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运用蛋白质组学技术研究结肠黏膜、腺瘤及腺癌组织蛋白的差异表达
被引量：
2
1
作者
崔冀
汪建平
+5 位作者
蔡世荣
彭俊生
黄奕华
何裕隆
骆衍新
胡坤华
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期744-748,共5页
【目的】通过比较结肠正常黏膜、腺瘤、腺癌组织之间的蛋白质组表达差异,寻找结肠腺癌相关的蛋白质,筛选结肠癌早期诊断的分子标志物。【方法】运用比较蛋白质组学技术,对8例结肠癌患者(伴有腺瘤)的正常黏膜、腺瘤、腺癌组织提取的总蛋...
【目的】通过比较结肠正常黏膜、腺瘤、腺癌组织之间的蛋白质组表达差异,寻找结肠腺癌相关的蛋白质,筛选结肠癌早期诊断的分子标志物。【方法】运用比较蛋白质组学技术,对8例结肠癌患者(伴有腺瘤)的正常黏膜、腺瘤、腺癌组织提取的总蛋白进行双向电泳(2-D),分析凝胶图片选择两两间差异表达超过2倍的蛋白质进行MALDI-TOF/TOF质谱分析和生物学信息分析。【结果】成功建立结肠正常粘膜、腺瘤、腺癌的双向凝胶电泳图谱,在凝胶电泳图谱中平均蛋白质斑点数分别为3066、2986和3289,其中两两间表达差异超过2倍的斑点共有31个,质谱分析和数据库检索共鉴定出18种蛋白质,包括keratin8、S100A6、protein disulfide isomerase等。从功能分析,这些差异蛋白与癌细胞的发生、增殖、分化、转移等相关。【结论】比较蛋白质组学能较好地提示结肠腺癌与腺瘤及正常组织间的蛋白质表达差异,而对相关差异表达蛋白的研究有可能为结肠癌的早期诊断和治疗提供新的分子靶向。
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关键词
腺癌
腺瘤
结肠
蛋白质组学
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职称材料
NSUN2通过靶基因PRPS2调控核苷酸代谢从而介导肝癌细胞的增殖
被引量：
7
2
作者
黄奕芝
杨紫青
+3 位作者
温炜杰
唐勤
方乐堃
李孟鸿
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期640-645,共6页
目的:探讨NOP2/Sun RNA甲基转移酶家族成员2(NOP2/Sun RNA methyltransferase 2,NSUN2)在肝癌发展中的功能和机制。方法:比较肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)肝癌数据集中肝癌组织与正常组织NSUN2的mRNA表达水平;Western ...
目的:探讨NOP2/Sun RNA甲基转移酶家族成员2(NOP2/Sun RNA methyltransferase 2,NSUN2)在肝癌发展中的功能和机制。方法:比较肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)肝癌数据集中肝癌组织与正常组织NSUN2的mRNA表达水平;Western blot检测9对肝癌患者肝癌组织与癌旁组织中NSUN2的蛋白表达水平;Kaplan-Meier法分析肝癌TCGA数据集中NSUN2对肝癌生存预后的影响;活细胞动态成像与分析系统记录经shNSUN2慢病毒感染的Huh7和SNU182细胞的实时生长情况及集落形成实验检测细胞增殖能力;基因富集分析(GSEA)肝癌TCGA数据库中高表达NSUN2组富集的信号通路,探索NSUN2可能甲基化的关键基因和参与的信号通路;Pearson法分析TCGA数据集中NSUN2与预测基因的相关性;在SNU182细胞中敲低NSUN2后,用RT-qPCR和Western blot验证预测基因表达的变化。结果:TCGA数据集分析结果及Western blot实验结果显示NSUN2在肝癌组织中高表达。敲低NSUN2后Huh7细胞和SNU182细胞的增殖能力降低。基因富集分析结果显示嘌呤和嘧啶代谢通路在高表达NSUN2组富集。重亚硫酸盐甲基化测序(Bisulfite-Seq)结果与基因富集分析结果存在共同变化基因有PRPS2、ADSL、POLR2D、CANT1、ENTPD4、TXNRD1和CAD。Pearson相关分析结果显示TCGA数据集中NSUN2与PRPS2的mRNA表达呈正相关(r=0.3283,P<0.05)。RT-qPCR和Western blot结果验证了敲低NSUN2后抑制了SNU182细胞中PRPS2的mRNA和蛋白表达。RT-qPCR结果显示敲低NSUN2后嘌呤从头合成相关基因的表达降低。结论:NSUN2可能通过调控PRPS2的表达参与核苷酸代谢,从而影响肝癌细胞增殖。
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关键词
NSUN2
肝癌
细胞增殖
PRPS2
核苷酸代谢
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职称材料
题名
运用蛋白质组学技术研究结肠黏膜、腺瘤及腺癌组织蛋白的差异表达
被引量：
2
1
作者
崔冀
汪建平
蔡世荣
彭俊生
黄奕华
何裕隆
骆衍新
胡坤华
机构
中山大学
附属
第一
医院
胃肠
胰外科
中山大学附属第六医院胃肠病学研究所
／／结直肠肛门外科
中山
医
学
院蛋白质组
学
研究
中心
出处
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期744-748,共5页
基金
广东省科技计划项目(133031)
广东省自然科学基金重点项目(06104601)
教育部新世纪优秀人才支持计划项目(2007年)
文摘
【目的】通过比较结肠正常黏膜、腺瘤、腺癌组织之间的蛋白质组表达差异,寻找结肠腺癌相关的蛋白质,筛选结肠癌早期诊断的分子标志物。【方法】运用比较蛋白质组学技术,对8例结肠癌患者(伴有腺瘤)的正常黏膜、腺瘤、腺癌组织提取的总蛋白进行双向电泳(2-D),分析凝胶图片选择两两间差异表达超过2倍的蛋白质进行MALDI-TOF/TOF质谱分析和生物学信息分析。【结果】成功建立结肠正常粘膜、腺瘤、腺癌的双向凝胶电泳图谱,在凝胶电泳图谱中平均蛋白质斑点数分别为3066、2986和3289,其中两两间表达差异超过2倍的斑点共有31个,质谱分析和数据库检索共鉴定出18种蛋白质,包括keratin8、S100A6、protein disulfide isomerase等。从功能分析,这些差异蛋白与癌细胞的发生、增殖、分化、转移等相关。【结论】比较蛋白质组学能较好地提示结肠腺癌与腺瘤及正常组织间的蛋白质表达差异,而对相关差异表达蛋白的研究有可能为结肠癌的早期诊断和治疗提供新的分子靶向。
关键词
腺癌
腺瘤
结肠
蛋白质组学
Keywords
adenocarcinoma
adenoma
colon
proteomics
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
NSUN2通过靶基因PRPS2调控核苷酸代谢从而介导肝癌细胞的增殖
被引量：
7
2
作者
黄奕芝
杨紫青
温炜杰
唐勤
方乐堃
李孟鸿
机构
中山大学附属第六医院胃肠病学研究所
出处
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期640-645,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81630072)。
文摘
目的:探讨NOP2/Sun RNA甲基转移酶家族成员2(NOP2/Sun RNA methyltransferase 2,NSUN2)在肝癌发展中的功能和机制。方法:比较肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)肝癌数据集中肝癌组织与正常组织NSUN2的mRNA表达水平;Western blot检测9对肝癌患者肝癌组织与癌旁组织中NSUN2的蛋白表达水平;Kaplan-Meier法分析肝癌TCGA数据集中NSUN2对肝癌生存预后的影响;活细胞动态成像与分析系统记录经shNSUN2慢病毒感染的Huh7和SNU182细胞的实时生长情况及集落形成实验检测细胞增殖能力;基因富集分析(GSEA)肝癌TCGA数据库中高表达NSUN2组富集的信号通路,探索NSUN2可能甲基化的关键基因和参与的信号通路;Pearson法分析TCGA数据集中NSUN2与预测基因的相关性;在SNU182细胞中敲低NSUN2后,用RT-qPCR和Western blot验证预测基因表达的变化。结果:TCGA数据集分析结果及Western blot实验结果显示NSUN2在肝癌组织中高表达。敲低NSUN2后Huh7细胞和SNU182细胞的增殖能力降低。基因富集分析结果显示嘌呤和嘧啶代谢通路在高表达NSUN2组富集。重亚硫酸盐甲基化测序(Bisulfite-Seq)结果与基因富集分析结果存在共同变化基因有PRPS2、ADSL、POLR2D、CANT1、ENTPD4、TXNRD1和CAD。Pearson相关分析结果显示TCGA数据集中NSUN2与PRPS2的mRNA表达呈正相关(r=0.3283,P<0.05)。RT-qPCR和Western blot结果验证了敲低NSUN2后抑制了SNU182细胞中PRPS2的mRNA和蛋白表达。RT-qPCR结果显示敲低NSUN2后嘌呤从头合成相关基因的表达降低。结论:NSUN2可能通过调控PRPS2的表达参与核苷酸代谢,从而影响肝癌细胞增殖。
关键词
NSUN2
肝癌
细胞增殖
PRPS2
核苷酸代谢
Keywords
NSUN2
Liver cancer
Proliferation
PRPS2
Nucleotide metabolism
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
R730.23 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
运用蛋白质组学技术研究结肠黏膜、腺瘤及腺癌组织蛋白的差异表达
崔冀
汪建平
蔡世荣
彭俊生
黄奕华
何裕隆
骆衍新
胡坤华
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
NSUN2通过靶基因PRPS2调控核苷酸代谢从而介导肝癌细胞的增殖
黄奕芝
杨紫青
温炜杰
唐勤
方乐堃
李孟鸿
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
7
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