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基于全基因组关联分析和遗传多样性的大豆裂荚性状解析
被引量：
1
1
作者
宋英培
王灿
+3 位作者
周会汶
孔可可
许孟歌
王瑞凯
《生物技术通报》
北大核心
2025年第2期97-106,共10页
【目的】探究抗裂荚分子机制,挖掘抗裂荚大豆种质资源,可为揭示大豆裂荚性遗传和驯化机理、加速南方大豆抗裂荚新品种的选育提供依据。【方法】结合全基因组关联分析定位和野生栽培大豆群体遗传多样性分析,探寻大豆裂荚性相关基因。使用...
【目的】探究抗裂荚分子机制,挖掘抗裂荚大豆种质资源,可为揭示大豆裂荚性遗传和驯化机理、加速南方大豆抗裂荚新品种的选育提供依据。【方法】结合全基因组关联分析定位和野生栽培大豆群体遗传多样性分析,探寻大豆裂荚性相关基因。使用302份大豆材料进行2年表型测定,借助95744个单核苷酸多态性标记进行全基因组关联分析。使用包括1308份栽培大豆和203份野生大豆的重测序数据进行QTL区段序列的遗传多样性分析。【结果】通过全基因组关联分析检测到3个表型变异解释率大于10%的QTL位点,分别为qPdh-Chr08(Gm08:3048312)、qPdh-Chr15(Gm15:312814)和qPdh-Chr16(Gm16:29951529)。其中qPdh-Chr16是已知基因pdh1(Pod dehiscence habit 1)。结合野生和栽培大豆重测序数据发现,qPdh-Chr08和qPdh-Chr15内存在人工选择导致的群体分化序列,发现2个重要候选基因Glyma.08G038600和Glyma.15G003600。根据功能注释发现,这两个基因参与生长素和木质素的代谢。【结论】使用2年数据检测到大豆裂荚性2个新的QTL位点qPdh-Chr08和qPdh-Chr15,并在QTL区域内鉴定野生栽培大豆分化基因,最终筛选到2个重要候选基因。
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关键词
大豆
裂荚性
全基因组关联分析
遗传多样性
作物驯化
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职称材料
题名
基于全基因组关联分析和遗传多样性的大豆裂荚性状解析
被引量：
1
1
作者
宋英培
王灿
周会汶
孔可可
许孟歌
王瑞凯
机构
九江学院药学与生命科学学院江西油茶研究中心/大豆研究中心
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第2期97-106,共10页
基金
国家自然科学基金项目(32260484,31760392)
江西省自然科学基金项目(20232BAB215028,20224BAB215014)
江西省现代农业产业技术体系建设专项(JXARS-24-01)。
文摘
【目的】探究抗裂荚分子机制,挖掘抗裂荚大豆种质资源,可为揭示大豆裂荚性遗传和驯化机理、加速南方大豆抗裂荚新品种的选育提供依据。【方法】结合全基因组关联分析定位和野生栽培大豆群体遗传多样性分析,探寻大豆裂荚性相关基因。使用302份大豆材料进行2年表型测定,借助95744个单核苷酸多态性标记进行全基因组关联分析。使用包括1308份栽培大豆和203份野生大豆的重测序数据进行QTL区段序列的遗传多样性分析。【结果】通过全基因组关联分析检测到3个表型变异解释率大于10%的QTL位点,分别为qPdh-Chr08(Gm08:3048312)、qPdh-Chr15(Gm15:312814)和qPdh-Chr16(Gm16:29951529)。其中qPdh-Chr16是已知基因pdh1(Pod dehiscence habit 1)。结合野生和栽培大豆重测序数据发现,qPdh-Chr08和qPdh-Chr15内存在人工选择导致的群体分化序列,发现2个重要候选基因Glyma.08G038600和Glyma.15G003600。根据功能注释发现,这两个基因参与生长素和木质素的代谢。【结论】使用2年数据检测到大豆裂荚性2个新的QTL位点qPdh-Chr08和qPdh-Chr15,并在QTL区域内鉴定野生栽培大豆分化基因,最终筛选到2个重要候选基因。
关键词
大豆
裂荚性
全基因组关联分析
遗传多样性
作物驯化
Keywords
soybeans
pod dehiscence habit
whole genome association analysis
genetic diversity
crop domestication
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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作者
出处
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被引量
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1
基于全基因组关联分析和遗传多样性的大豆裂荚性状解析
宋英培
王灿
周会汶
孔可可
许孟歌
王瑞凯
《生物技术通报》
北大核心
2025
1
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