【目的】分析地区聚集性感染事件中HCV感染者的HCV基因型分布及进化特点,推断其传播途径。【方法】研究组192个样本,126人来自响水街的一个小区域(以ZJBL命名),均有在响水街某诊所接受医疗护理的病史,66个样本取自紫金县周边地区(以ZJ命...【目的】分析地区聚集性感染事件中HCV感染者的HCV基因型分布及进化特点,推断其传播途径。【方法】研究组192个样本,126人来自响水街的一个小区域(以ZJBL命名),均有在响水街某诊所接受医疗护理的病史,66个样本取自紫金县周边地区(以ZJ命名)。采用多片段巢式PCR法,检测研究组HCV感染者的HCV基因型;应用病例对照研究方法比较其他地区同基因型HCV感染者的分布特点,推断HCV的可能感染途径。【结果】192例患者中,66例为基因亚型2a,119例为基因亚型6a,未发现其他的基因亚型。2a型感染者HCV-RNA病毒定量(lg ncopy/m L)低于HCV-6a型感染者,差异具有统计学意义(5.45±1.15 vs 5.98±1.37,P<0.05)。系统进化分析显示,与对照组比较,研究组序列形成密切的集群,表明它们可能来自共同的感染源。【结论】紫金县HCV聚集性感染事件中HCV主要基因型为2a和6a,符合医源性传播特点,随着时间的延长积累了众多病例导致"暴发"。展开更多
目的:鉴定人肝母细胞瘤HepG2细胞中响应DNA损伤的转运RNA衍生的小RNA(transfer RNAderived small RNA,tsRNA)的表达特征,并研究其潜在功能。方法:本研究基于配对的HepG2细胞和敲除TP53基因的HepG2细胞,采用阿霉素(adriamycin,ADR)成功构...目的:鉴定人肝母细胞瘤HepG2细胞中响应DNA损伤的转运RNA衍生的小RNA(transfer RNAderived small RNA,tsRNA)的表达特征,并研究其潜在功能。方法:本研究基于配对的HepG2细胞和敲除TP53基因的HepG2细胞,采用阿霉素(adriamycin,ADR)成功构建DNA损伤的细胞模型,并进行小非编码RNA的转录组分析,系统地鉴定一批响应ADR并参与p53调节的tsRNA,利用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行了功能富集分析。此外,经沉默目标tsRNA基因表达后,通过CCK-8实验和平板集落形成实验初步证实了目标tsRNA在HepG2细胞模型中的生物学功能。结果:DNA损伤可诱导一批参与p53调节的tsRNA,其中tRF-5-1(tRF-5_tRNA-Gly-TCC-2-1)和tRF-i-1(tRF i_tRNA-Tyr-GTA-11-1)在HepG2细胞中的表达上调最为显著(P<0.05)。沉默tRF-5-1或tRF-i-1基因可抑制HepG2细胞的增殖活力(P<0.05)。结论:HepG2细胞模型中可以鉴定一组响应DNA损伤的tsRNA,且tsRNA可以促进HepG2细胞的增殖活力,提示tsRNA在肝脏细胞的恶性增殖中可能扮演重要角色。展开更多
文摘【目的】分析地区聚集性感染事件中HCV感染者的HCV基因型分布及进化特点,推断其传播途径。【方法】研究组192个样本,126人来自响水街的一个小区域(以ZJBL命名),均有在响水街某诊所接受医疗护理的病史,66个样本取自紫金县周边地区(以ZJ命名)。采用多片段巢式PCR法,检测研究组HCV感染者的HCV基因型;应用病例对照研究方法比较其他地区同基因型HCV感染者的分布特点,推断HCV的可能感染途径。【结果】192例患者中,66例为基因亚型2a,119例为基因亚型6a,未发现其他的基因亚型。2a型感染者HCV-RNA病毒定量(lg ncopy/m L)低于HCV-6a型感染者,差异具有统计学意义(5.45±1.15 vs 5.98±1.37,P<0.05)。系统进化分析显示,与对照组比较,研究组序列形成密切的集群,表明它们可能来自共同的感染源。【结论】紫金县HCV聚集性感染事件中HCV主要基因型为2a和6a,符合医源性传播特点,随着时间的延长积累了众多病例导致"暴发"。
文摘目的:鉴定人肝母细胞瘤HepG2细胞中响应DNA损伤的转运RNA衍生的小RNA(transfer RNAderived small RNA,tsRNA)的表达特征,并研究其潜在功能。方法:本研究基于配对的HepG2细胞和敲除TP53基因的HepG2细胞,采用阿霉素(adriamycin,ADR)成功构建DNA损伤的细胞模型,并进行小非编码RNA的转录组分析,系统地鉴定一批响应ADR并参与p53调节的tsRNA,利用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行了功能富集分析。此外,经沉默目标tsRNA基因表达后,通过CCK-8实验和平板集落形成实验初步证实了目标tsRNA在HepG2细胞模型中的生物学功能。结果:DNA损伤可诱导一批参与p53调节的tsRNA,其中tRF-5-1(tRF-5_tRNA-Gly-TCC-2-1)和tRF-i-1(tRF i_tRNA-Tyr-GTA-11-1)在HepG2细胞中的表达上调最为显著(P<0.05)。沉默tRF-5-1或tRF-i-1基因可抑制HepG2细胞的增殖活力(P<0.05)。结论:HepG2细胞模型中可以鉴定一组响应DNA损伤的tsRNA,且tsRNA可以促进HepG2细胞的增殖活力,提示tsRNA在肝脏细胞的恶性增殖中可能扮演重要角色。
