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感染草鱼呼肠孤病毒对肠道菌群多样性的影响
被引量:
19
1
作者
朱文根
李星浩
+4 位作者
饶刘瑜
黄洁
余育和
肖凡书
颜庆云
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期109-116,共8页
为揭示草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus, GCRV)对草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道菌群的影响,在通过人工浸泡方式感染GCRV后,采用针对16S rRNA基因的高通量测序技术对草鱼肠道菌群的组成和多样性进行了研究。结果显示,感染组与...
为揭示草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus, GCRV)对草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道菌群的影响,在通过人工浸泡方式感染GCRV后,采用针对16S rRNA基因的高通量测序技术对草鱼肠道菌群的组成和多样性进行了研究。结果显示,感染组与对照组差异显著(MRPP, Anosim, Adonis, P<0.01),且感染组肠道菌群的Alpha多样性指数(Shannon-Wienner、Inverse Simpson、Pielou evenness)显著低于对照组(t-test, P<0.05)。此外,肠道菌群在感染组个体间差异显著大于对照组(Wilcoxon test, P<0.05),表明患病草鱼肠道菌群失去原有平衡而变得紊乱。尽管病毒感染组和对照组草鱼肠道优势菌门均为Proteobacteria、Firmicutes、Bacteroidetes、Fusobacteria,但在OTU水平仍表现出明显的变化,如OTU_69(Pasteurellaceae)、OTU_504(Comamonadaceae)和OTU_1898(Cetobacterium)在感染GCRV组丰度显著降低(t-test, P<0.05),也表明GCRV感染可使草鱼肠道微生态发生紊乱。肠道菌群结构稳定对于宿主健康具有重要意义,研究患病鱼肠道菌群状况为鱼类常见疾病的防控提供科学依据,也为健康养殖提供参考。
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关键词
草鱼呼肠孤病毒
肠道菌群
16SRRNA基因
高通量测序
草鱼
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职称材料
题名
感染草鱼呼肠孤病毒对肠道菌群多样性的影响
被引量:
19
1
作者
朱文根
李星浩
饶刘瑜
黄洁
余育和
肖凡书
颜庆云
机构
中国
科学
院水生
生物
研究
所中国
科学
院水生
生物
多样性与保护重点实验室
中国
科学
院
大学
中山大学环境科学与工程学院环境微生物组学研究中心
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期109-116,共8页
基金
国家自然科学基金(31672262和31400109)资助~~
文摘
为揭示草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus, GCRV)对草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道菌群的影响,在通过人工浸泡方式感染GCRV后,采用针对16S rRNA基因的高通量测序技术对草鱼肠道菌群的组成和多样性进行了研究。结果显示,感染组与对照组差异显著(MRPP, Anosim, Adonis, P<0.01),且感染组肠道菌群的Alpha多样性指数(Shannon-Wienner、Inverse Simpson、Pielou evenness)显著低于对照组(t-test, P<0.05)。此外,肠道菌群在感染组个体间差异显著大于对照组(Wilcoxon test, P<0.05),表明患病草鱼肠道菌群失去原有平衡而变得紊乱。尽管病毒感染组和对照组草鱼肠道优势菌门均为Proteobacteria、Firmicutes、Bacteroidetes、Fusobacteria,但在OTU水平仍表现出明显的变化,如OTU_69(Pasteurellaceae)、OTU_504(Comamonadaceae)和OTU_1898(Cetobacterium)在感染GCRV组丰度显著降低(t-test, P<0.05),也表明GCRV感染可使草鱼肠道微生态发生紊乱。肠道菌群结构稳定对于宿主健康具有重要意义,研究患病鱼肠道菌群状况为鱼类常见疾病的防控提供科学依据,也为健康养殖提供参考。
关键词
草鱼呼肠孤病毒
肠道菌群
16SRRNA基因
高通量测序
草鱼
Keywords
Grass carp reovirus
Intestinal microbiota
16S rRNA gene
High-throughput sequencing
Grass carp
分类号
S941 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
感染草鱼呼肠孤病毒对肠道菌群多样性的影响
朱文根
李星浩
饶刘瑜
黄洁
余育和
肖凡书
颜庆云
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
19
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