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油橄榄单拷贝核基因遗传标记开发及应用
1
作者
谷秋微
雍巧宁
+6 位作者
王贵德
程葆昶
吕龙强
吕成华
邓煜
张建国
王兆山
《林业科学研究》
北大核心
2025年第4期112-122,共11页
[目的]本研究旨在开发一套具有固定差异的单拷贝核基因遗传标记,在油橄榄育种过程中对每个个体的每条染色体进行尖叶木樨榄遗传成分追踪,为油橄榄育种提供可靠的遗传背景信息和理论基础,也为辅助林木育种提供新的思路与参考。[方法]利...
[目的]本研究旨在开发一套具有固定差异的单拷贝核基因遗传标记,在油橄榄育种过程中对每个个体的每条染色体进行尖叶木樨榄遗传成分追踪,为油橄榄育种提供可靠的遗传背景信息和理论基础,也为辅助林木育种提供新的思路与参考。[方法]利用46个含固定差异的单拷贝核基因标记(single-copy nuclear markers)对3个居群(YGL、JYM、BC1)共117个个体进行扩增与测序并计算相应的遗传多样性,计算YGL、JYM两个居群间的遗传分化,最后对BC1居群的异交参数及遗传成分进行估算。[结果]比对后46个遗传标记长度在604~992 bp之间。YGL居群的遗传多样性大于JYM居群,BC1居群的遗传多样性(π=0.0074,θ_(w)=0.0050)约为YGL居群的2倍。YGL、JYM两个居群间的F_(st)为0.7916,N_(m)为0.0745。Structure结构分析表明YGL与JYM两个居群之间有明显的遗传分化,BC1居群的异交率(t_(m))为100%,JYM、YGL的遗传成分占比分别为25.97%、74.03%。[结论]开发的46个含有固定差异的单拷贝遗传标记稳定可靠,能够明确追踪每条染色体的JYM遗传成分,并且可以粗略估计每个BC1个体中JYM的遗传成分占比。青藏高原隆起使得特提斯海消失,北半球气候发生重大变化。之后YGL和JYM两个居群经历了长期的地理隔离,造成两亚种之间遗传分化越来越高。经过人工杂交、回交,成功将JYM遗传成分引入育种群体,为以后油橄榄新品种选育提供了物质基础和遗传背景。
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关键词
油橄榄
尖叶木樨榄
单拷贝核基因标记
遗传成分追踪
异交率
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职称材料
题名
油橄榄单拷贝核基因遗传标记开发及应用
1
作者
谷秋微
雍巧宁
王贵德
程葆昶
吕龙强
吕成华
邓煜
张建国
王兆山
机构
国家林业和草原局林木培育重点实验室
甘肃省陇南市经济林研究院油
橄榄
研究所
丹江口市兴源生橄榄油科技发展有限公司
出处
《林业科学研究》
北大核心
2025年第4期112-122,共11页
基金
陇南市科技计划项目“陇南油橄榄新种质创制”(2023-S.QKT-01)
国家重点研发计划子课题项目“油橄榄全基因组选择育种与良种选育”(2022YFD220040204)。
文摘
[目的]本研究旨在开发一套具有固定差异的单拷贝核基因遗传标记,在油橄榄育种过程中对每个个体的每条染色体进行尖叶木樨榄遗传成分追踪,为油橄榄育种提供可靠的遗传背景信息和理论基础,也为辅助林木育种提供新的思路与参考。[方法]利用46个含固定差异的单拷贝核基因标记(single-copy nuclear markers)对3个居群(YGL、JYM、BC1)共117个个体进行扩增与测序并计算相应的遗传多样性,计算YGL、JYM两个居群间的遗传分化,最后对BC1居群的异交参数及遗传成分进行估算。[结果]比对后46个遗传标记长度在604~992 bp之间。YGL居群的遗传多样性大于JYM居群,BC1居群的遗传多样性(π=0.0074,θ_(w)=0.0050)约为YGL居群的2倍。YGL、JYM两个居群间的F_(st)为0.7916,N_(m)为0.0745。Structure结构分析表明YGL与JYM两个居群之间有明显的遗传分化,BC1居群的异交率(t_(m))为100%,JYM、YGL的遗传成分占比分别为25.97%、74.03%。[结论]开发的46个含有固定差异的单拷贝遗传标记稳定可靠,能够明确追踪每条染色体的JYM遗传成分,并且可以粗略估计每个BC1个体中JYM的遗传成分占比。青藏高原隆起使得特提斯海消失,北半球气候发生重大变化。之后YGL和JYM两个居群经历了长期的地理隔离,造成两亚种之间遗传分化越来越高。经过人工杂交、回交,成功将JYM遗传成分引入育种群体,为以后油橄榄新品种选育提供了物质基础和遗传背景。
关键词
油橄榄
尖叶木樨榄
单拷贝核基因标记
遗传成分追踪
异交率
Keywords
olive
subsp.cuspidata
single-copy nuclear gene marker
genetic component tracing
outcrossing rate
分类号
S722.5 [农业科学—林木遗传育种]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
油橄榄单拷贝核基因遗传标记开发及应用
谷秋微
雍巧宁
王贵德
程葆昶
吕龙强
吕成华
邓煜
张建国
王兆山
《林业科学研究》
北大核心
2025
0
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