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灰葡萄孢基因中微卫星序列分析
被引量:
2
1
作者
张悦
施唯
+2 位作者
李丹
路沁
陈子牛
《江苏农业科学》
北大核心
2013年第4期44-46,共3页
微卫星(SSR)一般是指由单、双、三、四、五和六核苷酸重复单元串联排列的简单重复序列,它广泛分布于生物基因组内,在不同生物中,微卫星DNA的数目、类型及其分布情况存在很大的差异。本研究主要统计了已公布的灰葡萄孢基因序列中的SSR数...
微卫星(SSR)一般是指由单、双、三、四、五和六核苷酸重复单元串联排列的简单重复序列,它广泛分布于生物基因组内,在不同生物中,微卫星DNA的数目、类型及其分布情况存在很大的差异。本研究主要统计了已公布的灰葡萄孢基因序列中的SSR数量及类型,在灰葡萄孢的564个预测基因区域中发现669个微卫星序列,其中大多数基因(477个基因)只含有1个碱基SSR,占含SSR基因总数的71.3%;72个基因含有2个碱基SSR,13个基因含有3个碱基SSR,含4个和5个碱基SSR的基因则各只有1个。所有SSR序列中,出现数量最多的为3个碱基和6个碱基的SSR序列,分别达到了135次和330次,1个碱基、2个碱基、4个碱基和5个碱基的SSR则分别出现了7、41、64和92次。SSR碱基数越多,重复的次数越少,重复次数最少的SSR是6个碱基的AGAGGG重复。重复次数最高的SSR为122次,是3个碱基的AAT重复,这表明,在选择压力下,SSR趋向于密码子的整数倍,这与其他物种的分析结果一致。发现大多数含有SSR的基因并没有明确的功能描述,这可能是由于这些基因受到SSR的影响而在进化上变化较快所致。
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关键词
灰葡萄孢
微卫星序列
基因组
生物信息学
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职称材料
不同环境因素对昆明本地灰葡萄孢、黄曲霉菌株生长的影响
被引量:
1
2
作者
张悦
李丹
+1 位作者
陈子牛
黄晓雯
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第7期118-120,共3页
对昆明市宜良县玫瑰发病植株上分离获得的1个灰葡萄孢菌株和1个昆明本地土壤中分离的黄曲霉菌株的生物学特性进行了分析。结果发现,昆明花卉致病灰葡萄孢菌株在4~25℃条件下均可生长,在25℃下生长速度最快,4℃时相对较慢,而在37℃时生...
对昆明市宜良县玫瑰发病植株上分离获得的1个灰葡萄孢菌株和1个昆明本地土壤中分离的黄曲霉菌株的生物学特性进行了分析。结果发现,昆明花卉致病灰葡萄孢菌株在4~25℃条件下均可生长,在25℃下生长速度最快,4℃时相对较慢,而在37℃时生长几乎停止;黄曲霉在4、37℃时生长均受到明显抑制,只在25℃时才能正常生长,表明黄曲霉菌株对温度要更加敏感;pH值对于灰葡萄孢菌株的生长影响相对较小,灰葡萄孢在偏酸环境中生长较快;pH值对于黄曲霉菌株的生长影响较大,黄曲霉在中性及偏碱环境中生长明显较快;光照对灰葡萄孢菌株生长的影响大于黄曲霉菌株,这可能和黄曲霉腐生于土壤,对光照刺激不敏感有关;2种菌株在不同培养基上的生长情况表明,两者都可以利用葡萄糖、蔗糖为碳源生长,碳源对灰葡萄孢菌株生长几乎没有影响,而黄曲霉利用葡萄糖的能力要强于蔗糖,因此高葡萄糖环境可能更易于黄曲霉生长。
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关键词
灰葡萄孢
黄曲霉
温度
PH值
光照
培养基
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职称材料
禾谷镰刀菌全基因组候选效应因子预测与分析
被引量:
2
3
作者
张悦
施维
+2 位作者
李丹
徐志雄
陈子牛
《江苏农业科学》
2019年第6期81-81,82-84,共2页
本研究根据已公布的禾谷镰刀菌的全基因组信息,以其全基因组蛋白序列为试验材料,通过生物信息学方法,对其候选效应分子及其功能进行预测和分析。首先利用SignalP、TMHMM、Protcomp、big-PI Predictor、TargetP等程序依次预测出其分泌类...
本研究根据已公布的禾谷镰刀菌的全基因组信息,以其全基因组蛋白序列为试验材料,通过生物信息学方法,对其候选效应分子及其功能进行预测和分析。首先利用SignalP、TMHMM、Protcomp、big-PI Predictor、TargetP等程序依次预测出其分泌类型的蛋白,再通过其序列大小和半胱氨酸的含量作进一步筛选,最后利用Blastp工具与非冗余蛋白质数据库进行比对,找出数据库中没有蛋白同源性的序列,从而获得候选效应分子。最终对禾谷镰刀菌全基因组的14 038个蛋白序列进行分析,预测了126个符合条件的候选效应分子。本研究通过LTR-FINDER程序对禾谷镰刀菌全基因组内的转座子进行分析,但未发现转座子存在,值得进一步分析研究。本研究采用生物信息学分析方法预测出了禾谷镰刀菌的候选效应分子并查找其基因组内转座子情况,可为进一步研究这些效应分子的功能,了解禾谷镰刀菌进化奠定基础。
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关键词
禾谷镰刀菌
全基因组
候选效应因子
转座子
生物信息学
致病机制
进化历程
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职称材料
核盘菌基因组微卫星序列分析
4
作者
张悦
李丹
+1 位作者
陈子牛
王丽燕
《广东农业科学》
CAS
2015年第1期128-132,共5页
利用已经公布的核盘菌基因组测序结果,对已有的核盘菌基因组中SSR的类型、大小及分布等数据进行统计分析。在核盘菌基因组内发现1 693个SSR序列,其中出现频率最高的为6碱基和4碱基的SSR序列,分别达到577次和449次,1碱基、3碱基和5碱基的...
利用已经公布的核盘菌基因组测序结果,对已有的核盘菌基因组中SSR的类型、大小及分布等数据进行统计分析。在核盘菌基因组内发现1 693个SSR序列,其中出现频率最高的为6碱基和4碱基的SSR序列,分别达到577次和449次,1碱基、3碱基和5碱基的SSR则分别出现97、180、57次。其中有340个SSR序列出现在308个基因内。大多数基因(284个基因)都只含有1个SSR,占含SSR基因总数的92.21%;17个基因中含有2个SSR,6个基因中含有3个SSR,含4个SSR的基因只有1个。在基因序列内,出现最多的是3碱基与6碱基的SSR,这表明较之基因间区,在选择压力下基因内SSR多趋向于密码子的整数倍,这与其他物种的分析结果一致。为了解含有较多SSR序列与核盘菌基因功能的关系,将含2个以上SSR的基因预测蛋白序列根据NCBI网站CDD软件进行比对发现,24个基因只有6个具有保守的蛋白结构域,且这些结构域多与转录、DNA修复有关。
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关键词
微卫星序列
核盘菌
基因组
分子标记
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职称材料
表面设置热反射涂层混凝土的吸收系数反演计算
被引量:
5
5
作者
杨澍桔
程承
+1 位作者
包琪
钟媛
《森林工程》
2019年第2期87-92,共6页
为降低太阳热辐射对桥梁混凝土温度效应,提高桥梁混凝土耐久性,使用环氧树脂、热反射隔热功能颜(填)料,在实验室制备白色、红色及灰色三种太阳热反射涂料。采用有限差分法,按一维传导模型对不同颜色涂装混凝土在室外温度环境下进行表面...
为降低太阳热辐射对桥梁混凝土温度效应,提高桥梁混凝土耐久性,使用环氧树脂、热反射隔热功能颜(填)料,在实验室制备白色、红色及灰色三种太阳热反射涂料。采用有限差分法,按一维传导模型对不同颜色涂装混凝土在室外温度环境下进行表面吸收系数反演计算分析,并与未涂装混凝土对比分析研究。结果表明:涂刷白色涂层、红色涂层、灰色涂层的混凝土和未涂装的混凝土的太阳辐射吸收系数分别为0. 22、0. 26、0. 35、0. 55,最大温差依次为:白色9. 8℃、红色7. 8℃,灰色5. 8℃。该结果为太阳热反射防护涂料在桥梁混应用技术的进一步研究与推广提供理论参考。
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关键词
桥梁混凝土
热反射涂层
太阳热辐射吸收系数
反演计算
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职称材料
中职汽车专业教学中培养学生自主学习能力的路径
被引量:
3
6
作者
张小兴
《南方农机》
2020年第4期94-95,共2页
信息化时代,知识种类众多,对中职院校的学生而言,不仅要具备良好的知识能力,还应具备岗位适应能力和实践操作水平。只有这样,才能在实际的学习过程中不断地提升自主学习能力与创新意识。汽车专业关乎我国未来的经济支柱型产业,学生自主...
信息化时代,知识种类众多,对中职院校的学生而言,不仅要具备良好的知识能力,还应具备岗位适应能力和实践操作水平。只有这样,才能在实际的学习过程中不断地提升自主学习能力与创新意识。汽车专业关乎我国未来的经济支柱型产业,学生自主能力培养是中职学校汽车专业教学的核心内容。鉴于此,文章从学生自主学习能力的相关要求出发,探讨中职汽车专业教学中培养学生自主学习能力的有效路径。
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关键词
汽车专业教学
自主学习能力
路径
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职称材料
现代学徒制在中职汽车类专业教学中的应用
被引量:
1
7
作者
张小兴
《湖北农机化》
2020年第6期129-130,共2页
"中国制造2025"计划的出现,让社会对于高端技术型人才的需求量不断增加,高等职业院校作为人才培养的主阵地,在政府部门的支持下,也开始参考"现代学徒制"人才培养模式,谋求新时期的生存和发展.在中职院校的汽车类专...
"中国制造2025"计划的出现,让社会对于高端技术型人才的需求量不断增加,高等职业院校作为人才培养的主阵地,在政府部门的支持下,也开始参考"现代学徒制"人才培养模式,谋求新时期的生存和发展.在中职院校的汽车类专业教学中,也应该基于不同的人才培养方向形成稳定系统化的职业教育模式.有鉴于此,本文基于现代学徒制应用中遇到的现实问题,探究现代学徒制在中职汽车类专业教学过程中的应用策略.
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关键词
现代学徒制
汽车类专业教学
应用方法
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职称材料
题名
灰葡萄孢基因中微卫星序列分析
被引量:
2
1
作者
张悦
施唯
李丹
路沁
陈子牛
机构
昆明
学院
生命科学与技术系
个旧市农民科技教育培训中心
云南交通技师学院
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2013年第4期44-46,共3页
基金
云南省应用基础研究计划(青年项目)(编号:2012FD046)
云南省教育厅科学研究基金一般项目(编号:2011Y234)
文摘
微卫星(SSR)一般是指由单、双、三、四、五和六核苷酸重复单元串联排列的简单重复序列,它广泛分布于生物基因组内,在不同生物中,微卫星DNA的数目、类型及其分布情况存在很大的差异。本研究主要统计了已公布的灰葡萄孢基因序列中的SSR数量及类型,在灰葡萄孢的564个预测基因区域中发现669个微卫星序列,其中大多数基因(477个基因)只含有1个碱基SSR,占含SSR基因总数的71.3%;72个基因含有2个碱基SSR,13个基因含有3个碱基SSR,含4个和5个碱基SSR的基因则各只有1个。所有SSR序列中,出现数量最多的为3个碱基和6个碱基的SSR序列,分别达到了135次和330次,1个碱基、2个碱基、4个碱基和5个碱基的SSR则分别出现了7、41、64和92次。SSR碱基数越多,重复的次数越少,重复次数最少的SSR是6个碱基的AGAGGG重复。重复次数最高的SSR为122次,是3个碱基的AAT重复,这表明,在选择压力下,SSR趋向于密码子的整数倍,这与其他物种的分析结果一致。发现大多数含有SSR的基因并没有明确的功能描述,这可能是由于这些基因受到SSR的影响而在进化上变化较快所致。
关键词
灰葡萄孢
微卫星序列
基因组
生物信息学
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
不同环境因素对昆明本地灰葡萄孢、黄曲霉菌株生长的影响
被引量:
1
2
作者
张悦
李丹
陈子牛
黄晓雯
机构
昆明
学院
生命科学与技术系
云南交通技师学院
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第7期118-120,共3页
基金
云南省科技厅应用基础研究计划(青年项目)(编号:2012FD046)
文摘
对昆明市宜良县玫瑰发病植株上分离获得的1个灰葡萄孢菌株和1个昆明本地土壤中分离的黄曲霉菌株的生物学特性进行了分析。结果发现,昆明花卉致病灰葡萄孢菌株在4~25℃条件下均可生长,在25℃下生长速度最快,4℃时相对较慢,而在37℃时生长几乎停止;黄曲霉在4、37℃时生长均受到明显抑制,只在25℃时才能正常生长,表明黄曲霉菌株对温度要更加敏感;pH值对于灰葡萄孢菌株的生长影响相对较小,灰葡萄孢在偏酸环境中生长较快;pH值对于黄曲霉菌株的生长影响较大,黄曲霉在中性及偏碱环境中生长明显较快;光照对灰葡萄孢菌株生长的影响大于黄曲霉菌株,这可能和黄曲霉腐生于土壤,对光照刺激不敏感有关;2种菌株在不同培养基上的生长情况表明,两者都可以利用葡萄糖、蔗糖为碳源生长,碳源对灰葡萄孢菌株生长几乎没有影响,而黄曲霉利用葡萄糖的能力要强于蔗糖,因此高葡萄糖环境可能更易于黄曲霉生长。
关键词
灰葡萄孢
黄曲霉
温度
PH值
光照
培养基
分类号
S432.44 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
禾谷镰刀菌全基因组候选效应因子预测与分析
被引量:
2
3
作者
张悦
施维
李丹
徐志雄
陈子牛
机构
昆明
学院
生命科学与技术系
云南
省个旧市农民科技教育培训中心
云南交通技师学院
出处
《江苏农业科学》
2019年第6期81-81,82-84,共2页
基金
云南省高校特色生物资源开发与利用重点实验室开放基金项目(编号:GXKJ201606)
云南省昆明市滇池水生态恢复重点实验室开放项目(编号:SST201607)
文摘
本研究根据已公布的禾谷镰刀菌的全基因组信息,以其全基因组蛋白序列为试验材料,通过生物信息学方法,对其候选效应分子及其功能进行预测和分析。首先利用SignalP、TMHMM、Protcomp、big-PI Predictor、TargetP等程序依次预测出其分泌类型的蛋白,再通过其序列大小和半胱氨酸的含量作进一步筛选,最后利用Blastp工具与非冗余蛋白质数据库进行比对,找出数据库中没有蛋白同源性的序列,从而获得候选效应分子。最终对禾谷镰刀菌全基因组的14 038个蛋白序列进行分析,预测了126个符合条件的候选效应分子。本研究通过LTR-FINDER程序对禾谷镰刀菌全基因组内的转座子进行分析,但未发现转座子存在,值得进一步分析研究。本研究采用生物信息学分析方法预测出了禾谷镰刀菌的候选效应分子并查找其基因组内转座子情况,可为进一步研究这些效应分子的功能,了解禾谷镰刀菌进化奠定基础。
关键词
禾谷镰刀菌
全基因组
候选效应因子
转座子
生物信息学
致病机制
进化历程
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
核盘菌基因组微卫星序列分析
4
作者
张悦
李丹
陈子牛
王丽燕
机构
昆明
学院
生命科学与技术系
云南交通技师学院
出处
《广东农业科学》
CAS
2015年第1期128-132,共5页
基金
云南省科技厅应用基础研究计划青年项目(2012FD046)
文摘
利用已经公布的核盘菌基因组测序结果,对已有的核盘菌基因组中SSR的类型、大小及分布等数据进行统计分析。在核盘菌基因组内发现1 693个SSR序列,其中出现频率最高的为6碱基和4碱基的SSR序列,分别达到577次和449次,1碱基、3碱基和5碱基的SSR则分别出现97、180、57次。其中有340个SSR序列出现在308个基因内。大多数基因(284个基因)都只含有1个SSR,占含SSR基因总数的92.21%;17个基因中含有2个SSR,6个基因中含有3个SSR,含4个SSR的基因只有1个。在基因序列内,出现最多的是3碱基与6碱基的SSR,这表明较之基因间区,在选择压力下基因内SSR多趋向于密码子的整数倍,这与其他物种的分析结果一致。为了解含有较多SSR序列与核盘菌基因功能的关系,将含2个以上SSR的基因预测蛋白序列根据NCBI网站CDD软件进行比对发现,24个基因只有6个具有保守的蛋白结构域,且这些结构域多与转录、DNA修复有关。
关键词
微卫星序列
核盘菌
基因组
分子标记
Keywords
SSR
Sclerotinia sclerotiorum
genome
molecular marker
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
Q933 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
表面设置热反射涂层混凝土的吸收系数反演计算
被引量:
5
5
作者
杨澍桔
程承
包琪
钟媛
机构
云南交通技师学院
公路工程应用技术系
西南林业大学土木工程
学院
出处
《森林工程》
2019年第2期87-92,共6页
基金
安宁市科技计划项目(安科技字2015(6)号)
云南省交通运输厅科技计划项目(云交科2016(A)15)
文摘
为降低太阳热辐射对桥梁混凝土温度效应,提高桥梁混凝土耐久性,使用环氧树脂、热反射隔热功能颜(填)料,在实验室制备白色、红色及灰色三种太阳热反射涂料。采用有限差分法,按一维传导模型对不同颜色涂装混凝土在室外温度环境下进行表面吸收系数反演计算分析,并与未涂装混凝土对比分析研究。结果表明:涂刷白色涂层、红色涂层、灰色涂层的混凝土和未涂装的混凝土的太阳辐射吸收系数分别为0. 22、0. 26、0. 35、0. 55,最大温差依次为:白色9. 8℃、红色7. 8℃,灰色5. 8℃。该结果为太阳热反射防护涂料在桥梁混应用技术的进一步研究与推广提供理论参考。
关键词
桥梁混凝土
热反射涂层
太阳热辐射吸收系数
反演计算
Keywords
Bridge concrete
heat-reflective coating
solar thermal radiation absorption coefficient
inverse calculation
分类号
U444 [建筑科学—桥梁与隧道工程]
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职称材料
题名
中职汽车专业教学中培养学生自主学习能力的路径
被引量:
3
6
作者
张小兴
机构
云南交通技师学院
出处
《南方农机》
2020年第4期94-95,共2页
文摘
信息化时代,知识种类众多,对中职院校的学生而言,不仅要具备良好的知识能力,还应具备岗位适应能力和实践操作水平。只有这样,才能在实际的学习过程中不断地提升自主学习能力与创新意识。汽车专业关乎我国未来的经济支柱型产业,学生自主能力培养是中职学校汽车专业教学的核心内容。鉴于此,文章从学生自主学习能力的相关要求出发,探讨中职汽车专业教学中培养学生自主学习能力的有效路径。
关键词
汽车专业教学
自主学习能力
路径
分类号
G712 [文化科学—职业技术教育学]
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职称材料
题名
现代学徒制在中职汽车类专业教学中的应用
被引量:
1
7
作者
张小兴
机构
云南交通技师学院
出处
《湖北农机化》
2020年第6期129-130,共2页
文摘
"中国制造2025"计划的出现,让社会对于高端技术型人才的需求量不断增加,高等职业院校作为人才培养的主阵地,在政府部门的支持下,也开始参考"现代学徒制"人才培养模式,谋求新时期的生存和发展.在中职院校的汽车类专业教学中,也应该基于不同的人才培养方向形成稳定系统化的职业教育模式.有鉴于此,本文基于现代学徒制应用中遇到的现实问题,探究现代学徒制在中职汽车类专业教学过程中的应用策略.
关键词
现代学徒制
汽车类专业教学
应用方法
分类号
U462-4 [机械工程—车辆工程]
G712 [文化科学—职业技术教育学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
灰葡萄孢基因中微卫星序列分析
张悦
施唯
李丹
路沁
陈子牛
《江苏农业科学》
北大核心
2013
2
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职称材料
2
不同环境因素对昆明本地灰葡萄孢、黄曲霉菌株生长的影响
张悦
李丹
陈子牛
黄晓雯
《江苏农业科学》
北大核心
2015
1
在线阅读
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职称材料
3
禾谷镰刀菌全基因组候选效应因子预测与分析
张悦
施维
李丹
徐志雄
陈子牛
《江苏农业科学》
2019
2
在线阅读
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职称材料
4
核盘菌基因组微卫星序列分析
张悦
李丹
陈子牛
王丽燕
《广东农业科学》
CAS
2015
0
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职称材料
5
表面设置热反射涂层混凝土的吸收系数反演计算
杨澍桔
程承
包琪
钟媛
《森林工程》
2019
5
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职称材料
6
中职汽车专业教学中培养学生自主学习能力的路径
张小兴
《南方农机》
2020
3
在线阅读
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职称材料
7
现代学徒制在中职汽车类专业教学中的应用
张小兴
《湖北农机化》
2020
1
在线阅读
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职称材料
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