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中蜂囊状幼虫病毒结构蛋白预测与鉴定
被引量：
4
1
作者
马鸣潇
马臣
+3 位作者
程健
谢振声
李明
费东亮
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第8期1768-1773,共6页
采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法、生物信息学软件和质谱分析对中蜂囊状幼虫病毒(CSBV)辽宁株(CSBV-LN)全基因组进行了分子克隆、序列测定、分子生物学特性分析及结构蛋白预测和鉴定.结果表明,CSBV-LN全基因组序列长度为8863个核苷...
采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法、生物信息学软件和质谱分析对中蜂囊状幼虫病毒(CSBV)辽宁株(CSBV-LN)全基因组进行了分子克隆、序列测定、分子生物学特性分析及结构蛋白预测和鉴定.结果表明,CSBV-LN全基因组序列长度为8863个核苷酸,编码一个大的开放阅读框,其中包括178 nt的5'非编码区的前导序列和79 nt的3'非编码区,后面跟着一个poly(A)的尾巴.通过软件分析表明,CSBV-LN蛋白序列类似于哺乳动物的小RNA病毒蛋白序列,预计存在VP1,VP2,VP3和VP4等4个小的结构蛋白;系统进化分析表明,CSBV、囊状幼虫病毒(SBV)和残翅病毒(DWV)的起源相同,推测CSBV有着类似DWV的结构蛋白序列5'-VP2-VP4VP1VP3-3.基于此,根据PAGE蛋白条带的大小,利用NetPicoRNA软件预测结构蛋白的裂解位点.在此基础上,对纯化后的CSBV进行SDS-PAGE分离,对分离到的4个蛋白进行质谱分析,结果鉴定出VP1,VP3和VP0 3个蛋白.
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关键词
中蜂囊状幼虫病毒
反转录聚合酶链反应
结构蛋白
质谱分析
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职称材料
题名
中蜂囊状幼虫病毒结构蛋白预测与鉴定
被引量：
4
1
作者
马鸣潇
马臣
程健
谢振声
李明
费东亮
机构
辽宁医
学院
实验动物中心
赤峰市翁牛特旗中蒙医院
中国科学院生物物理研究所蛋白质组学平台
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第8期1768-1773,共6页
基金
国家自然科学基金(批准号:30972200)
辽宁省教育厅项目(批准号:2009A464)资助
文摘
采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法、生物信息学软件和质谱分析对中蜂囊状幼虫病毒(CSBV)辽宁株(CSBV-LN)全基因组进行了分子克隆、序列测定、分子生物学特性分析及结构蛋白预测和鉴定.结果表明,CSBV-LN全基因组序列长度为8863个核苷酸,编码一个大的开放阅读框,其中包括178 nt的5'非编码区的前导序列和79 nt的3'非编码区,后面跟着一个poly(A)的尾巴.通过软件分析表明,CSBV-LN蛋白序列类似于哺乳动物的小RNA病毒蛋白序列,预计存在VP1,VP2,VP3和VP4等4个小的结构蛋白;系统进化分析表明,CSBV、囊状幼虫病毒(SBV)和残翅病毒(DWV)的起源相同,推测CSBV有着类似DWV的结构蛋白序列5'-VP2-VP4VP1VP3-3.基于此,根据PAGE蛋白条带的大小,利用NetPicoRNA软件预测结构蛋白的裂解位点.在此基础上,对纯化后的CSBV进行SDS-PAGE分离,对分离到的4个蛋白进行质谱分析,结果鉴定出VP1,VP3和VP0 3个蛋白.
关键词
中蜂囊状幼虫病毒
反转录聚合酶链反应
结构蛋白
质谱分析
Keywords
Chinese sacbrood virus（CSBV）
RT-PCR
Structural protein
Mass spectrographic analysis
分类号
O629 [理学—有机化学]
S895.1 [农业科学—特种经济动物饲养]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中蜂囊状幼虫病毒结构蛋白预测与鉴定
马鸣潇
马臣
程健
谢振声
李明
费东亮
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011
4
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