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题名基于SSR标记的青藏高原野生大颖草遗传多样性分析
被引量：1
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作者
钟怡均
陈文杰
刘瑞娟
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机构
中国科学院西北高原生物研究所中国科学院高原生物适应与进化重点实验室/青海省作物分子育种重点实验室/青藏高原作物种质资源研究与利用实验室
中国科学院大学生命科学学院
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出处
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2024年第9期15-22,共8页
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基金
青海省应用基础研究项目(2021-ZJ-725)
西宁市重大科技专项(2023-Z-13)。
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文摘
大颖草是分布在青藏高原且适应沙生和高寒环境的一种多年生禾草,对其进行遗传多样性评估是种质资源利用的前提,但目前其在居群水平的遗传多样性仍不清楚。本研究应用SSR标记对4个代表性生境下大颖草居群的55份材料进行了遗传多样性分析。结果表明,4个居群的平均等位基因数、有效等位基因数、香农信息指数和遗传多样性指数分别为1.3750、1.1685、0.1624和0.1042,指示大颖草遗传多样性偏低。4个居群之间的遗传多样性存在差异,其中,GN居群最高,YS居群最低。有70.21%的遗传变异存在于居群内不同个体间,说明居群内变异可以作为遗传多样性主要来源。群体基因流为1.1783,说明居群间存在一定的基因流能有效抑制种群间的遗传分化。UPGMA和群体遗传结构分析结果显示,55份大颖草材料被划分为7个亚群,并与其地理分布具有一定的相关性。本研究初步获得了大颖草居群水平遗传多样性信息,为今后大颖草种质资源的保护及利用提供参考。
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关键词
大颖草
遗传多样性
SSR标记
群体结构
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Keywords
Kengyilia grandiglumis
Genetic diversity
SSR markers
Population structure
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分类号
S543.9
[农业科学—作物学]
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题名大颖草和短芒披碱草的染色体FISH分析
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作者
刘瑞娟
陈文杰
蒋礼玲
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机构
中国科学院西北高原生物研究所/中国科学院高原生物适应与进化重点实验室/青海省作物分子育种重点实验室/青藏高原作物种质资源研究与利用实验室
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出处
《草业科学》
2025年第2期371-377,共7页
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基金
青海省应用基础研究项目(2021-ZJ-725)
农业农村部农业资源环境保护项目(125A0605)。
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文摘
大颖草(Kengyilia grandiglumis)和短芒披碱草(Elymus breviaristatus)是分布在青藏高原沙生环境中的两种多年生禾草。本研究采用顺序荧光原位杂交(FISH)和基因组原位杂交(GISH)技术,应用转座子探针S5和串联重复序列探针AAG对两禾草根尖有丝分裂中期的染色体进行了分析。结果显示,GISH信号可成功区分P、H、St和Y 4个亚基因组,在此基础上获得了S5和AAG探针在两种植物21对染色体上的分布信息。大颖草中S5信号多分布在端粒及近端粒区,P亚基因组中分布位点最多;AAG信号多分布在近着丝粒区和近端粒区,Y亚基因组中分布的位点最多。短芒披碱草中S5信号分布在端粒、近端粒区、近着丝粒区和臂中部区,H亚基因组上信号比St和Y亚基因组丰富;AAG信号分布在近着丝粒区、臂中部区和近端粒区,信号分布位点在St亚基因组中最少。本研究获得了两种异源六倍体禾草亚基因组水平的染色体信号特征,为大颖草和短芒披碱草种质资源的评价及利用奠定了基础。
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关键词
禾草
转座子探针
串联重复探针
异源六倍体
基因组原位杂交
亚基因组
沙生植物
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Keywords
grass
transposable elements probe
tandem repeat probe
allohexaploid
genomic in situ hybridization
subgenome
psammophyte
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分类号
S543.9
[农业科学]
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