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杜仲叶片不同发育时期转录组及绿原酸相关基因分析
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作者 王思冉 李慧 +3 位作者 阿日查 金牧兰 庆军 白玉娥 《中南林业科技大学学报》 北大核心 2025年第7期174-187,共14页
【目的】绿原酸是杜仲叶片质量评价的指标性成分,具有抗菌消炎、抗氧化、抗肿瘤及抗肝炎等多种药用价值。本研究在鉴定和挖掘参与调控杜仲叶片绿原酸生物合成的代谢通路及关键基因,为进一步深入解析杜仲叶片绿原酸形成的分子机制提供参... 【目的】绿原酸是杜仲叶片质量评价的指标性成分,具有抗菌消炎、抗氧化、抗肿瘤及抗肝炎等多种药用价值。本研究在鉴定和挖掘参与调控杜仲叶片绿原酸生物合成的代谢通路及关键基因,为进一步深入解析杜仲叶片绿原酸形成的分子机制提供参考。【方法】以内蒙古自治区包头市4月、7月和10月的杜仲叶片为材料,通过高效液相色谱法(HPLC)测定不同时期的杜仲叶片绿原酸含量,利用转录组测序的方法鉴定差异表达基因。【结果】杜仲叶片绿原酸含量从4月至7月再到10月,随着叶片发育呈现先上升后下降趋势。通过转录组测序共得到58.06 Gb Clean data,鉴定到11 689个基因,在T1 vs T2、T1 vs T3和T2 vs T3 3组比较中,下调表达基因数量均高于上调表达基因数量。KEGG富集分析和GO富集分析,均有绿原酸合成相关富集。Kmeans趋势表达将基因划分为10个模块,其中Class4、Class8和Class10中的基因表达量变化趋势与绿原酸含量变化趋势相一致,从Class4、Class8和Class10中鉴定出2个酶,9个基因与绿原酸生物合成相关,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果与RNA-seq结果一致。【结论】杜仲叶片中绿原酸含量随着叶片发育呈现先增加后降低趋势。 展开更多
关键词 杜仲 绿原酸 转录组 差异表达基因(DEGs) 生物信息学分析
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基于CiteSpace的小麦赤霉病研究热点与趋势分析
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作者 关卫东 金牧兰 +2 位作者 李芮 李邦耀 董文成 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第4期510-520,共11页
小麦赤霉病研究对于农业生产和保障全球粮食安全具有重要意义。为深入了解小麦赤霉病研究进展和动态前沿,运用CiteSpace软件,对近20年来Web of Science核心合集中1236篇小麦赤霉病研究文献进行系统分析。结果表明,近20年来小麦赤霉病研... 小麦赤霉病研究对于农业生产和保障全球粮食安全具有重要意义。为深入了解小麦赤霉病研究进展和动态前沿,运用CiteSpace软件,对近20年来Web of Science核心合集中1236篇小麦赤霉病研究文献进行系统分析。结果表明,近20年来小麦赤霉病研究发文量总体呈上升趋势,美国以345篇的发文量位居榜首,中美、中英、中加等国际合作网络较为紧密。研究内容主要集中在病原菌特性、病害防治技术、抗病品种选育等方面;当前研究热点以抗病性鉴定、分子标记辅助选择、新型生物防治剂开发等为主;热门技术方法涉及分子代谢组学、基因组学、遥感监测技术等。展望未来,小麦赤霉病研究将更加注重跨学科合作,致力于开发高效、环保的病害防控策略,以应对全球粮食安全挑战。 展开更多
关键词 小麦赤霉病 Cite Space软件 信息可视化 研究趋势
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