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科学数据出版调查与分析 被引量:9
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作者 黎建辉 吴超 +2 位作者 张丽丽 李成赞 胡良霖 《中国科学数据(中英文网络版)》 2016年第1期64-74,共11页
现代科学活动对数据的依赖日益增强,这使得推动科学数据开放共享逐渐成为现代科学研究的必然诉求。然而科学数据共享实践仍存在诸多障碍。为了更好地协调科学数据开放共享相关利益者的权益分配、减少数据开放的阻力,科学数据出版提供了... 现代科学活动对数据的依赖日益增强,这使得推动科学数据开放共享逐渐成为现代科学研究的必然诉求。然而科学数据共享实践仍存在诸多障碍。为了更好地协调科学数据开放共享相关利益者的权益分配、减少数据开放的阻力,科学数据出版提供了一种积极的模式探索。立足现代科研活动背景,本文面向在ESSD、ESA、GBIF、DRYAD、PANGAEN等机构发表数据论文的上千名作者展开数据出版调查。本调查于2014年8月至12月进行,重点围绕数据出版动力、数据出版方式、数据出版运营模式以及数据出版质量评价展开。调查结果显示,数据出版作为推动科学数据共享的途径之一,已获得较广泛共识。当前数据出版发展初具规模并进入快速上升期。与传统出版相比,数据出版在树立学术地位和行业认可度等方面还有待提升。运营模式尚不成熟,数据权益保护、运营机制等仍是数据共享的关注焦点。数据引用评价源于传统学术体系又有所不同,亟待建立一套高效合理的质量控制与评价激励机制。 展开更多
关键词 科学数据 科学数据出版 数据共享 调查统计
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大数据可视分析综述 被引量:425
2
作者 任磊 杜一 +2 位作者 马帅 张小龙 戴国忠 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2014年第9期1909-1936,共28页
可视分析是大数据分析的重要方法.大数据可视分析旨在利用计算机自动化分析能力的同时,充分挖掘人对于可视化信息的认知能力优势,将人、机的各自强项进行有机融合,借助人机交互式分析方法和交互技术,辅助人们更为直观和高效地洞悉大数... 可视分析是大数据分析的重要方法.大数据可视分析旨在利用计算机自动化分析能力的同时,充分挖掘人对于可视化信息的认知能力优势,将人、机的各自强项进行有机融合,借助人机交互式分析方法和交互技术,辅助人们更为直观和高效地洞悉大数据背后的信息、知识与智慧.主要从可视分析领域所强调的认知、可视化、人机交互的综合视角出发,分析了支持大数据可视分析的基础理论,包括支持分析过程的认知理论、信息可视化理论、人机交互与用户界面理论.在此基础上,讨论了面向大数据主流应用的信息可视化技术——面向文本、网络(图)、时空、多维的可视化技术.同时探讨了支持可视分析的人机交互技术,包括支持可视分析过程的界面隐喻与交互组件、多尺度/多焦点/多侧面交互技术、面向Post-WIMP的自然交互技术.最后,指出了大数据可视分析领域面临的瓶颈问题与技术挑战. 展开更多
关键词 大数据 可视化 信息可视化 可视分析 人机交互 云计算
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面向信息可视化的语义Focus+Context人机交互技术 被引量:12
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作者 任磊 魏永长 +2 位作者 杜一 张小龙 戴国忠 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2015年第12期2488-2498,共11页
大数据成为继云计算和物联网之后,国际学术界和产业界所共同瞩目的又一个研究热点.信息可视化是辅助用户洞悉大数据背后隐藏的知识和规律的重要方法和有力工具.如何在图形用户界面中对大规模信息以符合认知规律的方式进行可视化,并且使... 大数据成为继云计算和物联网之后,国际学术界和产业界所共同瞩目的又一个研究热点.信息可视化是辅助用户洞悉大数据背后隐藏的知识和规律的重要方法和有力工具.如何在图形用户界面中对大规模信息以符合认知规律的方式进行可视化,并且使得计算机能够智能化的理解用户意图以配合其进行高效的人机交互,是信息可视化面临的挑战之一.文中提出一种面向信息可视化的语义Focus+Context人机交互技术.首先,在基于空间距离的经典Focus+Context数学模型基础上对其进行语义建模和扩展,建立了面向信息空间和可视化表征空间的语义距离模型以及语义关注度模型,定义了交互中的焦点对象与语义上下文.其次,在此基础上建立了语义Focus+Context用户界面模型,给出了界面抽象元素和实体元素以及映射关系的形式化描述,同时建立了Focus+Context交互循环机制.最后,给出了应用于经典Focus+Context及鱼眼数学模型的描述,表明文中提出方法具有很好的兼容性描述能力;同时,给出了面向文件系统主题聚集的语义Focus+Context应用,给出了基于主题语义关注度与嵌套圆鱼眼视图的动态可视化实例,应用实例表明文中提出技术能够有效支持用户在信息可视化界面中对大规模信息进行智能化的可视化和交互探索. 展开更多
关键词 信息可视化 人机交互 用户界面 焦点+上下文 大数据 可视分析
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基于NoSQL的RDF数据存储与查询技术综述 被引量:22
4
作者 王林彬 黎建辉 沈志宏 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2015年第5期1281-1286,共6页
随着语义网的发展和RDF(resource description framework,资源描述框架)数据量的快速增长,利用NoSQL数据库存储和管理大规模RDF数据已经成为了当前的研究热点。介绍了No SQL数据库的种类划分和各类型特点,阐述了RDF数据在各类No SQL数... 随着语义网的发展和RDF(resource description framework,资源描述框架)数据量的快速增长,利用NoSQL数据库存储和管理大规模RDF数据已经成为了当前的研究热点。介绍了No SQL数据库的种类划分和各类型特点,阐述了RDF数据在各类No SQL数据库中存储结构设计和并行查询算法的研究现状,分析比较了不同方法的优缺点。最后,讨论了利用No SQL数据库管理RDF的优势,总结了现有研究的不足之处,并展望了未来的研究方向。 展开更多
关键词 资源描述框架 NOSQL数据库 数据模型 存储结构设计 RDF并行查询算法
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基于BLAST的数据清洗与质量控制方案 被引量:1
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作者 刘奇 孟珍 +5 位作者 刘勇 董慧 林小光 杲艳平 周园春 黎建辉 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期73-75,共3页
研究基本局部比对搜索工具(BLAST)在陆地植物系统发育平台中的应用。数据清洗方面结合基于基因注释的数据抽提与基于BLAST的相似性比对抽提,提取过滤相关的序列信息,控制序列质量,并剔除原始基因注释错误的序列。自测序列质量控制方面... 研究基本局部比对搜索工具(BLAST)在陆地植物系统发育平台中的应用。数据清洗方面结合基于基因注释的数据抽提与基于BLAST的相似性比对抽提,提取过滤相关的序列信息,控制序列质量,并剔除原始基因注释错误的序列。自测序列质量控制方面结合基于blastn的打分比对和基于blastp的模板比对,报告序列整体质量,控制污染序列和假基因的入库。 展开更多
关键词 序列比对 数据清洗 基本局部比对搜索工具 陆地植物系统发育平台
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一种大规模时空数据处理与可视化平台 被引量:1
6
作者 杜一 郭旦怀 +1 位作者 周园春 黎建辉 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2014年第S2期10-17,共8页
当前大多数时空数据处理与可视化工具在数据规模增大时不能够对数据进行快速地处理与可视化.为解决该问题,通过对任务模型、数据模型及可视映射策略的重新定义,给出一种大规模时空数据处理与可视化平台.平台能够支持多种不同类型的时空... 当前大多数时空数据处理与可视化工具在数据规模增大时不能够对数据进行快速地处理与可视化.为解决该问题,通过对任务模型、数据模型及可视映射策略的重新定义,给出一种大规模时空数据处理与可视化平台.平台能够支持多种不同类型的时空数据,通过分布式的数据存储、数据重新组织、分布式检索、空间索引、分段预取等技术,能够实现大规模数据的快速处理与可视化. 展开更多
关键词 大数据 时空数据处理 时空数据可视化 软件架构 模型驱动的架构
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支持向量机理论及算法研究综述 被引量:225
7
作者 汪海燕 黎建辉 杨风雷 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2014年第5期1281-1286,共6页
介绍了SVM的理论基础和它的多种主要算法及这些算法的利弊与发展现状,并介绍了SVM在现实生活中的应用原理及应用现状。最后分析了SVM在发展中的不足之处,指出了其研究方向及前景,并提出在分布式支持向量机这个方向上可以进行更深层次的... 介绍了SVM的理论基础和它的多种主要算法及这些算法的利弊与发展现状,并介绍了SVM在现实生活中的应用原理及应用现状。最后分析了SVM在发展中的不足之处,指出了其研究方向及前景,并提出在分布式支持向量机这个方向上可以进行更深层次的研究。 展开更多
关键词 支持向量机 统计学习理论 训练算法 模糊支持向量机 多分类支持向量机 模式识别
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一种模型驱动的可视化生成系统 被引量:12
8
作者 杜一 郭旦怀 +2 位作者 陈昕 任磊 戴国忠 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2016年第5期1199-1211,共13页
随着可视化与可视分析需求的增加,可视化开发所需的总成本不断提高.模型驱动的开发方法能够提高软件开发的效率,但在可视化开发中并没有发挥应有的作用.在此背景下,给出DVDL(data visualization description language)——一种模块化、... 随着可视化与可视分析需求的增加,可视化开发所需的总成本不断提高.模型驱动的开发方法能够提高软件开发的效率,但在可视化开发中并没有发挥应有的作用.在此背景下,给出DVDL(data visualization description language)——一种模块化、层次化描述的可视化描述语言,利用DVDL可以对组成可视化的各个部分进行不同抽象层次上的描述.在DVDL基础上,给出一种模型驱动的可视化生成系统DVIZ(data visualization).该系统通过数据源选择、可视化配置、发布与分享这3个步骤以及所见即所得的配置,实现可视化的快速生成;系统支持多可视化图形之间的交互与关联配置;并且该系统基于Web开发,支持多种社交平台,易于分享与传播. 展开更多
关键词 可视化系统 用户界面描述语言 模型驱动的开发方法 最终用户编程
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E-UIDL用户界面描述语言下的开发方法 被引量:3
9
作者 杜一 田丰 戴国忠 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2015年第7期1772-1784,共13页
当前的用户界面开发过程需要产品经理、交互设计师、视觉设计师及用户界面开发工程师等多个角色的共同参与,各个角色的分工越来越细致,并且不同的角色在开发过程中使用的工具各不相同,这导致了界面开发过程中沟通成本的增加以及工作效... 当前的用户界面开发过程需要产品经理、交互设计师、视觉设计师及用户界面开发工程师等多个角色的共同参与,各个角色的分工越来越细致,并且不同的角色在开发过程中使用的工具各不相同,这导致了界面开发过程中沟通成本的增加以及工作效率的降低.介绍了一种基于用户界面描述语言的开发方法,该方法能够降低用户界面开发过程中不同角色之间的沟通成本及转换成本,提高用户界面开发的效率.首先介绍E-UIDL(extensible user interface description language)——一种新的用户界面描述语言,并在此基础上设计了基于E-UIDL的开发方法及辅助开发工具,最后,通过实例介绍了利用基于E-UIDL的开发工具进行界面开发的过程,证明了基于用户界面描述语言的开发方法的可行性及优势. 展开更多
关键词 界面描述语言 交互技术 用户界面开发方法 计算机辅助设计
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陆地植物系统发育研究的工作平台构建 被引量:1
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作者 孟珍 陈之端 +7 位作者 黎建辉 刘红梅 何星 林小光 张寿洲 李勇 胡良霖 周园春 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2010年第20期272-274,共3页
在讨论利用基因和基因组信息构建生命之树的历史推进、有效策略和方法的基础上,针对生命之树的建设进行业务流程和应用设计分析,构建面向陆地植物的系统发育平台。平台实现基因数据从国际数据库的自动获取、清洗与自测数据的提交、整理... 在讨论利用基因和基因组信息构建生命之树的历史推进、有效策略和方法的基础上,针对生命之树的建设进行业务流程和应用设计分析,构建面向陆地植物的系统发育平台。平台实现基因数据从国际数据库的自动获取、清洗与自测数据的提交、整理功能,给出系统树的流程化构建,整合数据抽提、多重序列比对、编辑清洗、分模型构树、组装评估、可视化编辑等系列分析算法和模型,经若干交互界面,得到系统树的自动生成、辅助实验决策。 展开更多
关键词 系统发育 生命之树 数据抽提 自动建树
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