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题名IMP型金属β-内酰胺酶活性中心的计算机模拟分析
被引量：1
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作者
许岩
余江河
郑珩
劳兴珍
吕品一
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机构
中国药科大学药物生物信息学教研室
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出处
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第9期543-547,共5页
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文摘
应用信息论方法和计算机模拟的方法,对IMP型β-内酰胺酶序列及活性中心进行分析,结果表明在配体结合部位的大部分残基是高度保守的,但也有部分残基易发生变异,如32位Pro、31位Val和163位Try,这些变异是引起该酶不同变异型对β-内酰胺类抗生素水解能力不同的重要原因,在设计抑制剂时需考虑在酶高变区附近分子的柔性,以防出现新突变型而对所设计抑制剂产生抗性。将酶和底物亚胺培南及青霉素G对接结果表明,底物与酶的结合自由能与酶的催化活性间有很好的相关性,可作为评估底物或酶抑制剂结合能力的重要评价指标。对接模型更细致地显示了酶中与底物相互作用的氨基酸残基,为酶抑制剂的合理设计奠定了基础。
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关键词
IMP
金属Β-内酰胺酶
香农熵
同源模建
分子对接
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Keywords
IMP
Metallo-β-lactamase
Shannon entropy
Homologous modeling
Molecule docking
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分类号
R978.11
[医药卫生—药品]
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