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蛋白质天然构象预测的研究进展
被引量:
4
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作者
方慧生
吴梧桐
+2 位作者
王旻
余江河
郑珩
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期195-200,共6页
继人类基因组计划完成后,如何弄清相应的基因序列的功能及其之间的关系,即比较彻底地解开生命的奥秘成为后基因组计划的主要任务。基因的功能最终主要通过蛋白质来完成,因此,如何根据已知的氨基酸序列来预测相应的蛋白质天然构象成为后...
继人类基因组计划完成后,如何弄清相应的基因序列的功能及其之间的关系,即比较彻底地解开生命的奥秘成为后基因组计划的主要任务。基因的功能最终主要通过蛋白质来完成,因此,如何根据已知的氨基酸序列来预测相应的蛋白质天然构象成为后基因组计划中最重要的组成部分之一,这为比较彻底界定其功能奠定分子生物学基础。本文从以下几个方面进行了详细地介绍:(1)组成蛋白质天然构象预测方法的基本元素即序列比对方法、构象空间搜索方法及有关的蛋白质数据库;(2)结构预测方法的评估与分类;(3)描述预测性能较好及有比较发展前景的预测方法;(4)天然构象预测的前景等。
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关键词
蛋白质天然构象预测
CASP
从头预测
折叠识别法
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职称材料
基于常用得分矩阵的神经网络法预测蛋白质的二级结构
被引量:
3
2
作者
徐建平
方慧生
相秉仁
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期470-473,共4页
本文用常用的得分矩阵代替传统的Qian编码作为神经网络的输入层预测了200个蛋白质二级结构。结果表明:以常用得分矩阵作为输入层的预测结果要优于Qian编码的预测性能。在200个蛋白质中,共有9个蛋白质的预测精度达到目前国际先进水平,即...
本文用常用的得分矩阵代替传统的Qian编码作为神经网络的输入层预测了200个蛋白质二级结构。结果表明:以常用得分矩阵作为输入层的预测结果要优于Qian编码的预测性能。在200个蛋白质中,共有9个蛋白质的预测精度达到目前国际先进水平,即80%。这说明该方法具有一定的可行性。
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关键词
神经网络
得分矩阵
蛋白质二级结构预测
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职称材料
题名
蛋白质天然构象预测的研究进展
被引量:
4
1
作者
方慧生
吴梧桐
王旻
余江河
郑珩
机构
中国药科大学生命科学与技术学院生物信息学教研室
出处
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期195-200,共6页
文摘
继人类基因组计划完成后,如何弄清相应的基因序列的功能及其之间的关系,即比较彻底地解开生命的奥秘成为后基因组计划的主要任务。基因的功能最终主要通过蛋白质来完成,因此,如何根据已知的氨基酸序列来预测相应的蛋白质天然构象成为后基因组计划中最重要的组成部分之一,这为比较彻底界定其功能奠定分子生物学基础。本文从以下几个方面进行了详细地介绍:(1)组成蛋白质天然构象预测方法的基本元素即序列比对方法、构象空间搜索方法及有关的蛋白质数据库;(2)结构预测方法的评估与分类;(3)描述预测性能较好及有比较发展前景的预测方法;(4)天然构象预测的前景等。
关键词
蛋白质天然构象预测
CASP
从头预测
折叠识别法
Keywords
Prediction of the native state of protein
CASP
Ab initio prediction
Folding recognition
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
基于常用得分矩阵的神经网络法预测蛋白质的二级结构
被引量:
3
2
作者
徐建平
方慧生
相秉仁
机构
中
国药
科
大学
分析测试
中
心
中国药科大学生命科学与技术学院生物信息学教研室
出处
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期470-473,共4页
文摘
本文用常用的得分矩阵代替传统的Qian编码作为神经网络的输入层预测了200个蛋白质二级结构。结果表明:以常用得分矩阵作为输入层的预测结果要优于Qian编码的预测性能。在200个蛋白质中,共有9个蛋白质的预测精度达到目前国际先进水平,即80%。这说明该方法具有一定的可行性。
关键词
神经网络
得分矩阵
蛋白质二级结构预测
Keywords
artificial neural network
score matrix
prediction of protein second structure
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
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1
蛋白质天然构象预测的研究进展
方慧生
吴梧桐
王旻
余江河
郑珩
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
4
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职称材料
2
基于常用得分矩阵的神经网络法预测蛋白质的二级结构
徐建平
方慧生
相秉仁
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
3
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职称材料
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参考文献
引证文献
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