络分析显示:本研究检测的257个样品分布在A、B、C、D、E、F和G等7个世系中,其中大围山微型鸡包含A、B、C、D、E、F和G等7个世系,B、D世系为其主要世系;云龙矮脚鸡包含A、B、C、E、F和G等6个世系,E世系为其主要世系;拉伯高脚鸡包含A、B、E和G等4个世系,G世系为其主要世系。AMOVA分析表明:3个群体间遗传分化指数(Fst)分别为0.120 84、0.239 46、0.263 68(P<0.01),群体内遗传变异占80.61%,群体间变异为19.39%(P<0.01)。本研究结果揭示3个地方鸡群体遗传多样性较丰富,都含有多个母系血统,支持家鸡多个母系起源的观点,但它们之间存在较大的遗传分化。 展开更多

关键词 大围山微型鸡 云龙矮脚鸡 拉伯高脚鸡 MTDNA D-LOOP 遗传多样性 遗传分化

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水牛乳和荷斯坦牛乳中五种常量元素含量的测定 被引量：17

3

作者 张永云 杨忠 +6 位作者 李卫真 苗永旺 汤守锟 田建云 仇松寅 王强 朱仁英 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第6期72-76,共5页

对摩本杂水牛（摩拉水牛×德宏水牛）乳和荷斯坦牛乳中的5种常量元素进行测定。采用火焰光度法测定钾、钠含量,火焰原子吸收分光光度法（FAAS）测定钙、镁含量,磷钼酸比色法测定磷含量。结果表明,水牛乳中钾、钠含量极显著低于荷斯... 对摩本杂水牛（摩拉水牛×德宏水牛）乳和荷斯坦牛乳中的5种常量元素进行测定。采用火焰光度法测定钾、钠含量,火焰原子吸收分光光度法（FAAS）测定钙、镁含量,磷钼酸比色法测定磷含量。结果表明,水牛乳中钾、钠含量极显著低于荷斯坦牛乳（P〈0.01）,钙、磷含量极显著高于荷斯坦牛乳（P〈0.01）,两种牛乳中镁含量差异不显著（P〉0.05）。元素测定相对标准偏差（RSD）低于5%,平均加标回收率在95.05%～105.18%之间。 展开更多

关键词 水牛 荷斯坦奶牛 乳 矿物质

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猪α干扰素基因克隆、进化及表达特性分析 被引量：4

4

作者 霍海龙 陈园园 +6 位作者 王配 刘丽仙 王淑燕 张永云 王锐 钱林东 霍金龙 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期382-388,共7页

为深入研究α干扰素在猪体内的调节和功能,本研究以猪为实验动物,通过RT-PCR扩增得到α干扰素基因全长编码区序列,提交Gen Bank数据库,获得登录号为"JQ839262"。生物信息学分析显示,该基因编码189个氨基酸,预测蛋白分子量为21... 为深入研究α干扰素在猪体内的调节和功能,本研究以猪为实验动物,通过RT-PCR扩增得到α干扰素基因全长编码区序列,提交Gen Bank数据库,获得登录号为"JQ839262"。生物信息学分析显示,该基因编码189个氨基酸,预测蛋白分子量为21.32 ku,等电点为6.37。蛋白质结构分析得出,IFN-α存在1个保守域,无跨膜结构,存在信号肽。疏水性分析显示其N端疏水,C端亲水。亚细胞定位显示,该蛋白分泌到细胞周质的概率为92.2%。系统进化分析表明,猪与牛、山羊的亲缘关系较近。同时通过荧光定量PCR法检测了α干扰素基因mRNA在猪13个组织中的表达量,发现在皮肤、肺、肌肉、心、脾中表达量较高。本研究为进一步研究猪α干扰素基因的表达调控奠定研究基础。 展开更多

关键词 α干扰素基因 荧光定量PCR 序列分析 组织表达

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河流型与沼泽型水牛CSN3基因密码子使用特征分析 被引量：3

5

作者 范新阳 邱立华 +3 位作者 罗国祥 张永云 滕晓红 苗永旺 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2017年第2期238-245,共8页

本研究以54头河流型水牛和70头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、小鼠和人的序列作对照,对乳成分中重要的κ-酪蛋白(kappa casein)编码基因CSN3的密码子使用偏好性及水牛与其他物种间CSN3基... 本研究以54头河流型水牛和70头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、小鼠和人的序列作对照,对乳成分中重要的κ-酪蛋白(kappa casein)编码基因CSN3的密码子使用偏好性及水牛与其他物种间CSN3基因密码子使用的差异和进化关系进行了深入分析。结果表明:两种类型水牛CSN3基因密码子使用特征相似,河流型水牛CSN3基因共有26个偏好使用的密码子,而沼泽型水牛共有27个;其中,两类水牛偏好性较强的密码子均为GUU、UCA、AGU、CCA、AGG、GGU和GGA(RSCU≥2),河流型水牛对Asp的两种密码子GAU、GAC没有使用偏好性,而沼泽型水牛偏好使用GAC;河流型水牛编码Asp和Cys的同义密码子RSCU值为1,而沼泽型水牛只有编码Cys的同义密码子RSCU值为1。研究发现,所有物种CSN3基因均偏好使用以A/U结尾的密码子,但不同物种之间偏好使用密码子种类和数目均有差异。在密码子使用频率上,水牛CSN3基因与其他牛科物种的差异小于与小鼠、人的差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型与沼泽型水牛亲缘关系最近,聚为一类,然后依次与其他牛、绵羊、小鼠和人等物种相聚。 展开更多

关键词 河流型水牛 沼泽型水牛 牛科物种 CSN3基因 密码子偏好性 聚类分析

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绿色荧光蛋白基因原核表达质粒pET32a-AcGFP1的构建及其在大肠杆菌中的高效表达 被引量：2

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作者 霍海龙 赵跃 +6 位作者 王锐 侯慧芳 李卫真 张永云 刘丽仙 王配 霍金龙 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期820-825,共6页

为了构建绿色荧光蛋白AcGFP1基因的原核表达载体pET32a-AcGFP1,并诱导使其在大肠杆菌中高效表达,本研究以pIRES-AcGFP1质粒为模板,采用PCR技术特异性扩增绿色荧光蛋白AcGFP1基因,通过酶切和连接使其与原核表达载体pET32a(+)构成重组子,... 为了构建绿色荧光蛋白AcGFP1基因的原核表达载体pET32a-AcGFP1,并诱导使其在大肠杆菌中高效表达,本研究以pIRES-AcGFP1质粒为模板,采用PCR技术特异性扩增绿色荧光蛋白AcGFP1基因,通过酶切和连接使其与原核表达载体pET32a(+)构成重组子,经PCR、酶切和测序鉴定后,重组质粒转化大肠杆菌Rosetta(DE3),用不同浓度的异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达绿色荧光蛋白,经15%SDS-PAGE鉴定,结果显示:重组质粒pET32a-AcGFP1中的AcGFP1序列与Clontech公司的pIRES-AcGFP1质粒的AcGFP1序列完全一致,表明本实验已成功构建了含有绿色荧光蛋白基因AcGFP1的原核表达质粒。此外,pET32a-AcGFP1转化Rosetta(DE3),经不同浓度的IPTG诱导,SDS-PAGE检测均获得高效表达,为今后构建pET32a(+)-TAT-AcGFP1融合表达载体以及深入研究TAT的细胞膜穿透作用的机制奠定基础。 展开更多

关键词 绿色荧光蛋白 基因克隆 报告基因 原核表达

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猪新基因PFN3电子克隆、RT-PCR验证和组织表达分析 被引量：1

7

作者 张永云 赵跃 +9 位作者 王锐 秦彩艳 王配 王淑燕 李福泉 刘丽仙 霍海龙 李卫真 卢健 霍金龙 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2014年第2期179-186,共8页

通过NCBI下载猪近缘物种的PFN3基因序列,在线BLAST比对获得猪EST序列,利用Lasergene软件电子克隆猪PFN3基因编码区序列及部分侧翼序列。针对编码区设计特异引物并以滇南小耳猪为研究材料进行实验验证,同时应用半定量RT-PCR技术对30个组... 通过NCBI下载猪近缘物种的PFN3基因序列,在线BLAST比对获得猪EST序列,利用Lasergene软件电子克隆猪PFN3基因编码区序列及部分侧翼序列。针对编码区设计特异引物并以滇南小耳猪为研究材料进行实验验证,同时应用半定量RT-PCR技术对30个组织进行了表达分析。研究获得了猪PFN3 414 bp的编码区序列(GenBank登录号:JX457348,对应的氨基酸登录号:AFU74013)。生物信息学分析表明,该基因编码137个氨基酸,预测的蛋白质分子量(Mw)为14.73 ku,等电点(pI)为9.30。蛋白质结构分析显示,PFN3存在1个保守域,无信号肽;疏水性分析表明其N端和C端均具有亲水性;亚细胞定位显示,该蛋白位于细胞质的概率是94.1%。系统进化分析表明,猪与牛亲缘关系最近。组织表达分析表明,PFN3基因在30个被检组织中均有表达,在睾丸、肝、肾、结肠、盲肠、直肠及食管中高表达,在胸腺、甲状腺、附睾、淋巴结、十二指肠、空肠、回肠、胃、皮肤、大脑、小脑、垂体及下丘脑中中度表达,在颌下腺、肺、心、脾、肾上腺、肌肉、胰脏、脑干、舌下腺及脊髓中低表达。研究结果将为该基因在猪中的进一步功能研究奠定基础。 展开更多

关键词 肌动蛋白结合蛋白-3 电子克隆 滇南小耳猪 生物信息学 组织表达

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水牛瘦素受体基因密码子使用偏好性分析 被引量：1

8

作者 范新阳 欧阳依娜 +3 位作者 王鹏武 张永云 滕晓红 苗永旺 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第4期1069-1078,共10页

试验选取27头河流型水牛和41头沼泽型水牛,以从NCBI数据库中下载的家牛、野牦牛、野牛、绵羊、山羊、小鼠和人的序列作对照,对编码瘦素受体(leptin receptor,LEPR)基因的密码子偏好性及水牛与其他物种间密码子使用的差异和进化关系进行... 试验选取27头河流型水牛和41头沼泽型水牛,以从NCBI数据库中下载的家牛、野牦牛、野牛、绵羊、山羊、小鼠和人的序列作对照,对编码瘦素受体(leptin receptor,LEPR)基因的密码子偏好性及水牛与其他物种间密码子使用的差异和进化关系进行了深入分析。结果发现,所有的密码子在河流型水牛和沼泽型水牛LEPR基因中均有使用,两种类型水牛偏好使用的密码子有28个,其中使用偏好性较强的密码子为AGA(RSCU≥2),表明河流型水牛和沼泽型水牛LEPR基因密码子使用特征相似。水牛及参考物种LEPR基因均偏好使用以A/U结尾的密码子,但水牛与其他参考物种间偏好使用密码子的种类和数目有差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型水牛与沼泽型水牛亲缘关系最近,先聚为一类,然后与家牛、野牦牛和野牛聚为一类,再与绵羊、山羊、小鼠和人等物种聚为一类。在密码子使用频率上,河流型水牛LEPR基因与酵母密码子偏好性差异小于与大肠杆菌和小鼠密码子偏好性差异,从而揭示酵母更适合作为水牛LEPR基因的外源表达系统。 展开更多

关键词 河流型水牛 沼泽型水牛 LEPR基因 密码子使用偏好性

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槟榔江水牛·摩拉水牛和荷斯坦奶牛血清中3种激素含量的测定 被引量：1

9

作者 刘超英 贺珠婷 +7 位作者 张永云 俞大阔 彭洁 苗永旺 霍金龙 尹康玲 和绍禹 李卫真 《安徽农业科学》 CAS 2016年第2期76-78,共3页

[目的]为槟榔江水牛的进一步研究和开发利用积累理论数据。[方法]采用化学发光法对槟榔江水牛血清中3种激素(PRL、INS和GH)的含量进行测定,并与摩拉水牛和荷斯坦奶牛进行比较。[结果]槟榔江水牛血清中GH含量为0.017 9 ng/m L,低于摩拉水... [目的]为槟榔江水牛的进一步研究和开发利用积累理论数据。[方法]采用化学发光法对槟榔江水牛血清中3种激素(PRL、INS和GH)的含量进行测定,并与摩拉水牛和荷斯坦奶牛进行比较。[结果]槟榔江水牛血清中GH含量为0.017 9 ng/m L,低于摩拉水牛(0.023 7 ng/m L),略高于荷斯坦奶牛(0.017 8 ng/m L),但差异均不显著(P>0.05)。槟榔江水牛血清中PRL含量为0.120 0 ng/m L,与荷斯坦奶牛差异不显著(P>0.05),但显著低于摩拉水牛(P<0.05)。槟榔江水牛血清中INS含量为0.740 0μU/m L,均低于荷斯坦奶牛和摩拉水牛,其中与荷斯坦奶牛差异显著(P<0.05)。[结论]在泌乳方面,槟榔江水牛与摩拉水牛和荷斯坦奶牛有相同的优越性。 展开更多

关键词 槟榔江水牛 摩拉水牛 荷斯坦奶牛 催乳素 胰岛素 生长激素

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大额牛和牦牛胃型LYZ c基因多态性及其对消化功能的适应性分析

10

作者 范新阳 张自芳 +4 位作者 邱立华 钱林东 刘丽仙 张永云 苗永旺 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2018年第5期858-866,共9页

【目的】为了阐明大额牛和牦牛胃型LYZ c基因的多态性及其对消化功能的适应。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对35头大额牛和33头牦牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了其对消化... 【目的】为了阐明大额牛和牦牛胃型LYZ c基因的多态性及其对消化功能的适应。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对35头大额牛和33头牦牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了其对消化功能的适应性分析。【结果】在大额牛群体内共发现6个SNP位点,分别为c.196G>A、c.267T>C、c.270C>T、c.396C>T、c.423C>T和c.438C>G。在牦牛群体内共发现10个SNP位点,其中6个与大额牛共享,非共享的SNP位点分别为c.336G>C、c.348T>G、c.351T>C和c.375A>C。SNP196和SNP348为异义替换,引起p.G66S和p.H116Q氨基酸替换,但它们对大额牛和牦牛LYZ c的功能没有影响。在大额牛LYZ c基因中,共定义6种单倍型,确定了2种LYZ c蛋白变异体(Gayal 1和Gayal 2);而在牦牛LYZ c基因中,共定义12种单倍型,确定了3种LYZ c变异体(Yak 1～Yak 3);变异体Gayal 1与Yak 3、Gayal 2与Yak 1相同,而变异体Yak 2为牦牛独有。大额牛、牦牛和普通牛胃型LYZ c变异体之间在氨基酸组成、理化特性与结构上基本一致,但大额牛和牦牛变异体LYZ c等电点比普通牛S3型LYZ c更低。【结论】大额牛和牦牛胃型LYZ c蛋白可能更适合胃中的酸性环境,具有分解胃中微生物的功能。 展开更多

关键词 大额牛和牦牛 胃型LYZ C基因 消化酶 序列分析 适应性分析

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版纳微型猪近交系TSARG7基因克隆及功能生物信息学分析

11

作者 王淑燕 张霞 +4 位作者 霍金龙 王配 张永云 李卫真 姚茂东 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第6期1637-1644,共8页

为获得版纳微型猪近交系(Banna Mini-pig inbred line,BMI)TSATG7基因序列并分析组织表达情况,本研究以GenBank中猪及近缘物种的TSARG7基因mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增BMI TSARG7基因,半定量分析10个重要组织的表达谱,并对蛋... 为获得版纳微型猪近交系(Banna Mini-pig inbred line,BMI)TSATG7基因序列并分析组织表达情况,本研究以GenBank中猪及近缘物种的TSARG7基因mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增BMI TSARG7基因,半定量分析10个重要组织的表达谱,并对蛋白质序列进行功能生物信息学分析。结果显示,获得了BMI TSARG7基因1 371bp的编码区序列(GenBank登录号:KU950831,对应的氨基酸登录号:AMY60405),编码456个氨基酸,蛋白质分子质量为52.05ku,等电点(pI)为9.28。多组织表达分析表明,TSARG7基因在睾丸中高表达,在其他组织中呈中、低表达。功能生物信息学分析表明,TSARG7蛋白质存在1个保守结构域,有3个跨膜螺旋结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端亲水;有5类功能活性位点,位于细胞质的概率是94.1%。本试验结果为进一步研究TSARG7基因在猪精子发生和性成熟方面的作用及功能奠定基础。 展开更多

关键词 版纳微型猪近交系 酰基转移酶 组织表达 生物信息学

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抗脂肪细胞膜蛋白抗体对试验性肥胖大鼠5种激素水平的影响

12

作者 刘超英 胡忠梅 +7 位作者 李卫真 张永云 赵素梅 代飞燕 彭洁 俞大阔 和绍禹 周明 《动物医学进展》 北大核心 2017年第1期61-64,共4页

为了验证抗脂肪细胞膜蛋白抗体减少动物脂肪沉积的作用效果,并对该抗体用于人类肥胖的治疗提供理论依据和试验资料,本试验分别对4组试验性肥胖大鼠注射0、0.1、0.5、1.0mg/mL剂量的抗脂肪细胞膜蛋白抗体,并检测4周内大鼠血清中5种激素... 为了验证抗脂肪细胞膜蛋白抗体减少动物脂肪沉积的作用效果,并对该抗体用于人类肥胖的治疗提供理论依据和试验资料,本试验分别对4组试验性肥胖大鼠注射0、0.1、0.5、1.0mg/mL剂量的抗脂肪细胞膜蛋白抗体,并检测4周内大鼠血清中5种激素含量及变化。结果显示,试验组血清中胰岛素(INS)含量低于对照组,Ⅰ组与Ⅳ组4周内均差异显著(P<0.05);试验组与对照组、胰岛素样生长因子1(IGF-1)含量无显著差异(P>0.05);注射抗体后,试验组生长激素(GH)含量显著增高,且Ⅰ、Ⅲ组4周内均差异显著(P<0.05);第1周内,试验组三碘甲状腺原氨酸(T3)含量与对照组无显著差异(P>0.05),后3周内Ⅰ组和Ⅳ组差异显著(P<0.05);第1、3、4周内,Ⅰ组和Ⅳ组四碘甲状腺原氨酸(T4)含量差异显著(P<0.05),第2周内无显著差异,Ⅱ组和Ⅲ组差异均不显著(P>0.05)。此外,不同组间的差异显著性随注射剂量不同而不同。 展开更多

关键词 抗脂肪细胞膜蛋白抗体 试验性肥胖大鼠 激素

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水牛DGAT1基因第17外显子多态性及其与乳成分含量的关联性分析 被引量：5

13

作者 孟莉 陈立 +4 位作者 苗永旺 张永云 赵素梅 霍金龙 李卫真 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期190-195,共6页

二酰甘油酰基转移酶1(DGAT1)在乳脂合成过程中发挥重要作用,但水牛DGAT1基因第17外显子遗传多态性及其与产奶性状的关联性还不清楚。本文采用PCR-SSCP结合DNA测序方法对48头德宏水牛和93头产奶杂交水牛(F1:摩拉水牛×德宏水牛)的第1... 二酰甘油酰基转移酶1(DGAT1)在乳脂合成过程中发挥重要作用,但水牛DGAT1基因第17外显子遗传多态性及其与产奶性状的关联性还不清楚。本文采用PCR-SSCP结合DNA测序方法对48头德宏水牛和93头产奶杂交水牛(F1:摩拉水牛×德宏水牛)的第17外显子进行了多态性检测并结合乳成分数据进行了关联分析。在水牛DGAT1基因第17外显子发现1个SNP位点,即c.1350C>G,其为同义替换。该SNP位点在德宏乳用和非乳用水牛中群体遗传组成相近,且不同基因型个体间的乳糖率、乳脂率及乳蛋白率无显著差异(P>0.05)。表明该SNP对水牛乳糖率、乳脂率及乳蛋白率等无显著影响。序列比对显示,水牛、普通牛、瘤牛、山羊和绵羊DGAT1基因第17外显子间仅存在1个编码氨基酸差异,揭示其具有较高的保守性。 展开更多

关键词 水牛 DGAT1基因 外显子17 SNPS 多态性

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槟榔江水牛LALBA基因克隆及序列特征分析 被引量：1

14

作者 单曦 吉丽 +4 位作者 张永云 滕晓红 袁峰 哈福 苗永旺 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2017年第5期830-837,共8页

【目的】α-乳清蛋白由LALBA基因编码,在乳糖合成中起着重要作用。近年在普通奶牛中发现该基因与泌乳性状关系密切,但在水牛中研究较少。为了揭示水牛LALBA基因的序列特征。【方法】本研究采用RT-PCR测序法对槟榔江水牛LALBA基因的编码... 【目的】α-乳清蛋白由LALBA基因编码,在乳糖合成中起着重要作用。近年在普通奶牛中发现该基因与泌乳性状关系密切,但在水牛中研究较少。为了揭示水牛LALBA基因的序列特征。【方法】本研究采用RT-PCR测序法对槟榔江水牛LALBA基因的编码区序列进行了克隆和生物信息学分析。【结果】槟榔江水牛LALBA基因的编码区全长429 bp,编码蛋白含142个氨基酸。其α-LA含有1个C型溶菌酶/乳蛋白家族结构域(AA20~138)和1个信号肽序列(AA19~20),无跨膜结构,是胞外分泌的亲水蛋白;其N末端疏水,C末端亲水;有4类功能活性位点。基于LALBA基因编码区序列的系统发育分析表明,槟榔江水牛与牛亚科物种聚在一起,揭示它们LALBA基因功能的相似性。在LALBA基因编码区共检测到5个SNP位点:c.63A>G、c.107A>G、c.147A>G、c.249C>T、c.291T>C。这些变异位点全部处于Hardy-Weinberg不平衡状态,只有SNP107为异义替换,导致编码氨基酸由天冬氨酸变为甘氨酸。功能分析显示SNP107对槟榔江水牛α-LA功能没有影响。【结论】水牛LALBA基因的序列与其他牛科物种长度相同,其编码产物的结构、功能与其他牛科物种相似。本研究可为进一步研究LALBA基因在水牛泌乳过程中的作用机制奠定基础。 展开更多

关键词 槟榔江水牛 α-乳清蛋白 生物信息学分析 单核苷酸多态性 蛋白质功能

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马铃薯连作与复合型种植对土壤微生态效应的研究进展 被引量：2

15

作者 陈以相 陈建斌 +1 位作者 任静 王海宁 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2016年第3期536-542,共7页

连作障碍是马铃薯产业可持续发展亟待解决的问题,本文从土壤营养、土壤酶活、土壤微生物、根系分泌物4个方面综述了马铃薯连作障碍的研究现状,并阐述了作物复合型种植对土壤连作障碍的缓解作用。连作障碍可能是作物-土壤系统内部诸多因... 连作障碍是马铃薯产业可持续发展亟待解决的问题,本文从土壤营养、土壤酶活、土壤微生物、根系分泌物4个方面综述了马铃薯连作障碍的研究现状,并阐述了作物复合型种植对土壤连作障碍的缓解作用。连作障碍可能是作物-土壤系统内部诸多因子综合作用的结果,单一因子的论述很难清楚解释其形成的原因,探究多因素复合影响机制有其必要性及意义,持续的研究有利于做出较合理的解释。复合型种植是一种有效缓解马铃薯连作障碍的调控技术。今后该领域的研究应注重多学科联合、完善研究方法、扩展研究领域,才能系统揭示连作障碍形成机理。 展开更多

关键词 马铃薯 连作 复合型种植 土壤微生态

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德宏奶水牛乳腺组织CD36基因的表达研究 被引量：2

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作者 王梦迪 唐娜 +3 位作者 俞大阔 张永云 杨忠 李卫真 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期264-268,共5页

【目的】研究不同乳脂率德宏奶水牛乳腺组织CD36基因的表达差异。【方法】选取同一养殖小区中饲养条件相同的健康德宏奶水牛216头,采集乳样,用乳成分分析仪测定乳脂率;以乳脂率(7.5±0.5)%为基准,将德宏奶水牛分为高、中、低乳脂率... 【目的】研究不同乳脂率德宏奶水牛乳腺组织CD36基因的表达差异。【方法】选取同一养殖小区中饲养条件相同的健康德宏奶水牛216头,采集乳样,用乳成分分析仪测定乳脂率;以乳脂率(7.5±0.5)%为基准,将德宏奶水牛分为高、中、低乳脂率组(分别为H、M、L组),每组选取胎次相同、年龄相近、处于泌乳中期的德宏奶水牛各3头,屠宰后采集乳腺组织,提取总RNA,利用实时荧光定量PCR技术检测CD36基因mRNA表达水平,并与乳脂率进行相关性分析。【结果】H组的CD36基因m RNA表达水平极显著高于M组和L组(P<0.01),M组极显著高于L组(P<0.01)。相关性分析表明:CD36基因表达量与乳脂率呈极显著正相关(P<0.01)。【结论】CD36基因表达对德宏奶水牛乳质量可能具有促进作用。 展开更多

关键词 德宏奶水牛 乳腺组织 乳脂率 CD36基因

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不同乳脂率德宏奶水牛乳腺组织脂滴形成相关基因的表达研究 被引量：1

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作者 唐娜 江俊才 +4 位作者 王梦迪 茶学典 张永云 杨忠 李卫真 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第12期4545-4553,共9页

本研究旨在探索脂滴形成相关基因嗜乳脂蛋白(BTN1A1)、黄嘌呤脱氢酶(XDH)、围脂滴蛋白1(PLIN1)和PLIN2在不同乳脂率德宏奶水牛乳腺组织中的表达差异。试验选取同一养殖小区的健康德宏奶水牛216头,采集乳样,用乳品分析仪测定乳脂率。根... 本研究旨在探索脂滴形成相关基因嗜乳脂蛋白(BTN1A1)、黄嘌呤脱氢酶(XDH)、围脂滴蛋白1(PLIN1)和PLIN2在不同乳脂率德宏奶水牛乳腺组织中的表达差异。试验选取同一养殖小区的健康德宏奶水牛216头,采集乳样,用乳品分析仪测定乳脂率。根据乳脂率测定结果,分为低乳脂率组(L组,<7.0%)、中乳脂率组(M组,7.5%±0.5%)和高乳脂率组(H组,>8.0%),每组选取第2胎、年龄相近、处于泌乳中期的德宏奶水牛各3头,采集乳样,进行乳脂率测定;屠宰后采集乳腺组织,提取总RNA,利用实时荧光定量PCR技术检测脂滴形成相关基因的mRNA表达水平,并与乳脂率及脂肪酸含量进行相关性分析。试验结果显示,BTN1A1、XDH、PLIN1和PLIN2基因具有相同的表达趋势:H组>M组>L组;其中H组德宏奶水牛乳腺组织BTN1A1、XDH、PLIN1和PLIN2基因mRNA表达水平均极显著高于M组和L组(P<0.01);M组BTN1A1基因表达水平与L组差异不显著(P>0.05),但XDH、PLIN1和PLIN2基因mRNA表达水平均极显著高于L组(P<0.01)。相关性分析表明,BTN1A1、XDH、PLIN1和PLIN2基因表达水平均与乳脂率、总脂肪酸、长链脂肪酸及不饱和脂肪酸含量呈极显著正相关(P<0.01)。本研究结果表明,BTN1A1、XDH、PLIN1和PLIN2基因在乳腺组织的表达可能对德宏奶水牛的乳脂合成及分泌有显著促进作用,可为深入解析脂滴形成相关基因在泌乳过程中的调控机制提供参考。 展开更多

关键词 德宏奶水牛 乳腺组织 脂滴形成相关基因 基因表达

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槟榔江水牛Dmrt7基因克隆及分子特征、组织表达谱分析

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作者 伍姗 吉丽 +4 位作者 张永云 杜平 康定富 哈福 苗永旺 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2017年第4期612-619,共8页

【目的】Dmrt7基因是Dmrt基因家族成员之一,影响公畜精子形成。迄今,有关水牛精子发生的遗传基础的研究很少,本研究旨在对槟榔江水牛Dmrt7基因完整CDS区进行克隆和组织差异表达分析。【方法】采用RT-PCR和功能生物信息学方法。【结果】... 【目的】Dmrt7基因是Dmrt基因家族成员之一,影响公畜精子形成。迄今,有关水牛精子发生的遗传基础的研究很少,本研究旨在对槟榔江水牛Dmrt7基因完整CDS区进行克隆和组织差异表达分析。【方法】采用RT-PCR和功能生物信息学方法。【结果】槟榔江水牛Dmrt7基因完整编码区序列长1 113 bp,编码370个氨基酸;Dmrt7包含DM和DMRT-like两个保守结构域,无信号肽,无跨膜结构,为核内蛋白。同源性分析显示,水牛与其他牛科物种Dmrt7氨基酸序列相似度达95%以上。在检测的10个组织中,Dmrt7基因仅在水牛睾丸组织中表达且高表达。在第6外显子发现1个SNP位点(c.665A>G),引起了p.Q222R的替换,此位点的替换对Dmrt7蛋白功能无影响。【结论】有助于了解水牛Dmrt7基因的基本功能。 展开更多

关键词 槟榔江水牛 Draft7基因 DM结构域 精子生成 遗传变异 生物信息学分析

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槟榔江水牛胃型LYZ C基因分离鉴定及功能生物信息学分析

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作者 黄静 保志鹏 +4 位作者 范新阳 张永云 杜平 康定富 苗永旺 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2018年第4期640-646,共7页

【目的】溶菌酶是一种由动物产生的抗微生物酶,构成动物体先天免疫系统的一部分,在反刍动物的皱胃中还具有消化功能。迄今,普通牛溶菌酶C基因家族的分子遗传特征已被深入解析,但有关水牛溶菌酶C的研究报道较少。【方法】采用PCR产物直... 【目的】溶菌酶是一种由动物产生的抗微生物酶,构成动物体先天免疫系统的一部分,在反刍动物的皱胃中还具有消化功能。迄今,普通牛溶菌酶C基因家族的分子遗传特征已被深入解析,但有关水牛溶菌酶C的研究报道较少。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对槟榔江水牛胃型溶菌酶C基因编码区进行了分段扩增测序、序列组装和开放阅读框的确定,并结合已发表的其他牛科物种同源序列进行了生物信息学分析。【结果】序列分析表明:水牛胃型溶菌酶C基因编码区长444 bp,编码1个由147个氨基酸残基组成的多肽,包含1个N端信号肽和1段由129个氨基酸组成的成熟肽。水牛胃型溶菌酶C成熟肽分子量为14.41 ku,等电点为6.32,含有1个alpha-lactalbumin/lysozyme C保守结构域(19~145AA),不含有跨膜结构域,为亲水蛋白,在胞外发挥生物功能;在三维结构上与普通牛的溶菌酶模板(2z2f.1.A)有99.22%的一致性;在基于氨基酸序列构建的系统树上,水牛与普通牛、瘤牛、野牦牛和野牛聚在一起,且有较高的支持率(88%)。【结论】槟榔江水牛与其他牛科物种的胃型溶菌酶具有相似的功能。 展开更多

关键词 槟榔江水牛 溶菌酶C基因 皱胃 生物信息学分析 基因功能

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槟榔江水牛OXCT1基因的分子特征及组织表达谱分析

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作者 何情 刘琴 +2 位作者 哈福 张永云 苗永旺 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第6期1576-1584,共9页

本研究对槟榔江水牛3-酮酸辅酶A转移酶1(3-oxoacid CoA-transferase 1,OXCT1)基因的完整CDS区进行了PCR扩增,并对其功能生物信息学和多组织差异表达进行了分析。以普通牛OXCT1基因序列(GenBank登录号:XM006076397)为参考序列,采用Primer... 本研究对槟榔江水牛3-酮酸辅酶A转移酶1(3-oxoacid CoA-transferase 1,OXCT1)基因的完整CDS区进行了PCR扩增,并对其功能生物信息学和多组织差异表达进行了分析。以普通牛OXCT1基因序列(GenBank登录号:XM006076397)为参考序列,采用Primer Premier 5.0软件设计引物序列,以提取的槟榔江水牛基因组DNA为模板,PCR扩增获得槟榔江水牛OXCT1基因mRNA序列,扩增产物经测序后利用ORF Finder软件进行开放阅读框识别,获得水牛OXCT1基因CDS区全序列,并对其进行生物信息学分析。结果显示,槟榔江水牛OXCT1基因CDS序列全长1 563 bp,编码520个氨基酸,蛋白分子式为C2509H4041N687O746S23,分子质量为56.50 ku,理论等电点(pI)为8.69,不稳定系数为27.49,平均疏水性(GRAVY)为-0.097,该蛋白属弱亲水性蛋白。OXCT1蛋白无信号肽和跨膜结构,属于线粒体膜蛋白;包含pcaJscoBfam和AtoD 2个保守结构域,且具有5个功能活性位点。槟榔江水牛与普通牛、藏羚羊等5个物种的OXCT1氨基酸序列同源性≥97%。对槟榔江水牛13个组织进行表达谱分析表明,在泌乳期,OXCT1基因在乳腺中表达量最高,在肾脏、垂体、脂肪、大脑、皮肤和肌肉中不表达;在非泌乳期,OXCT1基因在除脂肪以外的其他12个组织中都有表达。OXCT1基因在槟榔江水牛泌乳期乳腺组织中表达量最高,推测其可能参与了水牛的乳脂合成调控事件。本研究结果可为深入了解乳脂合成代谢及其调控机制提供依据。 展开更多

关键词 槟榔江水牛 OXCT1基因 克隆 生物信息学 组织表达谱

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