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大白猪ENO3基因多态性及其与生长性状的关联分析
被引量：
5
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作者
赵玉强
陈鑫
+5 位作者
李清春
马继林
董银河
汪德明
郭凌云
黄涛
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第1期188-196,共9页
【目的】挖掘大白猪β-烯醇化酶(β-enolase,ENO3)基因单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP间的连锁不平衡程度及其与生长性状的相关性。【方法】选取大白母猪316头,采用混合DNA样本PCR扩增产物测序,确定ENO3基因SNP位点。采用GenoPlexs分...
【目的】挖掘大白猪β-烯醇化酶(β-enolase,ENO3)基因单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP间的连锁不平衡程度及其与生长性状的相关性。【方法】选取大白母猪316头,采用混合DNA样本PCR扩增产物测序,确定ENO3基因SNP位点。采用GenoPlexs分型技术对每个个体的目标SNP位点进行基因分型,并与大白猪体重达100 kg时的日增重、日龄、背膘厚、眼肌面积和眼肌厚进行连锁不平衡和关联分析,探究ENO3基因SNP与大白猪生长性状的相关性。【结果】共鉴定出9个SNPs位点,均为已知SNPs,其中rs196953768与rs324943047、rs345530479、rs329283992完全连锁(D’=1,r^(2)=1),与rs342598032呈强连锁(D’=1,r^(2)=0.99);rs327882211与rs341541240、rs325279236呈强连锁(D’=1,r^(2)>0.7)。ENO3基因rs196953768及完全连锁位点与大白猪体重达100 kg时的日龄和日增重均呈显著相关(P<0.05);rs327882211和rs341541240位点与体重达100 kg时的眼肌面积和眼肌厚均呈显著相关(P<0.05);rs325279236与体重达100 kg时的眼肌面积呈显著相关(P<0.05);rs786427749和rs342598032位点与上述各性状的相关性均不显著(P>0.05)。【结论】本研究共鉴定出9个SNPs,4个完全连锁的SNPs;筛选到7个与生产性状显著相关的SNPs,为大白猪的分子标记辅助选育提供了参考数据。
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关键词
大白猪
ENO3基因
单核苷酸多态性(SNP)
生长性状
连锁不平衡分析
关联分析
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题名
大白猪ENO3基因多态性及其与生长性状的关联分析
被引量：
5
1
作者
赵玉强
陈鑫
李清春
马继林
董银河
汪德明
郭凌云
黄涛
机构
乌鲁木齐正大畜牧有限公司博士后科研工作站
石河子大学动物科技学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第1期188-196,共9页
基金
中国博士后科学基金(2019M663961XB)
新疆维吾尔自治区优秀博士后研究人员资助项目。
文摘
【目的】挖掘大白猪β-烯醇化酶(β-enolase,ENO3)基因单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP间的连锁不平衡程度及其与生长性状的相关性。【方法】选取大白母猪316头,采用混合DNA样本PCR扩增产物测序,确定ENO3基因SNP位点。采用GenoPlexs分型技术对每个个体的目标SNP位点进行基因分型,并与大白猪体重达100 kg时的日增重、日龄、背膘厚、眼肌面积和眼肌厚进行连锁不平衡和关联分析,探究ENO3基因SNP与大白猪生长性状的相关性。【结果】共鉴定出9个SNPs位点,均为已知SNPs,其中rs196953768与rs324943047、rs345530479、rs329283992完全连锁(D’=1,r^(2)=1),与rs342598032呈强连锁(D’=1,r^(2)=0.99);rs327882211与rs341541240、rs325279236呈强连锁(D’=1,r^(2)>0.7)。ENO3基因rs196953768及完全连锁位点与大白猪体重达100 kg时的日龄和日增重均呈显著相关(P<0.05);rs327882211和rs341541240位点与体重达100 kg时的眼肌面积和眼肌厚均呈显著相关(P<0.05);rs325279236与体重达100 kg时的眼肌面积呈显著相关(P<0.05);rs786427749和rs342598032位点与上述各性状的相关性均不显著(P>0.05)。【结论】本研究共鉴定出9个SNPs,4个完全连锁的SNPs;筛选到7个与生产性状显著相关的SNPs,为大白猪的分子标记辅助选育提供了参考数据。
关键词
大白猪
ENO3基因
单核苷酸多态性(SNP)
生长性状
连锁不平衡分析
关联分析
Keywords
Yorkshire pigs
ENO3 gene
SNP
growth traits
linkage disequilibrium analysis
correlation analysis
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
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被引量
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1
大白猪ENO3基因多态性及其与生长性状的关联分析
赵玉强
陈鑫
李清春
马继林
董银河
汪德明
郭凌云
黄涛
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022
5
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