-
题名DNA水平上检测正选择方法的研究进展
被引量：7
- 1
-
-
作者
林栲
李海鹏
-
机构
中国科学院-德国马普学会计算生物学伙伴研究所
-
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第9期896-902,共7页
-
基金
浦江人才计划项目(编号:08PJ4104)
中科院百人计划项目资助
-
文摘
达尔文的自然选择学说指出,自然选择作用是物种进化的主要因素。而1968年Kimura提出的中性进化学说认为中性突变和随机漂变才是进化的主要动力。在接下来的30多年时间中,人们尝试从各种角度来检测自然选择是否存在。随着DNA测序技术的发展,大量的DNA序列信息为检验自然选择提供了丰富的数据。因为自然选择会影响DNA变异模式,所以可以通过分析现有的DNA样本来推断过去是否发生了自然选择。另一方面,种群历史等因素也会影响到DNA变异模式,因此会对自然选择的检测产生干扰。文章主要介绍了中性检验基本的概念,全面回顾了一些经典的检验方法,并着重介绍了近几年新发展出的研究方向。
-
关键词
DNA水平
自然选择
中性检验
-
Keywords
DNA level
natural selection
neutrality test
-
分类号
Q75
[生物学—分子生物学]
-
-
题名基于分水岭算法的MELK图像分割
被引量：5
- 2
-
-
作者
蔡念
唐孝艳
许少睿
李防震
-
机构
广东工业大学信息工程学院
中国科学院-德国马普学会计算生物学伙伴研究所
山东经济学院计算机科学与技术系
-
出处
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2009年第8期3175-3176,3191,共3页
-
基金
国家自然科学基金资助项目(30600121)
广东省自然科学基金资助项目(07301038)
-
文摘
提出一种基于分水岭算法的MELK图像分割方法,以解决信息量较小的MELK图像分割问题。综合应用多种技术以避免分水岭算法的过分割问题。首先应用高斯低通滤波器对MELK图像进行增强;采用加权差分算子求取梯度图像;应用Ostu方法进行对梯度阈值化,并进行分水岭变换;最后,应用RAG区域合并方法完成MELK图像分割。实验结果表明,该分割方法能够有效地分割信息量较小的MELK图像。
-
关键词
拓扑蛋白质组学
图像分割
分水岭算法
多抗原配体图谱图像
-
Keywords
topological proteomics
image segmentation
watershed algorithm
MELK image
-
分类号
TP391.4
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
-
-
题名群体遗传学模拟软件应用现状
被引量：4
- 3
-
-
作者
高峰
李海鹏
-
机构
中国科学院计算生物学重点实验室
中国科学院大学
-
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期707-717,共11页
-
基金
中国科学院先导B项目(编号:XDB13040800)
国家自然科学基金项目(编号:91531306)资助~~
-
文摘
随着下一代测序技术的不断进步与测序价格的不断下降,越来越多物种的全基因组信息被公开。作为研究群体遗传变异模式工具之一的模拟软件必然将发挥越来越重要的作用。依据时间推演方向的不同,模拟软件可以分为依时间向前和向后推演,二者各有所长,功能上互相补充,分别适合于不同的模拟需求。这些软件在研究进化动力的影响、估计进化动力参数与验证不同进化假设以及新方法有效性等方面起着重要作用。本文简要介绍了群体遗传学相关理论知识,详细比较了近10年来发表的32款模拟软件,并对模拟软件的未来发展方向给出了建议。
-
关键词
群体遗传学
计算机模拟
依时间向前
依时间向后
-
Keywords
population genetics
computer simulation
forwards-in-time
backwards-in-time
-
分类号
TP319
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
Q347
[生物学—遗传学]
-
