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珍稀植物海南草海桐基于ITS序列分析的系统位置研究
被引量：
4
1
作者
粟米
何思宁
+3 位作者
李炜曦
王舒
谈凤笑
黄椰林
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期16-23,共8页
通过测定来自国内5个分布地点的海南草海桐Scaevola hainanensis Hance群体核核糖体基因间隔区序列(nuclear ribosomal internal transcribed spacer region,ITS),一方面评估海南草海桐的遗传多样性大小,另一方面,结合Gen Bank中已有的...
通过测定来自国内5个分布地点的海南草海桐Scaevola hainanensis Hance群体核核糖体基因间隔区序列(nuclear ribosomal internal transcribed spacer region,ITS),一方面评估海南草海桐的遗传多样性大小,另一方面,结合Gen Bank中已有的草海桐属物种ITS序列来共同进行分子系统发育分析,旨在确定海南草海桐在草海桐属中的系统位置。研究结果表明海南草海桐遗传多样性水平极低,作为一种珍稀植物在分子水平上同样面临灭绝的风险。而分子聚类结果发现海南草海桐位于Scaevola组里的北半球谱系,并与夏威夷本地物种的亲缘关系最近,两地草海桐属物种之间可能存在祖先—后代(progenitor-derivative)的扩散模式。研究结果同时否定了Scaevola组的单系性以及海南草海桐由同域广布种草海桐演化而来的假说。
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关键词
海南草海桐Scaevola
hainanensis
Hance
ITS
系统发育分析
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职称材料
利用trnL-trnF探讨文定果属的系统地位及其与若干近缘科属的系统发育关系
被引量：
5
2
作者
赖燕玲
王晓明
+3 位作者
陈国培
王春波
苏应娟
廖文波
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期98-107,共10页
运用克隆测序的方法测定了椴树科Tiliaceae、梧桐科Sterculiaceae、杜英科Elaeocarpaceae和大风子科Flacourtiaceae 21种以及外类群蔷薇科4种植物的叶绿体trnL-trnF序列,并结合GenBank中已公布的3科44个代表种的trnL-trnF序列进行系统...
运用克隆测序的方法测定了椴树科Tiliaceae、梧桐科Sterculiaceae、杜英科Elaeocarpaceae和大风子科Flacourtiaceae 21种以及外类群蔷薇科4种植物的叶绿体trnL-trnF序列,并结合GenBank中已公布的3科44个代表种的trnL-trnF序列进行系统发育分析。采用最简约法、最大似然法和Bayesian推测分析椴树科、梧桐科和杜英科科间和属内的系统发育关系。结果显示:①文定果属Muntingia构成一个独立于梧桐科和椴树科的分支,具有较高bootstrap的支持率和后验概率,表明建立文定果科Muntingiaceae具有合理性;②滇桐属Craigia与梧桐科翅子树属Pterospermum、肖槿属Thespesia、苹婆属Sterculia、可乐果属Cola、梧桐属Firmiana和银叶树属Heritiera的关系密切。支持将滇桐属归于梧桐科的观点;③杜英属Elaeocarpus和猴欢喜属Sloanea均为杜英科的主要成员,应归于杜英科;④椴树科、梧桐科和杜英科有较近的亲缘关系。特别是,椴树科和梧桐科的关系非常密切,两科并没有构成两个独立的单系群,而是形成复系群。
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关键词
文定果属Muntingia
克隆测序
trnL-trnF序列
系统发育
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职称材料
题名
珍稀植物海南草海桐基于ITS序列分析的系统位置研究
被引量：
4
1
作者
粟米
何思宁
李炜曦
王舒
谈凤笑
黄椰林
机构
中山大学生命科学学院∥广东省植物资源重点实验室
华南农业
大学
资源
环境
学院
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期16-23,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(41276107
31200466
J1310025)
文摘
通过测定来自国内5个分布地点的海南草海桐Scaevola hainanensis Hance群体核核糖体基因间隔区序列(nuclear ribosomal internal transcribed spacer region,ITS),一方面评估海南草海桐的遗传多样性大小,另一方面,结合Gen Bank中已有的草海桐属物种ITS序列来共同进行分子系统发育分析,旨在确定海南草海桐在草海桐属中的系统位置。研究结果表明海南草海桐遗传多样性水平极低,作为一种珍稀植物在分子水平上同样面临灭绝的风险。而分子聚类结果发现海南草海桐位于Scaevola组里的北半球谱系,并与夏威夷本地物种的亲缘关系最近,两地草海桐属物种之间可能存在祖先—后代(progenitor-derivative)的扩散模式。研究结果同时否定了Scaevola组的单系性以及海南草海桐由同域广布种草海桐演化而来的假说。
关键词
海南草海桐Scaevola
hainanensis
Hance
ITS
系统发育分析
Keywords
Scaevola hainanesis Hance
ITS
phylogenetic analysis
分类号
Q949.783 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
利用trnL-trnF探讨文定果属的系统地位及其与若干近缘科属的系统发育关系
被引量：
5
2
作者
赖燕玲
王晓明
陈国培
王春波
苏应娟
廖文波
机构
深圳市公园管理中心
深圳市仙湖
植物
园
中山大学生命科学学院∥广东省植物资源重点实验室
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期98-107,共10页
基金
国家自然科学基金资助项目(31170202)
深圳市城市管理局科研基金资助项目(2008-2011)
文摘
运用克隆测序的方法测定了椴树科Tiliaceae、梧桐科Sterculiaceae、杜英科Elaeocarpaceae和大风子科Flacourtiaceae 21种以及外类群蔷薇科4种植物的叶绿体trnL-trnF序列,并结合GenBank中已公布的3科44个代表种的trnL-trnF序列进行系统发育分析。采用最简约法、最大似然法和Bayesian推测分析椴树科、梧桐科和杜英科科间和属内的系统发育关系。结果显示:①文定果属Muntingia构成一个独立于梧桐科和椴树科的分支,具有较高bootstrap的支持率和后验概率,表明建立文定果科Muntingiaceae具有合理性;②滇桐属Craigia与梧桐科翅子树属Pterospermum、肖槿属Thespesia、苹婆属Sterculia、可乐果属Cola、梧桐属Firmiana和银叶树属Heritiera的关系密切。支持将滇桐属归于梧桐科的观点;③杜英属Elaeocarpus和猴欢喜属Sloanea均为杜英科的主要成员,应归于杜英科;④椴树科、梧桐科和杜英科有较近的亲缘关系。特别是,椴树科和梧桐科的关系非常密切,两科并没有构成两个独立的单系群,而是形成复系群。
关键词
文定果属Muntingia
克隆测序
trnL-trnF序列
系统发育
Keywords
Muntingia； sequencing cloned； trnL-trnF sequences； systematic phylogenetic
分类号
Q949.72 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
珍稀植物海南草海桐基于ITS序列分析的系统位置研究
粟米
何思宁
李炜曦
王舒
谈凤笑
黄椰林
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
利用trnL-trnF探讨文定果属的系统地位及其与若干近缘科属的系统发育关系
赖燕玲
王晓明
陈国培
王春波
苏应娟
廖文波
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012
5
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