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分子动力学研究F_1-ATP合酶对三磷酸腺苷的稳定和定位作用（英文）被引量：2: 1; 作者伍绍贵高晓彤 +2 位作者李权廖杰徐成刚《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1803-1809,共7页; F1-ATP合酶通过与ATP之间建立广泛的相互作用,实现对ATP的位置进行精确的定位.这些相互作用为ATP的合成/水解创造了稳定的环境.理解这些相互作用是理解ATP的合成/水解机理的基础.我们通过分子动力学模拟方法研究这些相互作用,找出在稳... 展开更多; 关键词 F1-ATP合酶氢键分子动力学突变; 在线阅读下载PDF 职称材料

H(z)数据对相互作用暗能量模型的观测研究被引量：2: 2; 作者潘宇李力 +3 位作者曹硕潘娜娜张益胡紫萱《天文学报》 CSCD 北大核心 2015年第4期317-325,共9页; 结合最新的哈勃参量H(z)观测数据、重子声学振荡(BAO)数据与普朗克卫星观测得到的宇宙微波背景辐射(CMB)数据,利用马尔柯夫链蒙特卡洛算法(MCMC)对一种相互作用暗能量模型进行了观测限制.这3种数据联合限制得到的各参数的最佳拟合值及1... 展开更多; 关键词暗能量宇宙学宇宙学参数观测; 在线阅读下载PDF 职称材料

空间激光干涉引力波探测与早期宇宙结构形成被引量：10: 3; 作者龚雪飞徐生年 +19 位作者袁业飞白姗边星曹周键陈葛锐董鹏高天舒高伟黄双林李玉龙刘影罗子人邵明学孙宝三唐文林于品徐鹏臧云龙张海鹏刘润球《天文学进展》 CSCD 北大核心 2015年第1期59-83,共25页; 空间引力波探测是研究宇宙早期恒星演化和星系形成、黑洞和星系的共同成长等天文学和宇宙学重大问题的一条重要可能途径。经过两期科学院先导科技专项空间科学预研究课题的开展,通过权衡技术的可行性与科学的前瞻性,选择以高红移开始的... 展开更多; 关键词引力波冷暗物质等级结构形成模型中等质量黑洞双黑洞并合; 在线阅读下载PDF 职称材料

碱基对在DNA双螺旋链上分离的自由能计算（英文）: 4; 作者伍绍贵冯丹《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1282-1288,共7页; DNA是大部分生物包括病毒的基因载体。DNA双螺旋链通过A=T和G≡C两种碱基对编码实现对遗传信息的存储。碱基对中的相互作用对DNA双螺旋链的稳定性起到重要作用,直接关系到基因的复制和转录。当前研究中,我们构建了四组不同结构的DNA双... 展开更多; 关键词平均力势氢键分子动力学模拟伞形取样; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名分子动力学研究F_1-ATP合酶对三磷酸腺苷的稳定和定位作用（英文）被引量：2: 1; 作者伍绍贵高晓彤李权廖杰徐成刚; 机构四川师范大学化学与材料科学学院中国科学院理论物理研究所理论物理国家重点实验室; 出处《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1803-1809,共7页; 基金 supported by the National Natural Science Foundation of China(11405113) Science and Technology Plan of Sichuan Province,China(2010JY0122) Science Research Fund of Sichuan Normal University,China(10MSL02)~~; 文摘 F1-ATP合酶通过与ATP之间建立广泛的相互作用,实现对ATP的位置进行精确的定位.这些相互作用为ATP的合成/水解创造了稳定的环境.理解这些相互作用是理解ATP的合成/水解机理的基础.我们通过分子动力学模拟方法研究这些相互作用,找出在稳定化过程中起到重要作用的残基.通过检测ATP和F1-ATP合酶之间的非键相互作用,发现残基段158–164所形成的loop区域及残基R189,Y345对ATP存在显著相互作用.其中,该loop区域对ATP的三磷酸部分形成一个半包围结构,封闭活性位点区域,并通过氢键网络约束ATP三磷酸的运动,为ATP合成/水解创造稳定的环境.此外,关键残基Y345通过π–π叠加相互作用对ATP的碱基进行约束,但是ATP的碱基可以在平行于Y345芳香环的平面内进行滑动,我们推断这种滑动运动有利于促进ATP的水解.; 关键词 F1-ATP合酶氢键分子动力学突变; Keywords F1-ATPase Hydrogen bond Molecular dynamics Mutation; 分类号 O629 [理学—有机化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名H(z)数据对相互作用暗能量模型的观测研究被引量：2: 2; 作者潘宇李力曹硕潘娜娜张益胡紫萱; 机构重庆邮电大学理学院中国科学院理论物理研究所理论物理国家重点实验室北京师范大学天文系; 出处《天文学报》 CSCD 北大核心 2015年第4期317-325,共9页; 基金国家自然科学基金项目(11005164 11447213) +4 种基金 A2014-43) 中国博士后科学基金面上资助项目(2014M550642)资助; 文摘结合最新的哈勃参量H(z)观测数据、重子声学振荡(BAO)数据与普朗克卫星观测得到的宇宙微波背景辐射(CMB)数据,利用马尔柯夫链蒙特卡洛算法(MCMC)对一种相互作用暗能量模型进行了观测限制.这3种数据联合限制得到的各参数的最佳拟合值及1σ误差范围分别为:物质能量密度参数?m=0.266+0.028-0.028,相互作用因子γ=0.090+0.100-0.098,暗能量状态方程参数wX=-1.307+0.263-0.269,哈勃常数H0=74.20+4.66-4.56.相互作用耦合参数γ>0表明能量正在从暗物质转移到暗能量.然而,宇宙学常数模型中的巧合性问题在1σ误差范围内依然可以轻微缓解.为了更好地做出比较,还利用BAO+CMB组合数据及单独的H(z)数据对该模型进行了考察,得到的结果如下:(1)H(z)数据能对相互作用参数γ给出更好的限制结果;(2)ΛCDM模型仍然是与观测数据符合得最好的模型,耦合参数γ与其它模型参数(?m,H0)相互关联;(3)在考虑了暗能量与暗物质间的相互作用之后,超新星局域距离阶梯测量与普朗克观测对H0限制结果的冲突问题能够得到一定程度的缓解.; 关键词暗能量宇宙学宇宙学参数观测; Keywords cosmology dark energy, cosmology cosmological parameters, cosmology observations; 分类号 P159 [天文地球—天文学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名空间激光干涉引力波探测与早期宇宙结构形成被引量：10: 3; 作者龚雪飞徐生年袁业飞白姗边星曹周键陈葛锐董鹏高天舒高伟黄双林李玉龙刘影罗子人邵明学孙宝三唐文林于品徐鹏臧云龙张海鹏刘润球; 机构中国科学院数学与系统科学研究院中国科学技术大学天文学系 Theoretisch-Physikalisches Institut 中国科学院大学中国科学院数学与系统科学研究院计算数学国家重点实验室中国科学院理论物理研究所理论物理国家重点实验室北京工业大学应用数理学院中国科学院晨兴数学中心首都师范大学数学系河南大学数学系中国科学院力学研究所河南理工大学华中科学技术大学理学院清华大学数学科学中心中国科学院理论物理研究所; 出处《天文学进展》 CSCD 北大核心 2015年第1期59-83,共25页; 基金中国科学院战略性先导科技专项"空间科学预先研究项目"课题(XDA04070400) 国家自然科学基金(11305255 +3 种基金 11171329) 海洋公益性行业专项(201105032) 理论物理国家重点实验室开放课题(Y3KF281CJ1); 文摘空间引力波探测是研究宇宙早期恒星演化和星系形成、黑洞和星系的共同成长等天文学和宇宙学重大问题的一条重要可能途径。经过两期科学院先导科技专项空间科学预研究课题的开展,通过权衡技术的可行性与科学的前瞻性,选择以高红移开始的中至大质量双黑洞并合系统、星团等稠密动力学环境中涉及中等质量黑洞的双黑洞引力波波源为主要科学目标,给出了我国毫赫兹至赫兹频段空间引力波探测任务计划的初步设计。以该任务设计建议为依据,简要介绍空间引力波探测及其作为一种新的天文观测手段的科学内涵,以及我国空间引力波探测任务设计的科学目标和探测潜力。; 关键词引力波冷暗物质等级结构形成模型中等质量黑洞双黑洞并合; Keywords gravitational wave ACDM hierarchical structure formation picture interme- diate mass black hole binary black hole coalescence; 分类号 P142.84 [天文地球—天体物理]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名碱基对在DNA双螺旋链上分离的自由能计算（英文）: 4; 作者伍绍贵冯丹; 机构四川师范大学化学与材料科学学院中国科学院理论物理研究所; 出处《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1282-1288,共7页; 基金 supported by the National Natural Science Foundation of China(11405113) Science and Technology Plan of Sichuan Province +2 种基金 China(2010JY0122) China(10MSL02); 文摘 DNA是大部分生物包括病毒的基因载体。DNA双螺旋链通过A=T和G≡C两种碱基对编码实现对遗传信息的存储。碱基对中的相互作用对DNA双螺旋链的稳定性起到重要作用,直接关系到基因的复制和转录。当前研究中,我们构建了四组不同结构的DNA双螺旋链,进行了总共4.3μs的分子动力学模拟。通过伞形取样技术计算了DNA双螺旋链中碱基对分离的自由能曲线,并从分子尺度细节和相互作用能对自由能曲线进行解析。在碱基对G≡C的自由能曲线(PMF-PGC)上观察到三个峰,通过监测氢键数目的变化发现分别对应于G≡C三个氢键的断裂;而在A=T的自由能曲线(PMF-PAT)上只出现一个峰,说明A=T的两个氢键在分离过程中几乎同时断裂。PMF-PGC的总能垒比PMF-PAT高,主要是因为G≡C比A=T多一个氢键,更稳定。两条曲线的后段自由能仍然升高,而此时碱基对的氢键已断裂,这是DNA链骨架刚性所导致。我们还研究了碱基对稳定性受相邻碱基对的影响,发现邻近G≡C碱基对会增强A=T的稳定性,C≡G会削弱A=T的稳定性,T=A对A=T的影响较小。; 关键词平均力势氢键分子动力学模拟伞形取样; Keywords Potential of mean force Hydrogen bond Molecular dynamics simulation Umbrella sampling; 分类号 Q503 [生物学—生物化学] O641.3 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	分子动力学研究F_1-ATP合酶对三磷酸腺苷的稳定和定位作用（英文）	伍绍贵高晓彤李权廖杰徐成刚	《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2015	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	H(z)数据对相互作用暗能量模型的观测研究	潘宇李力曹硕潘娜娜张益胡紫萱	《天文学报》 CSCD 北大核心	2015	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	空间激光干涉引力波探测与早期宇宙结构形成	龚雪飞徐生年袁业飞白姗边星曹周键陈葛锐董鹏高天舒高伟黄双林李玉龙刘影罗子人邵明学孙宝三唐文林于品徐鹏臧云龙张海鹏刘润球	《天文学进展》 CSCD 北大核心	2015	10	在线阅读下载PDF 职称材料
4	碱基对在DNA双螺旋链上分离的自由能计算（英文）	伍绍贵冯丹	《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2016	0	在线阅读下载PDF 职称材料