目的:鉴定人肝母细胞瘤HepG2细胞中响应DNA损伤的转运RNA衍生的小RNA(transfer RNAderived small RNA,tsRNA)的表达特征,并研究其潜在功能。方法:本研究基于配对的HepG2细胞和敲除TP53基因的HepG2细胞,采用阿霉素(adriamycin,ADR)成功构...目的:鉴定人肝母细胞瘤HepG2细胞中响应DNA损伤的转运RNA衍生的小RNA(transfer RNAderived small RNA,tsRNA)的表达特征,并研究其潜在功能。方法:本研究基于配对的HepG2细胞和敲除TP53基因的HepG2细胞,采用阿霉素(adriamycin,ADR)成功构建DNA损伤的细胞模型,并进行小非编码RNA的转录组分析,系统地鉴定一批响应ADR并参与p53调节的tsRNA,利用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行了功能富集分析。此外,经沉默目标tsRNA基因表达后,通过CCK-8实验和平板集落形成实验初步证实了目标tsRNA在HepG2细胞模型中的生物学功能。结果:DNA损伤可诱导一批参与p53调节的tsRNA,其中tRF-5-1(tRF-5_tRNA-Gly-TCC-2-1)和tRF-i-1(tRF i_tRNA-Tyr-GTA-11-1)在HepG2细胞中的表达上调最为显著(P<0.05)。沉默tRF-5-1或tRF-i-1基因可抑制HepG2细胞的增殖活力(P<0.05)。结论:HepG2细胞模型中可以鉴定一组响应DNA损伤的tsRNA,且tsRNA可以促进HepG2细胞的增殖活力,提示tsRNA在肝脏细胞的恶性增殖中可能扮演重要角色。展开更多
文摘目的:鉴定人肝母细胞瘤HepG2细胞中响应DNA损伤的转运RNA衍生的小RNA(transfer RNAderived small RNA,tsRNA)的表达特征,并研究其潜在功能。方法:本研究基于配对的HepG2细胞和敲除TP53基因的HepG2细胞,采用阿霉素(adriamycin,ADR)成功构建DNA损伤的细胞模型,并进行小非编码RNA的转录组分析,系统地鉴定一批响应ADR并参与p53调节的tsRNA,利用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行了功能富集分析。此外,经沉默目标tsRNA基因表达后,通过CCK-8实验和平板集落形成实验初步证实了目标tsRNA在HepG2细胞模型中的生物学功能。结果:DNA损伤可诱导一批参与p53调节的tsRNA,其中tRF-5-1(tRF-5_tRNA-Gly-TCC-2-1)和tRF-i-1(tRF i_tRNA-Tyr-GTA-11-1)在HepG2细胞中的表达上调最为显著(P<0.05)。沉默tRF-5-1或tRF-i-1基因可抑制HepG2细胞的增殖活力(P<0.05)。结论:HepG2细胞模型中可以鉴定一组响应DNA损伤的tsRNA,且tsRNA可以促进HepG2细胞的增殖活力,提示tsRNA在肝脏细胞的恶性增殖中可能扮演重要角色。
