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不同生活习性下原核生物基因组大小与GC含量的关系研究
被引量：
2
1
作者
林瀚
黄亚志
张尚宏
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期90-93,共4页
对原核生物基因组的研究显示,基因组GC含量与基因组大小和氧气偏好性等因素存在着一定的相关性。为了探索基因组大小与GC含量的相关性是否受原核生物生活习性的影响,选取了有代表性的411种原核生物(包括古细菌与真细菌),分别从最适生长...
对原核生物基因组的研究显示,基因组GC含量与基因组大小和氧气偏好性等因素存在着一定的相关性。为了探索基因组大小与GC含量的相关性是否受原核生物生活习性的影响,选取了有代表性的411种原核生物(包括古细菌与真细菌),分别从最适生长温度、氧气偏好性、运动特性、水生特性和寄生特性等因素进行分析,发现基因组大小与GC含量的相关性确实受这些因素的影响,而寄生原核生物中显示出最好的相关性。
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关键词
原核生物
基因组大小
GC含量
生活习性
相关/回归分析
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职称材料
基因组寡聚核苷酸频率组分差异的进化信息
被引量：
1
2
作者
熊远妍
王军鹏
+2 位作者
蓝一杰
文明
张尚宏
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期84-88,共5页
利用不同基因组全序列中寡聚核苷酸频率组分差异信息构建系统树,并与传统方法的建树结果比较,分析以寡聚核苷酸频率组分差异信息构建系统树的可行性及适用范围。在获得194种原核生物基因组全序列寡聚核苷酸频率数据的基础上,依据寡聚核...
利用不同基因组全序列中寡聚核苷酸频率组分差异信息构建系统树,并与传统方法的建树结果比较,分析以寡聚核苷酸频率组分差异信息构建系统树的可行性及适用范围。在获得194种原核生物基因组全序列寡聚核苷酸频率数据的基础上,依据寡聚核苷酸组分的保守性构建权重矩阵,对寡聚核苷酸组分差异加权,并尝试用绝对值距离、Lance距离、欧氏距离三种方法计算距离矩阵,再用距离法构建系统树。结果显示,该方法对科以下分类单位的建树与传统方法的建树基本一致,而对科以上的分类单位较难区分。首次利用寡聚核苷酸频率保守性进行加权,通过非比对的算法用基因组全序列建树。
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关键词
基因组全序列
寡聚核苷酸
频率
系统树
信息分析
数据发掘
生物信息学
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职称材料
粗糙脉孢霉arg-13 cDNA能互补酿酒酵母arg11突变株
3
作者
刘秋云
罗樨
+2 位作者
蒋一帆
何康泽
李宝健
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第6期55-58,共4页
以粗糙脉孢霉Neurosporacrassaarg_13基因作为探针筛选λgt10cDNA文库 ,获得全长arg_13cDNA并能表型拯救arg_13突变株 .进行了arg_13cDNA测序 .为了进一步证实arg_13的功能 .构建了GAL1诱导表达的arg_13cDNA的载体 .该载体能表型互补酿...
以粗糙脉孢霉Neurosporacrassaarg_13基因作为探针筛选λgt10cDNA文库 ,获得全长arg_13cDNA并能表型拯救arg_13突变株 .进行了arg_13cDNA测序 .为了进一步证实arg_13的功能 .构建了GAL1诱导表达的arg_13cDNA的载体 .该载体能表型互补酿酒酵母Saccharomycescerevisiaearg11突变株 .证实arg_13编码线粒体内膜鸟氨酸转运酶 .
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关键词
arg-13
arg11
线粒体内膜鸟氨酸转运酶
表型互补
粗糙脉孢霉
酿酒酵母
CDNA文库
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职称材料
题名
不同生活习性下原核生物基因组大小与GC含量的关系研究
被引量：
2
1
作者
林瀚
黄亚志
张尚宏
机构
中山大学基因工程教育部重点实验室∥生物工程研究中心
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期90-93,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(30270752)
广东省自然科学基金资助项目(031616)
+1 种基金
国家973计划资助项目(2005CB724600)
国家人才基金(基地)项目(J0730638)
文摘
对原核生物基因组的研究显示,基因组GC含量与基因组大小和氧气偏好性等因素存在着一定的相关性。为了探索基因组大小与GC含量的相关性是否受原核生物生活习性的影响,选取了有代表性的411种原核生物(包括古细菌与真细菌),分别从最适生长温度、氧气偏好性、运动特性、水生特性和寄生特性等因素进行分析,发现基因组大小与GC含量的相关性确实受这些因素的影响,而寄生原核生物中显示出最好的相关性。
关键词
原核生物
基因组大小
GC含量
生活习性
相关/回归分析
Keywords
prokaryote
genome size
GC contents
lifestyle
correlation/regression analysis
分类号
Q754 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
基因组寡聚核苷酸频率组分差异的进化信息
被引量：
1
2
作者
熊远妍
王军鹏
蓝一杰
文明
张尚宏
机构
中山大学基因工程教育部重点实验室∥生物工程研究中心
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期84-88,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(30270752)
广东省自然科学基金资助项目(031616)
国家973计划资助项目(2005CB724600)
文摘
利用不同基因组全序列中寡聚核苷酸频率组分差异信息构建系统树,并与传统方法的建树结果比较,分析以寡聚核苷酸频率组分差异信息构建系统树的可行性及适用范围。在获得194种原核生物基因组全序列寡聚核苷酸频率数据的基础上,依据寡聚核苷酸组分的保守性构建权重矩阵,对寡聚核苷酸组分差异加权,并尝试用绝对值距离、Lance距离、欧氏距离三种方法计算距离矩阵,再用距离法构建系统树。结果显示,该方法对科以下分类单位的建树与传统方法的建树基本一致,而对科以上的分类单位较难区分。首次利用寡聚核苷酸频率保守性进行加权,通过非比对的算法用基因组全序列建树。
关键词
基因组全序列
寡聚核苷酸
频率
系统树
信息分析
数据发掘
生物信息学
Keywords
whole-genome sequence
oligonucleotides
frequency
phylogenetic tree
information analysis
data mining
bioinformatics
分类号
Q754 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
粗糙脉孢霉arg-13 cDNA能互补酿酒酵母arg11突变株
3
作者
刘秋云
罗樨
蒋一帆
何康泽
李宝健
机构
中山大学基因工程教育部重点实验室∥生物工程研究中心
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第6期55-58,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目 (30 0 70 42 0 )
教育部高等学校骨干教师计划资助项目 (2 0 0 0 - 0 6 1-31430 1)
广东省自然科学基金资助项目 (980 30 3)
文摘
以粗糙脉孢霉Neurosporacrassaarg_13基因作为探针筛选λgt10cDNA文库 ,获得全长arg_13cDNA并能表型拯救arg_13突变株 .进行了arg_13cDNA测序 .为了进一步证实arg_13的功能 .构建了GAL1诱导表达的arg_13cDNA的载体 .该载体能表型互补酿酒酵母Saccharomycescerevisiaearg11突变株 .证实arg_13编码线粒体内膜鸟氨酸转运酶 .
关键词
arg-13
arg11
线粒体内膜鸟氨酸转运酶
表型互补
粗糙脉孢霉
酿酒酵母
CDNA文库
Keywords
arg-13
arg11
mitochondrial ornithine carrier
cDNA
phenotypic complementation
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q949.32 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同生活习性下原核生物基因组大小与GC含量的关系研究
林瀚
黄亚志
张尚宏
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2011
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基因组寡聚核苷酸频率组分差异的进化信息
熊远妍
王军鹏
蓝一杰
文明
张尚宏
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
粗糙脉孢霉arg-13 cDNA能互补酿酒酵母arg11突变株
刘秋云
罗樨
蒋一帆
何康泽
李宝健
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2001
0
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职称材料
已选择
0
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